The observation that the 840-bp PCR

The observation that the 840-bp PCR product was
faint (Fig. 1B) could be due to competition of the
mold DNA sequences for the primers or to the rarity
of long molecules of DNA in the ancient samples that
are sufficiently undamaged by interstrand cross-links,
Fig. 1. Analysis of ancient DNA from Scorpion
I wine jar residues. A Three aliquots of
finely ground 500-mg samples were extracted
and run on a gel. The DNA recovered is shown
in lanes 1–3. A blank negative control, extracted
using the same procedure, was run in lane 4.
Lane 5 is empty. The molecular weight marker
(Gene Ruler 100-bp DNA ladder, M-Medical
Genenco, Florence, Italy) is shown in the M
lanes. B The extracted DNA was replicated by
PCR with primers ITS1 and ITS4 (lane 2): lane
1, 5 ll of negative control + 50 ng of S. cerevisiae
genomic DNA; lane 2, 5 ll of amplified
ancient DNA sample; lane 3, 5 ll of negative
control. A molecular weight marker with bands
at 100-bp intervals from 100 to 800 bp (Invitrogen,
Carlsbad, CA) is shown in the M lanes.
Fig. 2. BLAST alignment of the 540-bp fungal sequence from the Scorpion I wine jar from ancient Abydos (Ab540) compared with fungal
clone T2709 (GenBank accession number X88771) from the Iceman’s clothing. The sequence comprises 151 bp of ITS1, 157 bp of 5.8S
rDNA, and 187 bp of ITS2.
S228
depurination, or other lesions to still support PCR
amplification. The 840-bp fragment corresponds in
size to the region encompassing S. cerevisiae chromosome
12coordinat es 455966–455123 comprising
394 bp of ITS1, 158 bp of 5.8S rDNA, and 288 bp of
ITS2. To confirm the Saccharomyces origin of the
840-bp product, we designed new primers ITS5 and
ITS6, internal to the 840-bp S. cerevisiae ITS1–5.8S
rDNA–ITS2sequence, which would specifically amplify
sequences belonging to the genus Saccharomyces
(Montrocher et al. 1998). Amplifications of the extracted
DNA with the primer pair ITS1–ITS6 produced
a band of
320 bp, amplification with ITS5–
ITS4 produced a band of
650 bp, and amplification
with ITS5–ITS6 produced a band of
130 bp. These
products correspond to overlapping regions within
the 840-bp product and are of the predicted size. The
bands were also more intense than the 840-bp band,
suggesting that most of the molecules in the extracted
DNA able to support amplification are smaller than
800 bp.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สังเกตว่าผลิตภัณฑ์ PCR 840-bpสลบที่คล้าย (Fig. 1B) อาจเป็น เพราะการแข่งขันลำดับดีเอ็นเอแม่พิมพ์ สำหรับที่ไพรเมอร์ หรือที่หายากของโมเลกุลยาวของดีเอ็นเอในโบราณตัวอย่างที่จะไม่เสียหายแก่ โดย interstrand cross-linksFig. 1 การวิเคราะห์ดีเอ็นเอโบราณจากแมงป่องฉันไวน์ขวดตก Aliquots สามของประณีตมีสกัดตัวอย่างดิน 500 มิลลิกรัมและเรียกใช้บนเจ แสดงดีเอ็นเอที่กู้คืนในถนนหนทาง 1 – 3 ควบคุมลบเปล่า สกัดโดยใช้กระบวนการเดียวกัน ถูกเรียกใช้ในเลน 4เลน 5 ว่างเปล่า น้ำหนักโมเลกุลเครื่องหมาย(ไม้บรรทัดยีน 100 bp DNA บันได M-แพทย์Genenco ฟลอเรนซ์ อิตาลี) จะแสดง Mถนนหนทาง B ดีเอ็นเอแยกถูกจำลองโดยPCR กับไพรเมอร์ ITS1 และ ITS4 (2 เลน): เลน1, 5 จะควบคุมลบ + 50 ng ของ S. cerevisiaegenomic DNA เลน 2, 5 ll ของขยายตัวอย่างดีเอ็นเอโบราณ เลน 3, 5 จะเป็นค่าลบควบคุม น้ำหนักโมเลกุลเครื่องหมาย ด้วยวงในช่วง 100-bp 100 ถึง 800 (Invitrogen, bpคาร์ลส CA) จะแสดงอยู่ในถนนหนทาง MFig. 2 ระเบิดตำแหน่งลำดับเชื้อรา 540-bp จากแมงป่องฉันไวน์ขวดจาก Abydos โบราณ (Ab540) เปรียบเทียบกับเชื้อราโคลน T2709 (GenBank เลขทะเบียน X 88771) จากเสื้อผ้าของไอซ์แมน 151 ประกอบด้วยลำดับที่ bp ITS1, 157 bp ของ 5.8SrDNA และ 187 bp ITS2S228depurination หรืออื่น ๆ ได้จะยังคงสนับสนุน PCRขยาย ส่วน 840 bp สอดคล้องในขนาดโครโมโซม S. cerevisiae ที่ครอบคลุมภูมิภาค12coordinat es 455966 – 455123 ประกอบด้วย394 bp ITS1, 158 bp 5.8S rDNA และ 288 bp ของITS2 ยืนยัน Saccharomyces จุดเริ่มต้นของการผลิตภัณฑ์ 840-bp เราออกแบบไพรเมอร์ใหม่ ITS5 และภายใน 840-bp S. cerevisiae ITS1, ITS6 – 5.8SrDNA – ITS2sequence ที่จะขยายโดยเฉพาะลำดับที่ของพืชสกุล Saccharomyces(Montrocher et al. 1998) Amplifications ของการแยกดีเอ็นเอกับคู่พื้น ITS1-ITS6 ผลิตวงของ 320 bp ขยายกับ ITS5-ITS4 วง 650 บีพี และขยายผลิตกับ ITS5-ITS6 ผลิตวงของ 130 bp. เหล่านี้ผลิตภัณฑ์ที่สอดคล้องกับพื้นที่ทับซ้อนกันอยู่ภายในผลิตภัณฑ์ 840-bp และมีขนาดคาดการณ์ ที่ยังมีวงรุนแรงมากขึ้นกว่าวง 840-bpแนะนำที่สุดของโมเลกุลในการแยกสามารถขยายดีเอ็นเอมีขนาดเล็กกว่า800 bp

