Primers targeting the ipaH,mxiC and

Primers targeting the ipaH,mxiC and virB genes of Shigella and EIEC
were designed using Clone Manager 9 (Scientific & Educational Soft-
ware, Durham, NC), based on the virulence plasmid and genome se-
quences of Shigella and EIEC available at GenBank (Accession Nos.
CP001064, NC_010660, NC_004851, NC_007607, NC_007385,
AL391753, AF348706, NC_007608, NC_004851 and AY879342 for the
virulence plasmid sequences and NZ_AAKB02000001, NC_010658,
NC_007613, NC_007606, AE005674, NC_008258, AE014073 and
NC_007384 for the complete genome sequences). RB87 (50
-
CGGTCAGCCACCCTCTGAG-30
)andRB88(50
-CTTGACCGCCTTTCCGA-
TACC-30
) target the multicopy ipaH gene, yielding a 613 bp amplifica-
tion product. RB89 (50
-AAGTTCTGACGCGATTGG-30
)andRB90(50
-
TGTACGCGATCAAGAATCCC-30
)targetthe virB virulencegenelocated
on the virulence plasmid, yielding a 415 bp amplification product.
RB110 (50
-CGAGCTGTAATGCTTATGAGT-30
)andRB111(50
-TCAT-
GACTGGCTCGTGATAC-30
)targetthe mxiC virulence gene located on
the virulence plasmid, creating a 232 bp amplification product inwild-
type Shigella strains or a 1050 bp amplicon in the 2457Mcontrol strain.
All primers were manufactured by Integrated DNA Technologies, Inc.
(Coralville, IA), resuspended in sterile water to a 100 pmol/mlconcen-
tration each, and stored at 20 C. A primer working mix containing
100 mlRB87 þ 100 mlRB88 þ 400 mlRB89 þ 400 mlRB90 þ 400 ml
RB110þ400mlRB111was combined, aliquoted into smaller volumes to
limit successive freeze/thaw cycles, and stored at 20 C.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไพรเมอร์ที่ยีน ipaH, mxiC และ virB ของ Shigella และ EIEC การกำหนดเป้าหมายถูกออกแบบโดยใช้โคลนผู้จัดการ 9 (Scientific และ Soft-ศึกษาพัสดุ เดอแรม NC), ตาม virulence plasmid และจีโนม se -quences ของ Shigella และ EIEC GenBank (หมายเลขทะเบียนCP001064, NC_010660, NC_004851, NC_007607, NC_007385AL391753, AF348706, NC_007608, NC_004851 และ AY879342 สำหรับการลำดับ virulence plasmid และ NZ_AAKB02000001, NC_010658NC_007613, NC_007606, AE005674, NC_008258, AE014073 และNC_007384 ลำดับกลุ่มสมบูรณ์) RB87 (50-CGGTCAGCCACCCTCTGAG-30) andRB88 (50-CTTGACCGCCTTTCCGA-TACC-30) เป้าหมายยีน multicopy ipaH ผลผลิต 613 bp amplifica -ผลิตภัณฑ์สเตรชัน RB89 (50-AAGTTCTGACGCGATTGG-30) andRB90 (50-TGTACGCGATCAAGAATCCC-30) targetthe virB virulencegenelocatedบน virulence plasmid ผลผลิตผลิตภัณฑ์ amplification bp 415RB110 (50-CGAGCTGTAATGCTTATGAGT-30) andRB111 (50-TCAT-GACTGGCTCGTGATAC-30) targetthe mxiC virulence ยีนอยู่plasmid virulence สร้างผลิตภัณฑ์ amplification bp 232 inwild-ชนิดสายพันธุ์ของ Shigella หรือ amplicon bp 1050 ในสายพันธุ์ 2457Mcontrolไพรเมอร์ทั้งหมดถูกผลิต โดยรวมดีเอ็นเอเทคโนโลยี inc(Coralville, IA), resuspended ในน้ำกอซ pmol/mlconcen เป็น 100-tration ละ และจัดเก็บที่ 20 เซลเซียส แนวทางสำหรับการทำงานที่ประกอบด้วยส่วนผสม100 mlRB87 þ 100 mlRB88 þ 400 mlRB89 þ 400 mlRB90 þ 400 mlRB110þ400mlRB111was รวม aliquoted เป็นวอลุ่มขนาดเล็กไปจำกัดรอบแช่แข็งต่อเนื่อง thaw และเก็บที่ 20 เซลเซียส

