การระบุโปรตีนเฉพาะกลุ่มที่ถูกต้องตามลําดับกรดอะมิโนเป็นเป้าหมายสําคัญในการวิจัยจีโนม ที่นี่เรารวมทฤษฎีข้อมูลกับขั้นตอนการค้นหาตรรกะเลือนเพื่อระบุลายเซ็นลําดับหรือลวดลายทํานายสําหรับสมาชิกของเครือข่ายปัจจัยการถอดความ Myc-Max-Mad Myc เป็น oncoprotein ที่รู้จักกันดีและครอบครัวนี้มีส่วนร่วมในการแพร่กระจายของเซลล์ apoptosis และความแตกต่าง เราอธิบายชุดเล็ก ๆ ของเว็บไซต์กรดอะมิโนจากส่วน N-terminal ของโดเมน helix-loop-helix (bHLH) พื้นฐานที่ให้ลายเซ็นลําดับที่แม่นยํามากสําหรับเครือข่ายปัจจัยการถอดความ Myc-Max-Mad และโปรตีนสมาชิกสามตัว ลวดลายทํานายที่เกี่ยวข้องกับองค์ประกอบลําดับ bHLH ที่อยู่ติดกัน 28 รายการพบโปรตีนเครือข่าย 337 รายการในฐานข้อมูล GenBank NR โดยไม่มีความไม่ตรงกันหรือระบุผิด ลวดลายนี้ยังระบุโปรตีนเชื้อราที่ไม่รู้จักก่อนหน้านี้อย่างน้อยหนึ่งตัวที่มีความสัมพันธ์ที่แข็งแกร่งกับเครือข่าย Myc-Max-Mad ลวดลายอื่นพบ 96% ของลําดับโปรตีน Myc ที่รู้จักกันมีเพียงไม่ตรงกันเดียว, รวมทั้งลําดับจากจีโนมก่อนหน้านี้ไม่ได้คิดว่าจะมีโปรตีน Myc. ลวดลายทํานายสําหรับ Myc นั้นคล้ายกับลําดับบรรพบุรุษสําหรับกลุ่ม Myc ที่ประเมินจากการวิเคราะห์ทาง phylogenetic จากการศึกษาโครงสร้างผลึกที่มีอยู่ลวดลายนี้จะถูกกล่าวถึงในแง่ของผลกระทบด้านการทํางาน ผลลัพธ์ของเราให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการกระจายวิวัฒนาการของดีเอ็นเอที่มีผลผูกพันและ dimerization ในครอบครัวที่โดดเด่นดีของโปรตีนกฎระเบียบและให้วิธีการระบุลวดลายลายเซ็นในครอบครัวโปรตีน
การแปล กรุณารอสักครู่..
