Signaling pathways involving nuclea

Signaling pathways involving nuclear receptors (NRs), their ligands and coregulators, regulate tissue-specific transcriptomes in diverse processes, including development, metabolism, reproduction, the immune response and neuronal function, as well as in their associated pathologies. The Nuclear Receptor Signaling Atlas (NURSA) is a Consortium focused around a Hub website (www.nursa.org) that annotates and integrates diverse 'omics datasets originating from the published literature and NURSA-funded Data Source Projects (NDSPs). These datasets are then exposed to the scientific community on an Open Access basis through user-friendly data browsing and search interfaces. Here, we describe the redesign of the Hub, version 3.0, to deploy "Web 2.0" technologies and add richer, more diverse content. The Molecule Pages, which aggregate information relevant to NR signaling pathways from myriad external databases, have been enhanced to include resources for basic scientists, such as post-translational modification sites and targeting miRNAs, and for clinicians, such as clinical trials. A portal to NURSA's Open Access, PubMed-indexed journal Nuclear Receptor Signaling has been added to facilitate manuscript submissions. Datasets and information on reagents generated by NDSPs are available, as is information concerning periodic new NDSP funding solicitations. Finally, the new website integrates the Transcriptomine analysis tool, which allows for mining of millions of richly annotated public transcriptomic data points in the field, providing an environment for dataset re-use and citation, bench data validation and hypothesis generation. We anticipate that this new release of the NURSA database will have tangible, long term benefits for both basic and clinical research in this field.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตามปกติหลักเกี่ยวข้องกับนิวเคลียร์ receptors (NRs), coregulators และ ligands พวกควบคุม transcriptomes เนื้อเยื่อเฉพาะ ใน กระบวนความหลากหลาย การพัฒนา เผาผลาญ ทำซ้ำ การตอบสนองภูมิคุ้มกัน และ ฟังก์ชัน neuronal รวม ทั้ง ใน pathologies ของพวกเขาเกี่ยวข้อง การนิวเคลียร์ตัวรับสัญญาณแอตลาส (NURSA) เป็นองค์กรกันเองเว็บไซต์ฮับ (www.nursa.org) ที่ annotates และรวมหลากหลาย ' datasets รุ่นที่มาจากเอกสารประกอบการเผยแพร่และได้รับการสนับสนุน NURSA ข้อมูลแหล่งที่มาโครงการ (NDSPs) Datasets เหล่านี้โดยทั่วไปแล้วสัมผัสกับชุมชนทางวิทยาศาสตร์บนพื้นฐานการเปิดการเข้าถึงผ่านอินเทอร์เฟซการเรียกดูและค้นหาข้อมูลง่าย ที่นี่ เราอธิบายออกแบบของฮับ รุ่น 3.0 การปรับใช้เทคโนโลยี "Web 2.0" และเพิ่มเนื้อหายิ่งขึ้น มีความหลากหลายมากขึ้น โมเลกุลหน้า ซึ่งรวมข้อมูลที่เกี่ยวข้อง กับ NR ตามปกติมนต์จากฐานข้อมูลภายนอกที่พัก ได้ถูกปรับปรุงเพื่อรวมทรัพยากรสำหรับนักวิทยาศาสตร์พื้นฐาน post-translational ปรับเปลี่ยนเว็บไซต์ และการกำหนดเป้าหมาย miRNAs และ clinicians เช่นการทดลองทางคลินิก มีการเพิ่มเว็บไซต์ของ NURSA เปิดเข้า สมุดดัชนี PubMed นิวเคลียร์ตัวรับสัญญาณเพื่อส่งฉบับ Datasets และข้อมูล reagents สร้าง โดย NDSPs มี เป็นข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับ NDSP ใหม่ประจำงวดทุน solicitations ในที่สุด เว็บไซต์ใหม่รวม Transcriptomine วิเคราะห์นั้น ซึ่งช่วยให้การทำเหมืองแร่ของล้านของสาธารณะ transcriptomic ประกอบมั่งคั่งจุดข้อมูลในฟิลด์ ให้สภาพแวดล้อมการใช้ชุดข้อมูลอ้างอิง สอบผู้พิพากษา และสร้างสมมติฐาน เราคาดว่า รุ่นใหม่นี้ของฐานข้อมูล NURSA