The similarity of OTUs and soil typ

The similarity of OTUs and soil type, according to the
composition of nifH reads, were demonstrated through heatmaping
by combining two dendrograms (Fig. 2). At P

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คล้ายคลึง OTUs และดินชนิด ตามอ่านส่วนประกอบของ nifH ได้แสดงถึง heatmapingโดยการรวมสอง dendrograms (Fig. 2) ที่ P < 0.05ตารางที่ 2 คุณสมบัติทางเคมีของกรดซัลเฟต พรุ และดินเนื้อปูนดินทรายดินชนิด P (H2O) สุ่มตัวอย่างค่า pH ไซต์ Bray (mg kg−1) ฉัน NH4 (mg kg−1) NO3 (mg kg−1)ซัลเฟตกรด 03 ° 26'24 '' S 114 ° 50' 50.7'' E 3.00−3.22 0.83±0.00 144±66 2.2±3.1พรุ 03 ° 26' 42.6'' S 114 ° 39' 57.4'' E 3.10−3.75 32.22±7.06 271±261 2.0±2.2ทรายดิน 03 ° 26' 22.2'' S 114 ° 50' 57.4'' E 4.43−4.75 0.87±0.48 111±24 5.7±6.0* ค่าของ P Bray ฉัน NH4 NO3 อยู่ means±SDs (n = 3)nifH ความหลากหลายใน 85 ไรโซสเฟียร์29 OTUs ถูกแบ่งออกเป็น 2 กลุ่ม รูปแบบของกระจายของ OTUs แตกต่างระหว่างชนิดของดินที่ 3มีสิบสี่ nifH คลัสเตอร์ (A1-A14) ในดินกรดซัลเฟตคลัสเตอร์ (P1 – P8) แปดในดินพรุ และคลัสเตอร์ 7(S1-S7) ในดินดินทราย คลัสเตอร์หลักมากที่สุดมี A11 ในดินกรดซัลเฟต P3 ในพรุและ S5 ในดินทรายตามลำดับ นอกจากนี้ สุดความสัมพันธ์สิ่งมีชีวิตค้นหาพบ blastn ถูก Bradyrhizobium sp. IRBG228(ca. 90% ตัว) สำหรับ A11, Beijerinckia indica (ca 85%รหัสประจำตัว) สำหรับ loti P3 และ Mesorhizobium (ca. 93% รหัสประจำตัว)สำหรับ S5 แม้ว่าการถ่ายโอนยีนด้านข้างมีการคาดการณ์สำหรับยีน nitrogenase, nifH ถือว่าเป็นประโยชน์ระดับโมเลกุลเครื่องหมายสำหรับการตรวจสอบ และระบุ diazotrophic สิ่งมีชีวิตเนื่องจากโดยทั่วไปตรง phylogeny ของยีน nifHที่ 16S rRNA ยีน (40) ดังนั้น phylogeneticข้อมูลเกี่ยวกับ OTU หลักภายในดินแต่ละชนิดอาจมีประโยชน์สำหรับข้อของฟังก์ชันในดินแต่ละชนิดS5 มี OTU ทั่วไปเท่านั้นที่ไม่พบในดินกรดซัลเฟตแต่ปัจจุบันในพรุและดินทราย รูปแบบของการกระจายของ OTUs แตกต่างกับชนิดของดิน อย่างไรก็ตาม ความแตกต่างระหว่างไรโซสเฟียร์และกลุ่มดินเนื้อปูนเท่าพบในซัลเฟตกรดดินตัวอย่าง ในขณะที่รูปแบบของการกระจายของ OTUs ได้ไม่แตกต่างกันในดินทรายดินพรุ มีมี OTU ไม่อยู่ในตัวอย่างดินทั้งหมด (เช่น "generalists")ในทางตรงกันข้าม มี OTUs บางที่อยู่ในหนึ่งเดียวดินตัวอย่าง (เช่น "ผู้เชี่ยวชาญ") พิจารณาที่แพร่หลายกระจายของแบคทีเรีย free-living diazotrophic การขาดgeneralists ระหว่างตัวอย่างดินสามไม่น่าสนใจอย่างไรก็ตาม ในธาตุ อาหารต่ำ และกรดดินเนื้อปูน ความหลากหลายของการnifH ยีนอาจขอขึ้นอยู่กับคุณสมบัติของดิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความคล้ายคลึงกันของ Otus
