The gene or sequence that serves as

The gene or sequence that serves as target for the nucleic acids
detection needs to be defined, for instance through bioinformatics
analysis or database mining. A proper set of oligonucleotide probe
and hairpins must consequently be designed for, respectively,
binding and detecting the target sequence from the analyte
solution and then performing HCR amplification and confirmation
of the signal. For the experiments herein reported, the DNA
sequences of the necessary probes, targets and hairpins were
designed starting from sequences of target pathogenic microorganisms
(e.g. Cryptosporidium parvum) or viruses. The sequence of
a selected gene known to be specific for a strain, for example the
COWP gene in C. parvum, GenBank AF248743 (Yu et al., 2009), was
first screened automatically for potential candidate regions (for
good potential binding and low interfering secondary structure
and dimerization of the target). Then, a restricted number of
candidate sequence portions were individually checked in a
manual fashion to extract the candidate sequence with the lowest
predicted structural interference to HCR

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีนหรือลำดับที่เป็นเป้าหมายสำหรับกรดนิวคลีอิกตรวจสอบต้องกำหนด เช่นผ่าน bioinformaticsวิเคราะห์หรือทำเหมืองแร่ของฐานข้อมูล ชุดที่เหมาะสมของโพรบ oligonucleotideและ hairpins ต้องจึงถูกออกแบบ ตามลำดับผูก และตรวจสอบลำดับเป้าหมายจากการ analyteโซลูชันและจากนั้น ดำเนินการขยาย HCR และยืนยันของสัญญาณ สำหรับการทดลองนี้รายงาน ดีเอ็นเอลำดับจำคลิปปากตะเข้ เป้าหมาย และ hairpins ได้มาเริ่มต้นจากลำดับของจุลินทรีย์เป้าหมาย(เช่นเพิ่ม parvum) หรือไวรัส ลำดับของยีนตัวเลือกอย่างเฉพาะเจาะจงสำหรับต้องใช้ ตัวอย่างการยีน COWP ใน C. parvum, GenBank AF248743 (Yu et al., 2009), ถูกฉายครั้งแรก โดยอัตโนมัติสำหรับภูมิภาคผู้สมัครที่มีศักยภาพ(ผูกดีศักยภาพและโครงสร้างรองรบกวนต่ำก dimerization ของเป้าหมาย) แล้ว จำนวนที่จำกัดของส่วนผู้สมัครลำดับตรวจสอบในแต่ละแบบแฟชั่นด้วยตนเองแยกลำดับผู้สมัครกับต่ำสุดรบกวนโครงสร้างคาดการณ์การ HCR

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หรือลำดับของยีนที่ทำหน้าที่เป็นเป้าหมายของกรดนิวคลีอิก
การตรวจสอบจะต้องมีการกำหนดไว้เช่นผ่านรส
หรือการทำเหมืองแร่การวิเคราะห์ฐานข้อมูล ชุดที่เหมาะสมของการสอบสวน oligonucleotide
และปักจึงต้องได้รับการออกแบบมาสำหรับตามลำดับ
มีผลผูกพันและการตรวจจับเป้าหมายลำดับจากวิเคราะห์
การแก้ปัญหาแล้วการดำเนินการขยาย HCR และการยืนยัน
ของสัญญาณ สำหรับการทดลองที่มีการรายงานในที่นี้ดีเอ็นเอ
ลำดับของยานสำรวจที่จำเป็นเป้าหมายและปักถูก
ออกแบบมาเริ่มจากลำดับของเชื้อจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดโรคเป้าหมาย
(เช่น Cryptosporidium ขวด) หรือไวรัส ลำดับของ
ยีนที่เลือกที่รู้จักกันเป็นที่เฉพาะเจาะจงสำหรับสายพันธุ์เช่น
ยีน COWP ในขวดซี GenBank AF248743 (Yu et al., 2009) ได้รับการ
คัดเลือกเป็นครั้งแรกโดยอัตโนมัติสำหรับภูมิภาคผู้สมัครที่มีศักยภาพ (สำหรับ
ดีที่มีศักยภาพที่มีผลผูกพันและต่ำ รบกวนโครงสร้างทุติยภูมิ
และ dimerization ของเป้าหมาย) จากนั้นเป็นจำนวนที่ จำกัด ของ
ผู้สมัครส่วนลำดับถูกตรวจสอบเป็นรายบุคคลใน
แฟชั่นคู่มือในการสกัดลำดับผู้สมัครที่มีต่ำสุด
คาดการณ์การรบกวนโครงสร้าง HCR

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หรือลำดับยีนที่ทำหน้าที่เป็นเป้าหมายสำหรับการตรวจหากรดนิวคลีอิก
ต้องกำหนด เช่น ผ่านการวิเคราะห์รสน
หรือการทำเหมืองแร่ฐานข้อมูล การตั้งค่าที่เหมาะสมของ
โพรบ ซึ่งและปักต้องจึงถูกออกแบบมาสำหรับตามลำดับ
ผูกพัน และการตรวจจับเป้าหมายลำดับจากครู
โซลูชั่นแล้วแสดงแบบ hcr และยืนยัน
ของสัญญาณสำหรับการทดลองที่รายงานในที่นี้ ดีเอ็นเอ
ลำดับของฟิวส์ที่เป็นเป้าหมายและปักเป็น
ออกแบบเริ่มจากลำดับของเป้าหมาย เชื้อโรค จุลินทรีย์
( เช่น Cryptosporidium parvum ) หรือไวรัส ลำดับของยีนที่รู้จัก
เลือกได้เฉพาะสายพันธุ์ ตัวอย่างเช่น
cowp ยีนใน C parvum ขนาด af248743 ( Yu , et al . , 2009 ) ,
ก่อนการคัดกรองโดยอัตโนมัติสำหรับผู้สมัครภูมิภาคที่มีศักยภาพ ( ศักยภาพ และต่ำ

รบกวนโครงสร้างทุติยภูมิ และสหชาตของเป้าหมาย ) แล้วจำกัดจำนวนผู้สมัครลำดับส่วนนักเรียนรายบุคคล

แฟชั่น ตรวจสอบในคู่มือเพื่อดึงผู้สมัครลำดับด้วยค่ารบกวน hcr
ทำนายโครงสร้าง