All these considerations underline

All these considerations underline the importance of studying bacterial protein profiles in different experimental conditions. Comparative proteomic analysis is among the most suitable tools to evaluate the phenotypic responses of a food starter or a probiotic strain to a certain environment. For instance, lactose starvation stress and the effect of the surfactant Tween-80 as a protective agent, have been evaluated in Lactobacillus casei GCRL163 by a comparative study based on nanoLC-MS/MS [Al Naseri 22]. A gel-free proteomic approach was used to elucidate the acidic stress response in Lactobacillus plantarum 423 [Heunis 23]. As far as proteomics is concerned, 2DE in-gel techniques proved to be of particular interest allowing us also to detect enzyme isoforms. For instance, it is possible to discriminate a differential biosynthesis of isoenzymes involved in either glycolytic or gluconeogenetic direction of Embden-Meyerhof-Parnas route [24]. Since the beginning of the proteomic era, several protocols have been set up to recover proteins from different cell districts allowing to separately analyze different subproteomes expressed by microorganisms (Fig. 1). The analysis of subproteomes represents a valuable tool to obtain additional information on specific problems: membrane protein patterns can reveal induction of transporters [24] and, since the first adaptive modifications to hostile environments occur at envelope level, stress tolerance pathways [25]. On the other hand, surface and extracellular proteomes help typing probiotic bacteria by elucidating what happens in the bacterium-host interface. In this context, a very recent cutting-edge paper [Le Marechal 26] describes three methods to recover key surface proteins involved in immune-modulation in Propionibacterium freudenreichii.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พิจารณาเหล่านี้ขีดเส้นใต้ความสำคัญของการศึกษาแบคทีเรียโปรตีนโพรไฟล์ในสภาพการทดลองที่แตกต่างกัน วิเคราะห์เปรียบเทียบ proteomic เป็นหนึ่งในเครื่องมือเพื่อประเมินการตอบสนองฟีโนไทป์ของเริ่มอาหารหรือสายพันธุ์โปรไบโอติกการสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมที่สุด เช่น แลคโตสอดความเครียดและผลของชุดโลก-80 เป็นตัวแทนการป้องกัน ได้รับการประเมินใน GCRL163 โดยการศึกษาเปรียบเทียบคะแนนเฉลียจาก nanoLC-MS/MS [อัล Naseri 22] บ้านแลคโตบาซิลลัส วิธีการฟรีเจ proteomic ถูกใช้เพื่อตอบสนองความเครียดเป็นกรดในบาซิลลัส 423 [Heunis 23] elucidate เป็นโปรตีโอมิกส์เป็นห่วง 2DE ในเจลเทคนิคที่พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์ทำให้เรายังสามารถตรวจหาเอนไซม์ isoforms เช่น มันเป็นไปได้ที่จะแยกแยะสังเคราะห์แตกต่างกันของ isoenzymes เกี่ยวข้อง glycolytic หรือ gluconeogenetic ทิศทางของเส้นทาง Embden-Meyerhof ปาร์นาส [24] ตั้งแต่จุดเริ่มต้นของยุค proteomic มีการตั้งค่าโพรโทคอหลายกู้คืนโปรตีนจากเซลล์แตกต่างอำเภอช่วยในการแยกวิเคราะห์แตกต่างกัน subproteomes แสดง โดยจุลินทรีย์ (1 รูป) แสดงถึงการวิเคราะห์ของ subproteomes ที่มีประโยชน์การขอรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับปัญหาที่เฉพาะเจาะจง: เมมเบรนโปรตีนรูปแบบสามารถเปิดเผยเหนี่ยวนำชุดขับเคลื่อน [24] และ เนื่องจากการปรับเปลี่ยนปรับตัวแรกสภาพแวดล้อมที่เป็นมิตรที่เกิดขึ้นที่ระดับซอง เครียดเผื่อเส้นทาง [25] บนมืออื่น ๆ พื้นผิว และสาร proteomes ช่วยพิมพ์แบคทีเรีย โดยแจ่มชัดเกิดอะไรขึ้นในอินเทอร์เฟซโฮสต์แบคทีเรีย ในบริบทนี้ กระดาษล้ำสมัยล่าสุด [เลอ Marechal 26] อธิบายวิธีการสามวิธีการกู้คืนคีย์ผิวโปรตีนที่เกี่ยวข้องในการปรับภูมิคุ้มกันใน Propionibacterium freudenreichii