และชนิดของดินที่เป็นไปตามองค์ประกอบของnifH อ่านได้แสดงให้เห็นถึง heatmaping
โดยการรวมสอง dendrograms (รูปที่. 2) ที่ p <0.05,
ตารางที่ 2 คุณสมบัติทางเคมีของกรดซัลเฟต, พีทและดินเหนียวปนทราย
pH เว็บไซต์ประเภทดินสุ่มตัวอย่าง (H2O) เบรย์ P ฉัน (มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม 1) NH4 (มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม 1) NO3 (มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม 1)
กรดซัลเฟต 03 ° 26'24 '' S 114 ° 50'50.7''E 3.00-3.22 0.83 ± 0.00 ± 144 66 2.2 ± 3.1
พี 03 ° 26'42.6 '' S 114 ° 39'57.4''E 3.10-3.75 32.22 ± 7.06 271 261 ± 2.0 ± 2.2
แซนดิน 03 ° 26'22.2 '' S 114 ° 50'57.4''E 4.43-4.75 0.87 ± 0.48 ± 111 24 5.7 ± 6.0
* ค่าของ P เบรย์ผมที่ NH4 และ NO3 จะหมายถึง± SDS (n = 3).
nifH ความหลากหลายในบริเวณราก 85
29 Otus ถูกแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม รูปแบบของการกระจายตัวของ Otus แตกต่างกันระหว่างสามประเภทดินสิบกลุ่มnifH (A1-A14) ในดินซัลเฟตกรดแปดกลุ่ม(P1-P8) ในดินพรุเจ็ดและกลุ่ม(S1-S7) ใน ดินเหนียวปนทราย กลุ่มที่โดดเด่นที่สุดคือ A11 ในดินซัลเฟตกรด P3 ในพรุและ S5 ในดินทรายตามลำดับ นอกจากนี้สิ่งมีชีวิตที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดที่พบในการค้นหากล่าวหาเป็น Bradyrhizobium SP IRBG228 (แคลิฟอร์เนียตัวตน 90%) สำหรับ A11, indica Beijerinckia (แคลิฟอร์เนียได้ 85% ตัวตน) สำหรับ P3 และ Mesorhizobium Loti (แคลิฟอร์เนียตัวตน 93%) สำหรับ S5 แม้ว่าการถ่ายโอนยีนด้านข้างได้รับการสันนิษฐานสำหรับยีนไนโตร, nifH ถือเป็นโมเลกุลที่มีประโยชน์เครื่องหมายสำหรับการตรวจสอบและระบุสิ่งมีชีวิตdiazotrophic, เพราะวิวัฒนาการของยีน nifH โดยทั่วไปสอดคล้องกับที่ของยีน16S rRNA (40) ดังนั้น phylogenetic ข้อมูลเกี่ยวกับ OTU ที่โดดเด่นในแต่ละดินชนิดอาจเป็นประโยชน์สำหรับข้อสรุปของการทำงานในแต่ละชนิดของดิน. S5 เป็นเรื่องธรรมดาเพียง OTU ไม่พบในดินที่เป็นกรดซัลเฟตแต่ปัจจุบันทั้งในดินทรายและพรุ รูปแบบของการกระจายของ Otus แตกต่างกับชนิดของดิน แต่ความแตกต่างระหว่างบริเวณรากและเป็นกลุ่มดินที่ถูกพบในตัวอย่างดินซัลเฟตกรดในขณะที่รูปแบบของการกระจายของOtus ไม่แตกต่างกันในพรุและดินเหนียวทราย มีไม่มีที่มีอยู่ใน OTU ตัวอย่างดินทั้งหมด (คือ "generalists"). ในทางตรงกันข้ามมีบาง Otus ที่มีอยู่เพียงหนึ่งในตัวอย่างดิน(คือ "ผู้เชี่ยวชาญ") พิจารณาแพร่หลายกระจายของการใช้ชีวิตที่ปราศจากแบคทีเรีย diazotrophic ขาด generalists ในสามตัวอย่างดินไม่ได้เป็นที่น่าสนใจ. อย่างไรก็ตามในสารอาหารต่ำและดินกรดความหลากหลายของยีน nifH อาจจะขึ้นอยู่กับคุณสมบัติของดิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความคล้ายคลึงกันของในและชนิดของดิน ตามองค์ประกอบของ nifh อ่าน

