Both RAPD and SSR markers were used

Both RAPD and SSR markers were used to evaluate
108 accessions of irrigated and upland rice representing the
genetic basis of rice breeding in Brazil (“reference collection
– RC”), including the parental lines of recurrent selection
populations such as CNA-5, as well as two O.
glumaepatula accessions and one O. rufipogonn accession.
Cluster analysis based on 114 RAPD markers and 13 SSR
loci detected strong genetic structuring of the RC accessions
in two groups corresponding to the subspecies indica
(36% of the accessions) and japonica (64% of the accessions).
The data based on RAPD and SSR polymorphic
markers was contrasted with morphological, botanical and
crop system information. Results indicated that the use of
four indica/japonica-specific RAPD markers could reliably
classify a rice accession at the subspecific level, providing
a useful tool for fast analysis of large collections.
The data also indicated that some accessions are probably
derived from indica x japonica crosses (I/J). The four indica/
japonica-specific RAPD markers were used to fingerprint
267 lines of the CMS hybrid program. The data
indicated that nine lines were japonica, 104 were indica
and 158 a possible intercross (I/J) between the two subspecies. It was interesting to notice that several
maintainers have a genetic background (I/J) that differs
from that observed in the male sterile lines (indica). Polymorphism
between male sterile lines and their current
maintainers at 11 SSR loci detected with the two multiplex
systems confirmed these differences, as mentioned below

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้เครื่องหมายอาร์เอพีดีและ SSR ประเมินaccessions 108 ข้าวยาม และค่อยแสดงตัวพื้นฐานทางพันธุกรรมของข้าวพันธุ์ในบราซิล ("เก็บการอ้างอิง-RC "), รวมทั้งรายการหลักของตัวเลือกการเกิดซ้ำประชากรเช่น CNA-5 เป็นโอสองglumaepatula accessions และภาคยานุวัติโอ rufipogonn หนึ่งแบ่งตามเครื่องหมายอาร์เอพีดี 114 และ 13 SSRloci พบจัดโครงสร้างทางพันธุกรรมแรงของ accessions ใน RCในกลุ่มที่สองที่สอดคล้องกับ indica ชนิดย่อย(36% ของการ accessions) และ japonica (64% ของ accessions ที่)ข้อมูลตามอาร์เอพีดีและ polymorphic SSRเครื่องหมายถูกต่างกับสัณฐาน พฤกษศาสตร์ และตัดข้อมูลระบบ แสดงผลที่ใช้เครื่องหมายอาร์เอพีดีเฉพาะ indica/japonica 4 ไม่ได้จัดประเภททะเบียนข้าวระดับ subspecific ให้เครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์อย่างรวดเร็วของคอลเลกชันขนาดใหญ่ข้อมูลยังระบุว่า accessions บางอาจจะมา indica x ตัด japonica (ฉัน / J) Indica 4 /เครื่องหมายอาร์เอพีดี japonica เฉพาะใช้ลายนิ้วมือสาย 267 ของโปรแกรม CMS ไฮบริด ข้อมูลระบุว่า บรรทัดที่ 9 ถูก japonica, 104 ได้ indicaและ 158 ที่สุด intercross (ฉัน / J) ระหว่างชนิดย่อย 2 ก็สังเกตเห็นที่น่าสนใจหลายmaintainers มีพื้นหลังทางพันธุกรรม (ฉัน / J) ที่แตกต่างจากที่สังเกตในรายการกอซชาย (indica) โพลิมอร์ฟิซึมระหว่างบรรทัดใส่ชายและปัจจุบันของพวกเขาmaintainers ที่ 11 SSR loci พบกับล็กสองระบบยืนยันความแตกต่างเหล่านี้ เป็นที่กล่าวถึงด้านล่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ทั้งสอง RAPD และเครื่องหมาย SSR ถูกนำมาใช้ในการประเมิน
108
สายข้าวในเขตชลประทานและพื้นที่สูงที่เป็นตัวแทนของพื้นฐานทางพันธุกรรมของพันธุ์ข้าวในบราซิล("คอลเลกชันอ้างอิง
- RC")
รวมทั้งสายผู้ปกครองของการเลือกกำเริบประชากรเช่นCNA-5 เป็นอย่างดี
สองทุมสายglumaepatula และเป็นหนึ่งในโอ rufipogonn ภาคยานุวัติ.