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การพิจารณาทั้งหมดเหล่านี้เน้นย้ำความสำคัญของการศึกษาโปรตีนของเชื้อแบคทีเรียในเงื่อนไขการทดลองที่แตกต่างกัน การวิเคราะห์เปรียบเทียบโปรตีนเป็นหนึ่งในเครื่องมือที่เหมาะสมที่สุดในการประเมินการตอบสนองของฟีโนไทป์ของอาหารหรือเริ่มต้นสายพันธุ์โปรไบโอติกไปยังสภาพแวดล้อมบางอย่าง ยกตัวอย่างเช่นความเครียดความอดอยากแลคโตสและผลของ Tween-80 ลดแรงตึงผิวเป็นตัวแทนป้องกันที่ได้รับการประเมินใน Lactobacillus casei GCRL163 โดยศึกษาเปรียบเทียบบนพื้นฐาน nanoLC-MS / MS [อัล Naseri 22] เจลฟรีวิธีการ proteomic ถูกใช้ในการอธิบายการตอบสนองต่อความเครียดที่เป็นกรดแลคโตบาซิลลัสใน plantarum 423 [Heunis 23] เท่าที่โปรตีนเป็นห่วง 2DE ในเจลเทคนิคการพิสูจน์แล้วว่าเป็นที่น่าสนใจโดยเฉพาะอย่างยิ่งช่วยให้เรายังตรวจสอบไอโซฟอร์มของเอนไซม์ ยกตัวอย่างเช่นมันเป็นไปได้ที่จะเห็นความแตกต่างสังเคราะห์ความแตกต่างของ isoenzymes ที่เกี่ยวข้องทั้งในทิศทาง glycolytic หรือ gluconeogenetic เส้นทาง Embden-Meyerhof-Parnas [24] ตั้งแต่จุดเริ่มต้นของยุค proteomic โปรโตคอลหลายคนได้รับการจัดตั้งขึ้นเพื่อกู้คืนโปรตีนจากหัวเมืองเซลล์ที่แตกต่างกันจะช่วยในการแยกวิเคราะห์ subproteomes ที่แตกต่างกันแสดงโดยจุลินทรีย์ (รูปที่ 1). การวิเคราะห์ subproteomes หมายถึงเครื่องมือที่มีคุณค่าที่จะได้รับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับปัญหาเฉพาะ: รูปแบบโปรตีนเมมเบรนสามารถที่จะเปิดเผยการชักนำของการขนส่ง [24] และตั้งแต่การปรับเปลี่ยนการปรับตัวครั้งแรกกับสภาพแวดล้อมที่เป็นมิตรเกิดขึ้นในระดับซองจดหมายทุลักทุเลความทนทานต่อความเครียด [25] บนมืออื่น ๆ , พื้นผิวและสาร proteomes ช่วยพิมพ์แบคทีเรียโปรไบโอติกโดยแจ่มชัดว่าเกิดอะไรขึ้นในส่วนติดต่อแบคทีเรียเป็นเจ้าภาพ ในบริบทนี้ตัดขอบกระดาษล่าสุดมาก [Le Marechal 26] อธิบายสามวิธีการกู้คืนพื้นผิวโปรตีนที่สำคัญที่เกี่ยวข้องในการภูมิคุ้มกันเอฟเอ็มใน Propionibacterium freudenreichii

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทั้งหมดเหล่านี้ควรพิจารณาให้ความสำคัญของการศึกษารูปแบบโปรตีนแบคทีเรียในสภาวะการทดลองที่แตกต่างกัน การวิเคราะห์เปรียบเทียบส์เป็นหนึ่งในเครื่องมือที่เหมาะสมที่สุดเพื่อประเมินการตอบสนองลักษณะปรากฏของอาหารโปรไบโอติกสายพันธุ์เริ่มต้นหรือสภาพแวดล้อมบางอย่าง เช่น ความเครียด ภาวะความอดอยาก และผลของสารลดแรงตึงผิว tween-80 เป็นตัวแทนป้องกันได้รับการประเมินใน Lactobacillus casei gcrl163 โดยเปรียบเทียบตาม nanolc MS / MS อัล naseri [ 22 ] เจลฟรีส์แบบใช้กลไกการตอบสนองความเครียดกรด Lactobacillus plantarum heunis 423 [ 23 ] เท่าที่แสดงเป็นกังวล 2de ในเทคนิคเจลได้เฉพาะดอกเบี้ยให้เรายังตรวจพบเอนไซม์ไอโซฟอร์ม . ตัวอย่างเช่นมันเป็นไปได้ที่จะเกี่ยวข้องในการสังเคราะห์อนุพันธ์ของ glycolytic หรือทิศทาง gluconeogenetic ของ embden เมเยอร์โฮฟ พาร์นาสเส้นทาง [ 24 ] ถือเขาถือเรา ตั้งแต่จุดเริ่มต้นของยุคส์ , โปรโตคอลหลายได้รับการตั้งค่าการกู้คืนจากโปรตีนที่แตกต่างกัน เซลล์เขตอนุญาตให้แยกวิเคราะห์ที่แตกต่างกัน subproteomes แสดงโดยจุลินทรีย์ ( รูปที่ 1 ) การวิเคราะห์ subproteomes เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าที่จะได้รับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับปัญหาที่เฉพาะเจาะจง : เยื่อหุ้มเซลล์โปรตีนรูปแบบสามารถเปิดเผยการขนส่ง [ 24 ] และ ตั้งแต่ก่อนการปรับเปลี่ยนสภาพแวดล้อมที่เป็นมิตรมากขึ้นในระดับซองจดหมาย , วิถีการต้านทานความเครียด [ 25 ] บนมืออื่น ๆที่มีพื้นผิวและ proteomes ช่วยพิมพ์แบคทีเรียโปรไบโอติกโดยอธิบายสิ่งที่เกิดขึ้นในแบคทีเรียเจ้าบ้านอินเตอร์เฟซ ในบริบทนี้ มากล่าสุดรายงานกระดาษ [ Le Marechal 26 ] อธิบายสามวิธีการกู้คืนคีย์พื้นผิวโปรตีนที่เกี่ยวข้องในการปรับภูมิคุ้มกันใน Propionibacterium : .