จะมีประโยชน์ในระยะยาว จับสำหรับงานวิจัยพื้นฐาน และคลินิกในฟิลด์นี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เส้นทางการส่งสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับผู้รับนิวเคลียร์ (NRs) แกนด์และ coregulators ของพวกเขาควบคุมรานเนื้อเยื่อเฉพาะในกระบวนการที่มีความหลากหลายรวมทั้งการพัฒนา, การเผาผลาญอาหารการสืบพันธุ์การตอบสนองของภูมิคุ้มกันและการทำงานของเส้นประสาทเช่นเดียวกับในโรคที่เกี่ยวข้อง นิวเคลียร์ตัวรับสัญญาณ Atlas (NURSA) เป็นสมาคมที่มุ่งเน้นไปรอบ ๆ เว็บไซต์ Hub (www.nursa.org) ที่ annotates และบูรณาการชุดข้อมูลที่มีความหลากหลาย 'omics ที่มาจากวรรณกรรมที่ตีพิมพ์และ NURSA ได้รับการสนับสนุนโครงการแหล่งข้อมูล (NDSPs) ชุดข้อมูลเหล่านี้จะถูกสัมผัสจากนั้นไปที่ชุมชนวิทยาศาสตร์บนพื้นฐานการเข้าถึงเปิดผ่านการเรียกดูข้อมูลที่ใช้งานง่ายและอินเตอร์เฟซการค้นหา ที่นี่เราจะอธิบายการออกแบบของฮับรุ่น 3.0 ในการปรับใช้ "Web 2.0" เทคโนโลยีที่ดียิ่งขึ้นและเพิ่มเนื้อหาที่หลากหลายมากขึ้น หน้าโมเลกุลซึ่งข้อมูลโดยรวมที่เกี่ยวข้องกับการส่งสัญญาณทางเดิน NR จากฐานข้อมูลภายนอกมากมายได้รับการปรับปรุงเพื่อรวมแหล่งข้อมูลสำหรับนักวิทยาศาสตร์พื้นฐานเช่นการปรับเปลี่ยนเว็บไซต์ที่โพสต์แปลและการกำหนดเป้​​าหมาย miRNAs และสำหรับแพทย์เช่นการทดลองทางคลินิก พอร์ทัลเพื่อ NURSA เปิดการเข้าถึง PubMed การจัดทำดัชนีวารสารนิวเคลียร์ตัวรับส่งสัญญาณได้รับการเพิ่มความสะดวกในการส่งต้นฉบับ ชุดข้อมูลและข้อมูลเกี่ยวกับสารเคมีที่สร้างขึ้นโดย NDSPs ที่มีอยู่เช่นเดียวกับข้อมูลเกี่ยวกับระยะ NDSP ใหม​​่ชักชวนระดมทุน ในที่สุดเว็บไซต์ใหม่รวมเครื่องมือในการวิเคราะห์ Transcriptomine ซึ่งจะช่วยให้สำหรับการทำเหมืองล้านของประชาชนข้อเขียนมั่งคั่งจุดข้อมูล transcriptomic ในสาขาที่ให้สภาพแวดล้อมสำหรับชุดข้อมูลกลับมาใช้อ้างอิงและการตรวจสอบข้อมูลและการสร้างม้านั่งสมมติฐาน เราคาดหวังว่าการเปิดตัวใหม่นี้ของฐานข้อมูล NURSA จะมีที่จับต้องได้ประโยชน์ในระยะยาวสำหรับการวิจัยทั้งพื้นฐานและคลินิกในสาขานี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่เกี่ยวข้องกับตัวรับสัญญาณเซลล์นิวเคลียร์ ( ข้าง ) ของลิแกนด์และ coregulators ควบคุม tissue-specific transcriptomes ในกระบวนการที่หลากหลาย รวมถึง การพัฒนา , การเผาผลาญอาหาร การสืบพันธุ์ การตอบสนองของภูมิคุ้มกันและการทำงานของเซลล์ประสาทเช่นเดียวกับในโรคที่เกี่ยวข้องของพวกเขา ตัวรับส่งสัญญาณนิวเคลียร์ Atlas ( nursa ) เป็นสมาคมที่เน้นรอบเว็บไซต์ฮับ ( www.nursa .org ) ที่ annotates และบูรณาการหลากหลายวิชา ' ข้อมูลที่มาจากแหล่งข้อมูลตีพิมพ์วรรณกรรมและ nursa สนับสนุนโครงการ ( ndsps ) ข้อมูลเหล่านี้มีจุดมุ่งหมายเพื่อชุมชนวิทยาศาสตร์บนพื้นฐานการเข้าถึงข้อมูลและการเรียกดูง่ายเปิดผ่านอินเตอร์เฟซการค้นหา ที่นี่เราจะอธิบายการออกแบบฮับ , รุ่น 3.0 , การปรับใช้ " เว็บ 2.0 " เทคโนโลยีและเพิ่มเพหลากหลายมากขึ้นในเนื้อหา โมเลกุลหน้า ซึ่งการรวมข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับ NR สัญญาณเซลล์จากฐานข้อมูลภายนอกมากมาย ได้รับการปรับปรุงเพื่อรวมทรัพยากรสำหรับนักวิทยาศาสตร์พื้นฐาน เช่น การไปรษณีย์ - แปลเว็บไซต์และเป้าหมาย mirnas และวัด เช่น การทดลองทางคลินิก พอร์ทัล nursa เปิดเข้าPubMed ดัชนีวารสารนิวเคลียร์ตัวรับสัญญาณได้รับการเพิ่มความสะดวกในการส่งต้นฉบับ ข้อมูลและข้อมูลเกี่ยวกับสารเคมีที่สร้างขึ้นโดย ndsps ที่มีอยู่เป็นข้อมูลเกี่ยวกับตารางธาตุใหม่ ndsp ทุนการชักชวน . ในที่สุดเว็บไซต์ใหม่รวม transcriptomine การวิเคราะห์เครื่องมือซึ่งช่วยให้การทำเหมืองล้านมั่งคั่งแสดงสาธารณะ transcriptomic จุดข้อมูลในฟิลด์ที่ให้สภาพแวดล้อมสำหรับการใช้ข้อมูล และการตรวจสอบข้อมูลและการสร้างสมมติฐานที่ม้านั่ง เราคาดหวังว่ารุ่นนี้ของ nursa ฐานข้อมูลจะได้ประโยชน์ในระยะยาวทั้งพื้นฐานและการวิจัยทางคลินิกในสาขานี้