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไพรเมอร์กำหนดเป้าหมาย ipaH, mxiC และยีน virB ของ Shigella และ EIEC
ได้รับการออกแบบโดยใช้ผู้จัดการโคลน 9
(ทางวิทยาศาสตร์สายคและการศึกษานุ่มเครื่อง, Durham, NC) บนพื้นฐานของพลาสมิดรุนแรงและจีโนม se-
quences ของ Shigella และ EIEC ที่มีอยู่ใน GenBank ( ภาคยานุวัติ Nos.
CP001064, NC_010660, NC_004851, NC_007607, NC_007385,
AL391753, AF348706, NC_007608, NC_004851 และ AY879342
สำหรับลำดับความรุนแรงและพลาสมิดNZ_AAKB02000001, NC_010658,
NC_007613, NC_007606, AE005674, NC_008258, AE014073 และ
NC_007384 สำหรับลำดับจีโนมที่สมบูรณ์) RB87 (50
-
CGGTCAGCCACCCTCTGAG-30) andRB88 (50 -CTTGACCGCCTTTCCGA- TACC-30) เป้าหมาย multicopy ipaH ยีนยอม 613 bp ampli CA- สายการผลิตภัณฑ์ RB89 (50 -AAGTTCTGACGCGATTGG-30) andRB90 (50 - TGTACGCGATCAAGAATCCC-30) virB targetthe virulencegenelocated. ในพลาสมิดรุนแรงที่ยอม 415 bp ampli สายผลิตภัณฑ์ไอออนบวกRB110 (50 -CGAGCTGTAATGCTTATGAGT-30) andRB111 (50 -TCAT- GACTGGCTCGTGATAC-30) targetthe ยีนรุนแรง mxiC ตั้งอยู่บนพลาสมิดรุนแรง, การสร้าง 232 bp ไอออนบวกสาย ampli สินค้า inwild- ชนิดสายพันธุ์ Shigella หรือ 1,050 bp amplicon ในสายพันธุ์ 2457Mcontrol. ไพรเมอร์ทั้งหมดถูกผลิตโดยบูรณาการดีเอ็นเอ Technologies, Inc (คอรัลวิลล์, IA) resuspended ในการฆ่าเชื้อ น้ำ 100 pmol / mlconcen- เคี้ยวแต่ละครั้งและเก็บไว้ที่ 20 องศาเซลเซียส ไพรเมอร์ผสมที่มีการทำงาน100 mlRB87 þ 100 mlRB88 þ 400 mlRB89 þ 400 mlRB90 þ 400 มล. RB110þ400mlRB111wasรวม aliquoted ลงในไดรฟ์ขนาดเล็กที่จะจำกัด การแช่แข็งต่อเนื่อง / รอบละลายและเก็บไว้ที่ 20 องศาเซลเซียส

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดยเป้าหมาย ipah mxic เวิร์บ , และยีนของชิเกลลา eiec
ออกแบบการใช้และจัดการโคลน 9 ( scienti จึง C &การศึกษานุ่ม -
สุขภัณฑ์ , Durham , NC ) ขึ้นอยู่กับความรุนแรงและพลาสมิด ( เซ -
quences ของชิเกลลา eiec ใช้ได้ที่และขนาด ( หนังสือเลขที่ cp001064 nc_010660 nc_004851
, , , nc_007607 nc_007385 al391753 af348706
, , , , nc_004851 nc_007608 ay879342 สำหรับ
, และภัยสังคมสายพันธุ์ลำดับและ nz_aakb02000001 nc_010658 nc_007613 nc_007606
, , , , nc_008258 ae005674 , และ , ae014073
nc_007384 สำหรับลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ ) rb87 ( 50
-
cggtcagccaccctctgag-30
) andrb88 ( 50
-

- cttgaccgcctttccga tacc-30 ) เป้าหมายของ ipah multicopy ผลผลิตจาก BP ampli จึง CA -
, ผลิตภัณฑ์ rb89 ( 50 aagttctgacgcgattgg-30
-
) andrb90 ( 50
-

tgtacgcgatcaagaatccc-30) targetthe เวิร์บ virulencegenelocated
บนความรุนแรงพลาส ผลผลิต 415 BP ampli จึงแลกเปลี่ยนผลิตภัณฑ์ .
rb110 ( 50 cgagctgtaatgcttatgagt-30
-
) andrb111 ( 50
-

- tcat gactggctcgtgatac-30 ) targetthe ยีนโรค mxic ตั้งอยู่บนพลาสมิด
ความรุนแรงสร้าง 232 BP ampli จึงบวกผลิตภัณฑ์ inwild -
ประเภทชิเกลลา สายพันธุ์ หรือ 1050 BP และใน 2457mcontrol
เมื่อยทั้งหมดที่ผลิต โดยเทคโนโลยีแบบบูรณาการโดยดีเอ็นเอ , Inc .
( คอรัลวิลล์ , IA ) resuspended ในฆ่าเชื้อน้ำ 100 pmol / mlconcen -
มลภาวะแต่ละ , และเก็บไว้ที่  20  C ผสมรองพื้นงานประกอบด้วย
100 mlrb87 þ 100 mlrb88 þ 400 mlrb89 þ 400 mlrb90 þ 400 ml
rb110 þ 400mlrb111was รวม aliquoted ในไดรฟ์ขนาดเล็ก ,

จำกัดรอบต่อเนื่องแช่แข็ง / ละลาย และเก็บไว้ที่  20  C