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สังเกตว่า 840-bp ผลิตภัณฑ์ PCR เป็น
ลม (รูปที่ 1B.) อาจเป็นเพราะการแข่งขันของ
ลำดับดีเอ็นเอแม่พิมพ์สำหรับไพรเมอร์หรือหายาก
ของโมเลกุลยาวของดีเอ็นเอในตัวอย่างโบราณที่
มีความเสียหายพอสมควรโดย interstrand ข้าม การเชื่อมโยง
รูป 1. การวิเคราะห์ดีเอ็นเอโบราณจากแมงป่อง
ฉันตกค้างขวดไวน์ สามส่วนลงตัวของ
พื้นดินอย่างประณีตตัวอย่าง 500 มิลลิกรัมสกัด
และทำงานบนเจล ดีเอ็นเอกู้คืนจะแสดง
ในเลน 1-3 ควบคุมเชิงลบว่างเปล่าที่สกัด
โดยใช้ขั้นตอนเดียวกันก็วิ่งในเลน 4.
เลน 5 เป็นที่ว่างเปล่า น้ำหนักโมเลกุลเครื่องหมาย
(ยีนไม้บรรทัด 100 bp บันไดดีเอ็นเอ M-แพทย์
Genenco, ฟลอเรนซ์, อิตาลี) จะแสดงในเอ็ม
เลน B สกัดดีเอ็นเอถูกจำลองแบบโดย
วิธี PCR กับไพร ITS1 และ ITS4 (ช่อง 2): เลน
1, 5 LL ของการควบคุมเชิงลบ + 50 ng ของ S. cerevisiae
ดีเอ็นเอ; ช่องทางที่ 2, 5 ของ LL ขยาย
ตัวอย่างดีเอ็นเอโบราณ ช่อง 3, 5 LL เชิงลบของ
การควบคุม เครื่องหมายน้ำหนักโมเลกุลกับวง
ในช่วงเวลา 100 bp 100-800 bp (Invitrogen,
Carlsbad, CA) จะแสดงในช่องเอ็ม.
รูป 2. การจัดตำแหน่งระเบิดของลำดับเชื้อรา 540-bp จากขวดไวน์แมงป่อง I จากโบราณบีดอส (Ab540) เมื่อเทียบกับเชื้อรา
โคลน T2709 (GenBank ภาคยานุวัติจำนวน X88771) จากเสื้อผ้าของ Iceman ลำดับประกอบด้วย 151 bp ของ ITS1, 157 bp ของ 5.8S
rDNA และ 187 bp ของ ITS2.
S228
depurination หรือรอยโรคอื่น ๆ ที่จะยังคงสนับสนุนการ PCR
ขยาย 840-bp ส่วนสอดคล้องใน
ขนาดที่ครอบคลุมภูมิภาค S. cerevisiae โครโมโซม
12coordinat es 455,966-455,123 ประกอบด้วย
394 bp ของ ITS1, 158 bp ของ 5.8S rDNA และ 288 bp ของ
ITS2 เพื่อยืนยัน Saccharomyces กำเนิดของ
สินค้า 840-bp เราได้ออกแบบไพรใหม่ ITS5 และ
ITS6, ภายใน 840-bp S. cerevisiae ITS1-5.8S
rDNA-ITS2sequence ซึ่งเฉพาะจะขยาย
ลำดับที่อยู่ในประเภทประเภท Saccharomyces
(Montrocher และ al. 1998) เครื่องขยายเสียงของการสกัด
ดีเอ็นเอกับคู่ไพร ITS1-ITS6 ผลิต
วง? 320 bp ขยายกับ ITS5-
ITS4 ผลิตวง? 650 bp และขยาย
กับ ITS5-ITS6 ผลิตวง? 130 bp เหล่านี้
ผลิตภัณฑ์ที่สอดคล้องกับการทับซ้อนกันภายในภูมิภาค
สินค้า 840-bp และมีขนาดที่คาดการณ์ไว้
วงก็มีความรุนแรงมากขึ้นกว่าวง 840-bp,
บอกว่าส่วนใหญ่ของโมเลกุลในการสกัด
ดีเอ็นเอสามารถรองรับการขยายมีขนาดเล็กกว่า
800 bp