การวิเคราะห์กลุ่มขึ้นอยู่กับ 114 เครื่องหมาย RAPD และ 13 SSR
ตำแหน่งที่ตรวจพบโครงสร้างทางพันธุกรรมที่แข็งแกร่งของสาย RC
สองกลุ่มที่สอดคล้องกับ indica ย่อย
(36% ของสาย) และ japonica ( 64% ของสาย) ที่.
ข้อมูลที่อยู่บนพื้นฐานของ RAPD และ SSR polymorphic
เครื่องหมายถูกเปรียบเทียบกับลักษณะทางสัณฐานวิทยาพฤกษศาสตร์และข้อมูลของระบบการเพาะปลูก
ผลการศึกษาพบว่าการใช้สี่ indica / japonica เฉพาะเครื่องหมาย RAPD น่าเชื่อถือสามารถจำแนกเข้าข้าวในระดับsubspecific ให้เครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์อย่างรวดเร็วของคอลเลกชันขนาดใหญ่. ข้อมูลยังชี้ให้เห็นว่าสายที่บางคนอาจจะมาจาก indica x japonica กากบาท (I / J) สี่ indica / japonica เฉพาะเครื่องหมายดีเอ็นเอถูกนำมาใช้ลายนิ้วมือ267 สายของโปรแกรม CMS ไฮบริด ข้อมูลที่แสดงให้เห็นว่าเก้าเส้นเป็น japonica 104 เป็น indica และ 158 intercross ที่เป็นไปได้ (I / J) ระหว่างทั้งสองชนิดย่อย มันน่าสนใจที่จะสังเกตเห็นว่าหลายดูแลมีพื้นหลังทางพันธุกรรม (I / J) ที่แตกต่างจากที่พบในสายหมันชาย(indica) ความแตกต่างระหว่างบรรทัดหมันชายและปัจจุบันของพวกเขาดูแลที่11 ตำแหน่ง SSR ตรวจพบกับทั้งสองหลายระบบได้รับการยืนยันแตกต่างเหล่านี้เป็นที่กล่าวถึงด้านล่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทั้งเทคนิค RAPD และ SSR markers เพื่อใช้ประเมิน
ของชลประทานและข้าวไร่แทน
พันธุกรรมพื้นฐานของข้าวพันธุ์ต่างๆในบราซิล 108 ( " การอ้างอิงคอลเลกชัน
( RC ) รวมทั้งสายพันธุ์พ่อแม่ของประชากร เช่น การกลับเป็นซ้ำ
cna-5 เช่นเดียวกับ 2 o .
glumaepatula accessions และหนึ่ง . rufipogonn ภาคยานุวัติ .
วิเคราะห์กลุ่มขึ้นอยู่กับ 114 เครื่องหมายอาร์เอพีดีและ 13 SSR
โครงสร้างทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ที่ตรวจพบมากในกลุ่ม RC
3
สอดคล้องกับชนิดย่อย ( 36% ของสายพันธุ์ ) และญี่ปุ่น ( 64 เปอร์เซ็นต์ ของตัวอย่าง ) .
ข้อมูลจากเทคนิค RAPD และ SSR polymorphic
เครื่องหมายถูกขัดกับลักษณะทางพฤกษศาสตร์และ
ข้อมูลระบบการปลูกพืช ผลการศึกษาพบว่า การใช้
4 3 / การศึกษาเฉพาะเครื่องหมายอาร์เอพีดีสามารถเชื่อถือ
จัดข้าวเพิ่มขึ้นในระดับซึ่งเป็นชนิดย่อยให้
เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์อย่างรวดเร็วของคอลเลกชันที่มีขนาดใหญ่ .
ข้อมูลยังพบว่าบางสายพันธุ์อาจ
3 x ญี่ปุ่นได้มาจากกางเขน ( I / J ) 4 3 /
จาปเฉพาะเครื่องหมายอาร์เอพีดี ใช้ลายนิ้วมือ
267 สายของ CMS แบบโปรแกรม ข้อมูลระบุว่า เก้าเส้นญี่ปุ่น
3
, 104 คือและ 158 เป็น intercross ที่สุด ( I / J ) ระหว่างสองสายพันธุ์ มันน่าสนใจที่จะทราบว่าหลาย
รักษามีพื้นฐานทางพันธุกรรม ( I / J ) ที่แตกต่างจากที่พบใน
เพศผู้เป็นหมัน ( สาย 3 ) -
ระหว่างสายพันธุ์เพศผู้เป็นหมันและการรักษาปัจจุบัน
ที่โลไซ SSR กับสอง 11 ตรวจพบระบบ multiplex
ยืนยันความแตกต่างเหล่านี้ , ตามที่กล่าวไว้ด้านล่าง