Background: Functional genomics has

Background: Functional genomics has particular promise in silkworm biology for identifying genes
involved in a variety of biological functions that include: synthesis and secretion of silk, sex
determination pathways, insect-pathogen interactions, chorionogenesis, molecular clocks. Wild
silkmoths have hardly been the subject of detailed scientific investigations, owing largely to nonavailability
of molecular and genetic data on these species. As a first step, in the present study we
generated large scale expressed sequence tags (EST) in three economically important species of
wild silkmoths. In order to make these resources available for the use of global scientific
community, an EST database called 'WildSilkbase' was developed.
Description: WildSilkbase is a catalogue of ESTs generated from several tissues at different
developmental stages of 3 economically important saturniid silkmoths, an Indian golden silkmoth,
Antheraea assama, an Indian tropical tasar silkmoth, A. mylitta and eri silkmoth, Samia cynthia ricini.
Currently the database is provided with 57,113 ESTs which are clustered and assembled into 4,019
contigs and 10,019 singletons. Data can be browsed and downloaded using a standard web
browser. Users can search the database either by BLAST query, keywords or Gene Ontology
query. There are options to carry out searches for species, tissue and developmental stage specific
ESTs in BLAST page. Other features of the WildSilkbase include cSNP discovery, GO viewer,
homologue finder, SSR finder and links to all other related databases. The WildSilkbase is freely
available from http://www.cdfd.org.in/wildsilkbase/.
Conclusion: A total of 14,038 putative unigenes was identified in 3 species of wild silkmoths.
These genes provide important resources to gain insight into the functional and evolutionary study
of wild silkmoths. We believe that WildSilkbase will be extremely useful for all those researchers
working in the areas of comparative genomics, functional genomics and molecular evolution in
general, and gene discovery, gene organization, transposable elements and genome variability of

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พื้นหลัง: ฟังก์ชั่นการทำงานที่มีสัญญาโดยเฉพาะอย่างยิ่งในทางชีววิทยาไหมสำหรับการระบุยีนที่
มีส่วนร่วมในความหลากหลายของการทำงานทางชีวภาพที่รวมถึงการสังเคราะห์และการหลั่งของผ้าไหม, มีเพศสัมพันธ์
ทางเดินมุ่งมั่นปฏิสัมพันธ์แมลงเชื้อโรค, chorionogenesis นาฬิกาโมเลกุล ป่า
silkmoths แทบจะไม่ได้รับเรื่องของการตรวจสอบทางวิทยาศาสตร์อย่างละเอียดเนื่องจากส่วนใหญ่จะ nonavailability
ของข้อมูลโมเลกุลและพันธุกรรมในสายพันธุ์นี้ เป็นขั้นตอนแรกในการศึกษาในปัจจุบันที่เรา
สร้างขนาดใหญ่แสดงแท็กลำดับ (EST) ในสามชนิดที่สำคัญทางเศรษฐกิจของ
silkmoths ป่า เพื่อที่จะทำให้ทรัพยากรเหล่านี้สามารถใช้ได้สำหรับการใช้งานทางวิทยาศาสตร์ระดับโลก
ชุมชนฐานข้อมูล EST เรียกว่า 'WildSilkbase' ได้รับการพัฒนา.
รายละเอียด: WildSilkbase เป็นแคตตาล็อกของโคลนที่เกิดจากเนื้อเยื่อที่แตกต่างกันหลาย
ขั้นตอนพัฒนาการของเศรษฐกิจที่สำคัญ 3 silkmoths saturniid, อินเดีย silkmoth ทอง
Antheraea assama, tasar เขตร้อนอินเดีย silkmoth, A. mylitta และ Eri silkmoth, Samia cynthia ricini.
ปัจจุบันฐานข้อมูลมีให้กับ 57,113 โคลนซึ่งมีการจัดกลุ่มและประกอบเป็น 4,019
contigs และ 10,019 ซิงเกิล ข้อมูลที่สามารถเรียกดูและดาวน์โหลดโดยใช้มาตรฐานเว็บ
เบราว์เซอร์ ผู้ใช้สามารถค้นหาฐานข้อมูลทั้งโดยการสอบถามระเบิดคำหลักหรือยีนอภิปรัชญา
แบบสอบถาม มีตัวเลือกที่จะดำเนินการค้นหาชนิดของเนื้อเยื่อและขั้นตอนการพัฒนาเฉพาะ
โคลนในหน้าระเบิด คุณสมบัติอื่น ๆ ของ WildSilkbase รวมถึงการค้นพบ cSNP, GO ผู้ชม
ค้นหาคล้ายคลึงกัน, Finder SSR และการเชื่อมโยงไปยังฐานข้อมูลอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้อง WildSilkbase เป็นอิสระ
ที่มีอยู่จาก http://www.cdfd.org.in/wildsilkbase/.