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สังเกตว่าถ้า BP PCR ผลิตภัณฑ์
เป็นลม ( รูปที่ 1A ) อาจจะเนื่องจากการแข่งขันของ
แม่พิมพ์ลำดับดีเอ็นเอสำหรับไพรเมอร์หรือ rarity
ยาวโมเลกุลดีเอ็นเอในตัวอย่างโบราณ
เพียงพอไม่เสียหาย โดยการเชื่อมโยง interstrand ข้าม
รูปที่ 1 การวิเคราะห์ดีเอ็นเอโบราณจากแมงป่อง
ฉันไวน์ขวดที่ตกค้าง สามเฉยๆของ
บดละเอียด 500 มก. จำนวนสกัด
และวิ่งบนเจล ดีเอ็นเอแสดง
ในเลน 1 – 3 ว่างเปล่าลบควบคุมสกัด
โดยใช้วิธีการเดียวกัน คือ วิ่งในลู่ที่ 4 .
เลน 5 ว่างเปล่า โมเลกุลเครื่องหมาย
( ยีนไม้บรรทัด 100 BP ดีเอ็นเอบันได m-medical
genenco , ฟลอเรนซ์ , อิตาลี ) จะแสดงใน M
เลน . B สกัดดีเอ็นเอด้วยไพรเมอร์แบบ PCR โดย
และ its1 its4 ( ซอย 2 ) : เลน
15 จะควบคุมเชิงลบ 50 ng S . cerevisiae
จีโนมดีเอ็นเอ ซอย 2 , 5 จะได้ตัวอย่างดีเอ็นเอโบราณแถบ
; ซอย 3 , 5 จะควบคุมเชิงลบ

เป็นโมเลกุลเครื่องหมายกับวงดนตรี
ในช่วงเวลา 100 BP จาก 100 กับ 800 คู่เบส ( Invitrogen
, Carlsbad , CA ) จะแสดงใน M เลน .
รูปที่ 2ระเบิดการเรียงตัวของลำดับเบสที่เชื้อราจากแมงป่องฉันไวน์ขวดจากโบราณอาบีดอส ( ab540 ) เทียบกับเชื้อรา
โคลน t2709 ( ขนาดหนังสือเลขที่ x88771 ) จากของไอซ์แมนเสื้อผ้า ลำดับประกอบด้วย 151 BP ของ its1 157 BP ของ 5.8s
rDNA และ 187 BP ของ its2
.
s228 ยชุรเวท หรืออื่น ๆ แผลจะยังคงสนับสนุน PCR
( . 840 BP ส่วนสอดคล้องกับ
ขนาดพื้นที่ครอบคลุมเชื้อ S . cerevisiae โครโมโซม
12coordinat ES 455966 – 455123 ประกอบด้วย
394 BP ของ its1 158 BP ของ 5.8s rDNA และ 288 BP ของ
its2 . เพื่อยืนยันที่มาของ
840 BP และผลิตภัณฑ์ เราได้ออกแบบไพรเมอร์และ its5 ใหม่
its6 ภายในกับ 840 BP S . cerevisiae its1 – 5.8s
rDNA – its2sequence ซึ่งจะขยาย
โดยเฉพาะลำดับของสกุล Saccharomyces
( montrocher et al . 1998 ) amplifications ของการสกัดดีเอ็นเอด้วยไพรเมอร์คู่

its1 – its6 ผลิตวงดนตรีของ
320 BP , การสื่อสารกับ its5 –
its4 ผลิตวงดนตรีของ
650 BP , และขยาย
กับ its5 – its6 ผลิตวงดนตรีของ
130 BP . ผลิตภัณฑ์เหล่านี้สอดคล้องกับภูมิภาคภายใน

ซ้อนสินค้า 840 BP และมีการคาดการณ์ขนาด
วงยังเข้มกว่า 840 BP วงดนตรี
แนะนำว่าส่วนใหญ่ของโมเลกุลในน้ำสกัด ดีเอ็นเอ ที่สามารถรองรับการขยาย

มีขนาดเล็กกว่า 800 BP .