Background: Identification of poten

Background: Identification of potential T-cell epitopes in the
peanut major allergens is essential for development of peptidebased
immunotherapy. Traditional methods of T-cell epitope
discovery use overlapping short peptides spanning the full
length of the protein in T-cell proliferation assays. Because large
proteins, such as Ara h 1, require a large number of peptides,
this limits screening to a small number of allergic subject–
derived T-cell lines.
Objective: We sought to identify candidate peptides of Ara h 1
that display promiscuous binding to MHC class II and induce
TH2 cytokine production by T cells.
Methods: In silicoMHCclass II binding predictionwas performed
with NetMHCIIpan 2.0 (peptide length, 15; 1-mer offset) and the
most abundant class II alleles in the North American population
andwith an in vitroMHCclass II peptide reporter assay performed
in parallel, which used synthetic 15-mer peptides offset by 5 mer
spanning the protein.High-resolutionMHCclass II typing and aTcell
proliferation assay using preselected peptides were performed
with PBMCs from 98 subjects with peanut allergy and 14 healthy
control subjects. IL-4, IL-13, IL-5, IFN-g, and TNF-a levels were
measured in culture supernatants.
Results: Thirty-six Ara h 1 peptides were identified by using in
silico predictions and MHC class II binding assays. In
combination with T-cell proliferation and cytokines secreted in
T-cell assays, we have identified 4 vaccine candidate Ara h 1
peptides.
Conclusions: Preselection of peptides by using in silico and
in vitro approaches in combination with conventional methods
appears to be an effective strategy for identifying peanut T-cell
peptide vaccine candidates. (J Allergy Clin Immunol
2016;137:1764-71.)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: รหัสของ epitopes T เซลล์มีศักยภาพในการสารก่อภูมิแพ้สำคัญถั่วลิสงเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนาของ peptidebasedภูมิคุ้มกัน วิธีการแบบดั้งเดิมของเซลล์ T epitopeค้นพบใช้เปปไทด์สั้นทอดเต็มที่ทับซ้อนความยาวของโปรตีนในเซลล์ T assays แพร่กระจาย เนื่องจากขนาดใหญ่จำนวนมากของเปปไทด์ ต้อง โปรตีนเช่น Ara h 1ขีดจำกัดนี้ได้กับจำนวนของแพ้เรื่อง – การคัดกรองมาบรรทัดทีเซลล์วัตถุประสงค์: เราหาสมัครเปปไทด์ของ Ara h 1ที่แสดงสมบัติผูกเอ็มเอชซีคลาส II และก่อให้เกิดการผลิต cytokine TH2 โดยทีเซลล์วิธีการ: ใน silicoMHCclass II รวม predictionwas การดำเนินการNetMHCIIpan 2.0 (เปปไทด์ยาว 15 ออฟเซ็ตแมร์ 1) และalleles II ระดับอุดมสมบูรณ์มากที่สุดในประชากรสหรัฐอเมริกาเหนือandwith vitroMHCclass ในการที่สองดำเนินการเปปไทด์ reporter assayพร้อมกัน ซึ่งใช้เปปไทด์สังเคราะห์ 15 แมร์แมร์ 5 ออฟเซ็ตซึ่งประกอบไปด้วยโปรตีน พิมพ์ครั้งที่สองสูง resolutionMHCclass และ aTcellดำเนินการทดสอบการแพร่กระจายการใช้เปปไทด์ไว้ล่วงหน้ามี PBMCs จาก 98 วัตถุ ด้วยโรคภูมิแพ้ถั่วลิสงและ 14 มีสุขภาพดีตัวแบบที่ควบคุม IL-4, IL-13, IL-5, IFN-g และ TNF เป็นระดับวัด supernatants วัฒนธรรมผลลัพธ์: เปปไทด์สามสิบหก Ara h 1 ถูกระบุ โดยในคาดคะเนรูปดอกไม้และเอ็มเอชซีคลาส II ผูก assays ในร่วมกับ T เซลล์และไซโตไคน์ที่หลั่งในAssays T เซลล์ เราได้ระบุ 4 วัคซีนผู้สมัคร Ara h 1เปปไทด์สรุป: คัดสรรของเปปไทด์โดยในรูปดอกไม้ และวิธีในหลอดทดลองกับวิธีการแบบเดิมเป็น กลยุทธ์มีประสิทธิภาพสำหรับการระบุถั่วลิสงทีเซลล์เปปไทด์วัคซีนได (J แพ้ Clin Immunol2016; 137:1764-71.)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พื้นหลัง: บัตรประจำตัวที่มีศักยภาพ epitopes T-cell ใน
สารก่อภูมิแพ้ถั่วลิสงที่สำคัญเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนา peptidebased
วัคซีนภูมิแพ้ วิธีการดั้งเดิมของ T-cell epitope
การใช้งานการค้นพบที่ทับซ้อนกันเปปไทด์สั้นทอดเต็ม
ความยาวของโปรตีนใน T-cell การขยายการตรวจ เพราะมีขนาดใหญ่
โปรตีนเช่น Ara เอช 1 ต้องมีจำนวนมากของเปปไทด์
นี้จะ จำกัด การตรวจคัดกรองเป็นจำนวนเล็ก ๆ ของการแพ้ subject-
มาสาย T-cell.
วัตถุประสงค์: เราพยายามที่จะระบุเปปไทด์ที่ผู้สมัครของ Ara เอช 1
ที่แสดงสำส่อนผูกพัน เพื่อ MHC ชั้นสองและเหนี่ยวนำให้เกิด
การผลิตไซโตไคน์ TH2 โดยเซลล์ t.
วิธีการ: ใน silicoMHCclass ครั้งที่สองที่มีผลผูกพัน predictionwas ดำเนินการ
กับ NetMHCIIpan 2.0 (ความยาวเปปไทด์ 15 1-Mer offset) และ
ระดับมากที่สุดครั้งที่สองอัลลีลในภาคเหนือของประชากรอเมริกัน
andwith ใน vitroMHCclass II เปปไทด์นักข่าวทดสอบดำเนินการ
ในแบบคู่ขนานที่ใช้สังเคราะห์เปปไทด์ 15-Mer ชดเชยโดย 5 Mer
ทอดพิมพ์ protein.High-resolutionMHCclass ครั้งที่สองและ aTcell
การขยายการทดสอบโดยใช้เปปไทด์ไว้ล่วงหน้าได้ดำเนินการ
กับ PBMCs จาก 98 วิชาที่มีโรคภูมิแพ้ถั่วลิสงและ 14 มีสุขภาพดี
ควบคุม อาสาสมัคร IL-4, IL-13, IL-5, IFN-G และ TNF-ระดับถูก
วัดใน supernatants วัฒนธรรม.
ผล: สามสิบหก Ara เอช 1 เปปไทด์ที่ถูกระบุโดยใช้ใน
การคาดการณ์และ silico MHC ชั้นสองมีผลผูกพันการตรวจ ใน
การรวมกันกับการขยาย T-cell และ cytokines หลั่งใน
การตรวจ T-cell, เราได้ระบุ 4 วัคซีน Ara เอช 1
เปปไทด์.
สรุปล่วงหน้าของเปปไทด์โดยใช้ใน silico และ
ในหลอดทดลองวิธีการในการรวมกันกับวิธีการเดิม
ที่ดูเหมือนจะเป็นที่มีประสิทธิภาพ กลยุทธ์สำหรับการระบุถั่วลิสง T-cell
เปปไทด์วัคซีน (J Clin ภูมิแพ้ Immunol
2016; 137: 1764-1771.)