สรุป: รวมของ 14,038 unigenes สมมุติที่ถูกระบุใน 3 ชนิดของ silkmoths ป่า.
ยีนเหล่านี้มีทรัพยากรที่สำคัญที่จะได้รับข้อมูลเชิงลึกในการทำงานและ การศึกษาวิวัฒนาการ
ของ silkmoths ป่า เราเชื่อว่า WildSilkbase จะเป็นประโยชน์อย่างมากสำหรับนักวิจัยทุกคนที่
ทำงานในพื้นที่ของฟังก์ชั่นการเปรียบเทียบฟังก์ชั่นการทำงานและวิวัฒนาการในระดับโมเลกุล
โดยทั่วไปและการค้นพบยีนองค์กรยีนองค์ประกอบ transposable และความแปรปรวนของจีโนม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลัง : หน้าที่ยีนได้เฉพาะสัญญาในชีววิทยาไหมสำหรับการระบุยีน
มีส่วนร่วมในความหลากหลายของฟังก์ชันทางชีวภาพที่ประกอบด้วย : การสังเคราะห์และการหลั่งของผ้าไหม , เพศ
กำหนดเส้นทาง , แมลงเชื้อโรคติดต่อ , chorionogenesis นาฬิกาโมเลกุล ป่า
silkmoths จะเป็นเรื่องของการสืบสวนทางวิทยาศาสตร์อย่างละเอียด เนื่องจากส่วนใหญ่จะ nonavailability
ของโมเลกุลและข้อมูลทางพันธุกรรมในสายพันธุ์เหล่านี้ เป็นขั้นตอนแรกในการศึกษาเรา
สร้างขนาดใหญ่แสดงลำดับแท็ก ( EST ) ใน 3 ชนิดที่สำคัญทางเศรษฐกิจของ
ป่า silkmoths . เพื่อที่จะทำให้ทรัพยากรเหล่านี้สามารถใช้ได้สำหรับการใช้งานของชุมชนวิทยาศาสตร์
ทั่วโลกเป็นฐานข้อมูล เรียกว่า ' ' EST wildsilkbase
รายละเอียด : ได้รับwildsilkbase เป็นแคตตาล็อกของฐานข้อมูลที่สร้างจากเนื้อเยื่อหลายที่แตกต่างกันตามขั้นตอนของ silkmoths
3 saturniid สำคัญทางเศรษฐกิจ เป็นผีเสื้อไหมทองอินเดีย
antheraea assama , ผีเสื้อไหม tasar อินเดียร้อน อ. mylitta เอริและผีเสื้อไหม ซาเมีย ซินเธีย ricini .
ขณะนี้ฐานข้อมูลเป็นฐานข้อมูลให้กับ 57113 ซึ่งมีการจัดกลุ่มและรวมตัวกันเป็น 4019
สูง และ 10019 singletons . ข้อมูลสามารถเรียกดู และดาวน์โหลดโดยใช้เว็บเบราเซอร์
มาตรฐาน ผู้ใช้สามารถค้นหาฐานข้อมูลโดยการระเบิด คำหลักหรือค้นหาอภิปรัชญา
ยีน มีตัวเลือกเพื่อดำเนินการค้นหาชนิดเนื้อเยื่อและการพัฒนาขั้นตอนที่เฉพาะเจาะจง
ฐานข้อมูลในหน้าระเบิด คุณสมบัติอื่น ๆของ wildsilkbase รวม csnp ค้นพบ ไปดู
ผิว Finder ,ค้นหา SSR และการเชื่อมโยงทั้งหมดอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับฐานข้อมูล การ wildsilkbase เป็นอิสระ
ใช้ได้จาก http : / / www.cdfd . org . / wildsilkbase / .
สรุป : ทั้งหมดของ 14038 unigenes ซึ่งถูกระบุใน 3 ชนิดของป่า silkmoths .
ยีนเหล่านี้ให้ข้อมูลสำคัญ เพื่อเพิ่มความเข้าใจในการทำงานและ
การศึกษาวิวัฒนาการของป่า silkmoths .เราเชื่อว่า wildsilkbase จะเป็นประโยชน์อย่างมากสำหรับบรรดานักวิจัย
ทำงานในพื้นที่ของลักษณะทางพันธุกรรมเปรียบเทียบหน้าที่ยีนและโมเลกุลวิวัฒนาการใน
ทั่วไปและการค้นพบยีนองค์กรยีน ตรวจความแปรปรวนขององค์ประกอบและจีโนม