2.6. Molecular identification and p

2.6. Molecular identification and phylogenetic analysis
The amplification of DNA fragments was done by modified method of Iwamoto et al. (2002).
Fungal spores were centrifuged at 13,000 ×g for 5 min and 1 μl of supernatantwas used as template for amplification
along with (give expansion) ITS5 primer pair (O'Donnell, 1992; White et al., 1990). The PCR conditions were as follows: initial denaturation at 95 °C for 15 min; followed by 45 cycles of denaturation at 94 °C for 20 s, annealing at 55 °C for 1 min, extension at 72 °C for 50 s; and final extension at 72 °C for 10 min. The DNA sequences from both strands
were read on an ABI PRISM377DNA sequencer. The homology of the sequences was analyzed using BLAST algorithm (http://www.ncbi.nlm.
nih.gov) and was aligned with reference taxa along with their GenBank
accession numbers using ClustalW implemented in MEGA5 software
(Tamura et al., 2011).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.6. โมเลกุลรหัสและวิเคราะห์ phylogeneticขยายของชิ้นส่วนดีเอ็นเอได้โดยวิธีการปรับเปลี่ยนของ Iwamoto et al. (2002) เชื้อราเพาะเฟิร์นถูก centrifuged ที่ 13000 ซื้อ g 5 นาทีและ 1 μl ของ supernatantwas ที่ใช้เป็นต้นแบบสำหรับขยายพร้อมกับคู่รองพื้น ITS5 (ให้ขยาย) (O'Donnell, 1992 สีขาวและ al., 1990) เงื่อนไข PCR มีดังนี้: denaturation เริ่มต้นที่ 95 ° C สำหรับ 15 นาที ตามวงจร 45 การ denaturation ที่ 94 ° C สำหรับ 20 s การอบเหนียวที่ 55 องศาเซลเซียสใน 1 นาที 72 ° C สำหรับ 50 s และสุดท้ายขยายที่ 72 ° C สำหรับ 10 นาที ลำดับดีเอ็นเอจากทั้งสองได้อ่านบน sequencer การลักชัวรี่ PRISM377DNA Homology ลำดับถูกวิเคราะห์โดยใช้อัลกอริทึมระเบิด (ส่วน http://www.ncbi.nlmnih.gov ที่) และไม่สอดคล้องกับ taxa อ้างอิงกับของ GenBankหมายเลขทะเบียนที่ใช้ในซอฟต์แวร์ MEGA5 ClustalW(Tamura et al., 2011)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.6 บัตรประจำตัวโมเลกุลและการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการการขยายของดีเอ็นเอที่ได้รับการทำโดยวิธีการแก้ไขของ Iwamoto et al,
. (2002)
สปอร์เชื้อราถูกหมุนเหวี่ยงที่ 13,000 ×กรัมเป็นเวลา 5 นาทีและ 1 ไมโครลิตรของ supernatantwas
ใช้เป็นแม่แบบสำหรับการขยายพร้อมกับ(ให้การขยายตัว) คู่ไพรเมอร์ ITS5 (ดอนเนลล์ 1992; สีขาว, et al, 1990). เงื่อนไข PCR มีดังนี้ denaturation เริ่มต้นที่ 95 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 15 นาที; ตามด้วย 45 รอบของการสูญเสียสภาพธรรมชาติที่ 94 ° C เป็นเวลา 20 วินาที, การอบที่ 55 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาทีส่วนขยายที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 50; และการขยายสุดท้ายที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 10 นาที ลำดับดีเอ็นเอจากเส้นทั้งสองถูกอ่านในซีเควน ABI PRISM377DNA
ที่คล้ายคลึงกันของลำดับได้รับการวิเคราะห์โดยใช้วิธีระเบิด (http:. //www.ncbi.nlm
nih.gov) และสอดคล้องกับแท็กซ่าอ้างอิงของพวกเขาพร้อมกับ GenBank
หมายเลขภาคยานุวัติใช้ ClustalW ดำเนินการในซอฟต์แวร์ MEGA5
(ทามูระ et al, 2011. )

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.5 กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด ( SEM )
L . vannamei เหงือกดำที่เกิดจากเชื้อราบนจานโดยใช้ใบมีดขูด SDA หมันแห้งและเคลือบด้วยทองและมีการปะทุใช้จอล jsm-7401f กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนที่เร่งแรงดัน 15 GB KV ต่ำ2.5 กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด ( SEM )
L . vannamei เหงือกดำที่เกิดจากเชื้อราบนจานโดยใช้ใบมีดขูด SDA หมันแห้งและเคลือบด้วยทองและมีการปะทุใช้จอล jsm-7401f กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนที่เร่งแรงดัน 15 GB KV ต่ำ2.5 กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด ( SEM )
L . vannamei เหงือกดำที่เกิดจากเชื้อราบนจานโดยใช้ใบมีดขูด SDA หมันแห้งและเคลือบด้วยทองและมีการปะทุใช้จอล jsm-7401f กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนที่เร่งแรงดัน 15 GB KV ต่ำ