) ที่แสดงให้เห็นถึง heatmaping โดยการรวมสอง dendrograms ( รูปที่ 2 ) ที่ p < 0.05 ,
โต๊ะ 2 สมบัติทางเคมีของดินพรุ ดินเปรี้ยว ดิน ทราย , และชนิดของดิน pH การสุ่มตัวอย่างเว็บไซต์
( H2O ) P เบรย์ ( มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม− 1 ) NH4 ( มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม ( − 1 ) 3 มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม− 1 )
ดินเปรี้ยว 03 / 26 '24 ' 114 องศา 50 '50.7 ''e 3.00 − 3.22 0.83 ± 0.00 144 ± 66 2.2 ± 31
พีท 03 / 26 '42.6 ' 114 / 39 '57.4 ''e 3.10 − 3.75 32.22 ± 7.06 271 ± 261 2.0 ± 2.2
ทรายดิน 03 / 26 '22.2 ' 114 องศา 50 '57.4 ''e 4.43 − 4.75 0.87 ± 0.48 111 ± 24 5.7 ± 6.0
* ค่า P เอาผม No3 NH4 และ วิธีการ± SDS ( n = 3 ) .
ความหลากหลาย nifh ในราก 85
29 ในแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม รูปแบบของการกระจายในแตกต่างกันระหว่าง
3
ดินชนิดกับ 14 กลุ่ม ( A1 ) nifh A11 ) ในดินเปรี้ยวดิน
8 กลุ่ม ( P1 ) P8 ) ในดินพีท และเจ็ดกลุ่ม
( S1 ) S7 ) ในดินเหนียวทราย
กลุ่มเด่นที่สุดคือ A11 ในดินเปรี้ยว P3 ในพรุและ S5 ในทรายดิน
ตามลำดับ นอกจากนี้ ยังพบในสิ่งมีชีวิตส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
ค้นหา blastn คือถั่วเหลือง sp . irbg228
( ประมาณ 90% ตัวตน ) A11ไบเจอริงเคีย indica ( ประมาณ 85 %
ตัวตน ) P3 และ mesorhizobium โลติ ( ประมาณ 93% ตัวตน ) S5
สำหรับ . ถึงแม้ว่าการถ่ายโอนยีน ด้านข้างมีเลื่อง
ไนโตรจีเนส ยีน nifh ถือเป็นเครื่องหมายโมเลกุลที่เป็นประโยชน์สำหรับการตรวจหาและระบุ diazotrophic

เพราะในระบบเชื้อชาติของ nifh ยีนโดยทั่วไปสอดคล้อง
เพื่อที่ของ 16S rRNA ยีน ( 40 ) ดังนั้น วิวัฒนาการ
ข้อมูลเกี่ยวกับ otu เด่นภายในดินแต่ละชนิดอาจจะมีประโยชน์สำหรับ
สรุปการทำงานในแต่ละชนิดของดิน .
S5 เป็นเพียงสามัญ otu ไม่พบในดินเปรี้ยว
แต่ปัจจุบันทั้งในดิน ทราย และพรุ . รูปแบบการกระจายของชนิดแตกต่างกับ
ในดิน อย่างไรก็ตาม ความแตกต่างระหว่างรากและดินเป็นกลุ่ม

แค่เจอในดินเปรี้ยวจัดตัวอย่างในขณะที่รูปแบบการกระจาย
ของในไม่แตกต่างกันในพรุและดินเหนียวทราย มี
ไม่มี otu ที่มีอยู่ในตัวอย่างดินทั้งหมด ( เช่น " generalists
" ) ในทางตรงกันข้ามก็มี ในที่มีอยู่ในเพียงหนึ่ง
ดินตัวอย่าง ( เช่น " ผู้เชี่ยวชาญ " ) เมื่อพิจารณาจากการกระจายแพร่หลายของแบคทีเรียอิสระ

diazotrophic , ขาดgeneralists ระหว่างสามตัวอย่างดินไม่น่าสนใจ .
แต่ธาตุอาหารต่ำ และดินเปรี้ยว ความหลากหลายของยีน
nifh อาจขอขึ้นอยู่กับคุณสมบัติของดิน