A dataset of 1278 DNA barcodes, rep

A dataset of 1278 DNA barcodes, representing 218 marine fish species, was used to test
the utility of DNA barcodes to assign species from query sequences. We tested query sequences against 1) a reference
library of ranked DNA barcodes from the neighbouring North East Atlantic, and 2) the public databases BOLD and GenBank.
In the first case, a reference library comprising DNA barcodes with reliability grades for 146 fish species was used as
diagnostic dataset to screen 486 query DNA sequences from fish specimens collected in the central basin of the
Mediterranean Sea. Of all query sequences suitable for comparisons 98% were unambiguously confirmed through complete
match with reference DNA barcodes. In the second case, it was possible to assign species to 83% (BOLD-IDS) and 72%
(GenBank) of the sequences from the Mediterranean. Relatively high intraspecific genetic distances were found in 7 species
(2.2%–18.74%), most of them of high commercial relevance, suggesting possible cryptic species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป็นชุดข้อมูลของ 1278 บาร์โค้ดดีเอ็นเอ การแสดงพันธุ์ปลาทะเล 218 ถูกใช้ในการทดสอบโปรแกรมอรรถประโยชน์ของดีเอ็นเอบาร์โค้ดเพื่อกำหนดสายพันธุ์จากลำดับของแบบสอบถาม เราทดสอบแบบสอบถามลำดับกับ 1) อ้างอิงไลบรารีของดีเอ็นเอบาร์โค้ดที่จัดอันดับจากเพื่อนเหนือตะวันออกแอตแลนติก 2) ฐานข้อมูลสาธารณะรูปแบบตัวหนาและ GenBankในกรณีแรก ใช้การอ้างอิงไลบรารีแห่งดีเอ็นเอบาร์โค้ดกับเกรดความน่าเชื่อถือสำหรับพันธุ์ปลา 146 เป็นรวบรวมชุดข้อมูลการวินิจฉัยการจอ 486 สอบถามลำดับดีเอ็นเอจาก specimens ปลาในลุ่มน้ำภาคกลางของการทะเลเมดิเตอร์เรเนียน แบบสอบถามทั้งหมด ลำดับเหมาะสำหรับ 98% เปรียบเทียบได้อย่างชัดเจนยืนยัน โดยสมบูรณ์จับคู่กับดีเอ็นเอบาร์โค้ดอ้างอิง ในกรณีที่สอง มันสามารถกำหนดสายพันธุ์ 83% (รหัสรูปแบบตัวหนา) และ 72%(GenBank) ลำดับจากเมดิเตอร์เรเนียน ระยะทางพันธุกรรมค่อนข้างสูงที่ intraspecific พบ 7 ชนิด(2.2 – 18.74%), ส่วนใหญ่ของพวกเขาความสูงเชิงพาณิชย์เกี่ยวข้อง การแนะนำพันธุ์สุดระทม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ชุดข้อมูลของดีเอ็นเอบาร์โค้ด 1278 คิดเป็น 218
สายพันธุ์ปลาทะเลถูกนำมาใช้ในการทดสอบยูทิลิตี้ดีเอ็นเอบาร์โค้ดเพื่อกำหนดชนิดจากแบบสอบถามลำดับ เราได้ทดสอบลำดับแบบสอบถามกับ 1)
การอ้างอิงห้องสมุดอันดับบาร์โค้ดดีเอ็นเอจากเพื่อนบ้านตะวันออกเฉียงเหนือของมหาสมุทรแอตแลนติกและ2) ฐานข้อมูลสาธารณะ BOLD และ GenBank.
ในกรณีแรกที่ห้องสมุดอ้างอิงประกอบไปด้วยบาร์โค้ดดีเอ็นเอที่มีเกรดความน่าเชื่อถือ 146 สายพันธุ์ปลา
ใช้เป็นชุดข้อมูลที่วินิจฉัยไปยังหน้าจอ486
ลำดับดีเอ็นเอแบบสอบถามจากตัวอย่างที่เก็บรวบรวมปลาในอ่างกลางของทะเลเมดิเตอร์เรเนียน ของทุกลำดับแบบสอบถามที่เหมาะสมสำหรับการเปรียบเทียบ 98%
ได้รับการยืนยันอย่างไม่น่าสงสัยสมบูรณ์ผ่านการแข่งขันกับบาร์โค้ดดีเอ็นเออ้างอิง ในกรณีที่สองมันเป็นไปได้ที่จะกำหนดชนิดถึง 83% (BOLD-IDS) และ 72%
(GenBank) ของลำดับจากทะเลเมดิเตอร์เรเนียน ที่ค่อนข้างสูงในระยะทางพันธุกรรมสำนวนที่พบใน 7 ชนิด
(2.2% -18.74%) ที่สุดของพวกเขามีความเกี่ยวข้องในเชิงพาณิชย์สูงแนะนำสายพันธุ์ที่เป็นความลับที่เป็นไปได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นข้อมูล 1295 ดีเอ็นเอบาร์โค้ดหรือปลาทะเล 218 ชนิด ใช้วิธีการทดสอบ
สาธารณูปโภคของดีเอ็นเอบาร์โค้ดเพื่อกำหนดชนิด จากแบบสอบถามดังนี้ เราทดสอบแบบสอบถามลำดับกับ 1 ) อ้างอิง
ห้องสมุดอันดับดีเอ็นเอบาร์โค้ดจากเพื่อนบ้านมหาสมุทรแอตแลนติกตะวันออก และ 2 ) ฐานข้อมูลสาธารณะตัวหนาและขนาด .
ในกรณีแรกอ้างอิงห้องสมุดประกอบด้วยดีเอ็นเอบาร์โค้ดที่มีความน่าเชื่อถือเกรดปลา 146 ชนิดใช้วินิจฉัยหน้าจอแล้วสอบถามข้อมูล
ลำดับดีเอ็นเอจากปลาทั้งหมดมารวบรวมในลุ่มน้ำภาคกลางของ
ทะเลเมดิเตอร์เรเนียน ของแบบสอบถามลำดับเหมาะสำหรับการเปรียบเทียบร้อยละ 98 กันยืนยันผ่านสมบูรณ์
ตรงกับการอ้างอิงดีเอ็นเอบาร์โค้ด . ในกรณีที่สองมันเป็นไปได้ที่จะกำหนดชนิด ถึง 83% ( bold-ids ) และ 72 %
( 5% ) ของลำดับจากเมดิเตอร์เรเนียน เซ็นต์ทางพันธุกรรมค่อนข้างสูง ระยะที่พบใน 7 ชนิด
( ร้อยละ 2.2 และร้อยละ 18.74 ) ส่วนใหญ่ของพวกเขาที่เกี่ยวข้องเชิงพาณิชย์สูง แนะนำชนิดที่เป็นไปได้