Ribotyping patterns were processed and analyzed using the
BioNumerics software (version 5.10; Applied Maths, Sint-Martens-
Latem, Belgium). Patterns were normalized using the marker band
positions of the molecular size standard, and archived to our inhouse
LAB HindIII-ribotyping database containing (in 2015) ribotyping
patterns of 383 type strains. The HindIII-ribotyping database
has proven useful and robust in identifying LAB from various food
and environmental sources (Bj€orkroth et al., 2002; Koort et al.,
2006; Rahkila et al., 2011; Vihavainen et al., 2007, 2008). Patterns
of isolates from this study were compared against each other and
those of the type strains by cluster analysis: clusters of ribopatterns
were generated based on the Dice similarity coefficient and a
dendrogram was created using the unweighted pair group method
with arithmetic mean (UPGMA) method. In the resulting dendrogram,
a ribotype was defined as either an isolate that gave a unique
ribopattern, or a group of isolates that gave indistinguishable or
highly similar patterns. Strains assigned to same ribotype with a
type strain were attributed to that species.
ribotyping รูปแบบที่ถูกประมวลผลและวิเคราะห์โดยใช้
ซอฟแวร์ BioNumerics (เวอร์ชั่น 5.10; ประยุกต์คณิตศาสตร์ Sint-Martens-
Latem, เบลเยียม) รูปแบบปกติถูกใช้เครื่องหมายวง
ตำแหน่งที่มีมาตรฐานขนาดโมเลกุลและเก็บไปชมในห้องพักของเรา
LAB HindIII-ribotyping ฐานข้อมูลที่มี (ในปี 2015) ribotyping
รูปแบบของการ 383 ชนิดสายพันธุ์ ฐานข้อมูล HindIII-ribotyping
ได้พิสูจน์แล้วว่ามีประโยชน์และมีประสิทธิภาพในการระบุ LAB จากอาหารต่างๆ
และสิ่งแวดล้อมแหล่งที่มา (Bj € orkroth, et al., 2002;. Koort, et al,
2006. Rahkila et al, 2011;. Vihavainen et al, 2007 2008) รูปแบบ
ของเชื้อจากการศึกษานี้ถูกนำมาเปรียบเทียบกับแต่ละอื่น ๆ และ
บรรดาสายพันธุ์ชนิดโดยการวิเคราะห์กลุ่ม: กลุ่ม ribopatterns
ถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานของค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงกันลูกเต๋าและ
dendrogram ถูกสร้างขึ้นโดยใช้วิธีการกลุ่มคู่ชั่ง
ที่มีค่ามัชฌิมเลขคณิต (UPGMA) วิธีการ . ใน dendrogram ที่เกิด
ribotype ถูกกำหนดเป็นอย่างใดอย่างหนึ่งที่ทำให้แยกไม่ซ้ำกัน
ribopattern หรือกลุ่มของเชื้อที่ทำให้แยกไม่ออกหรือ
รูปแบบที่คล้ายกันอย่างมาก สายพันธุ์ที่ได้รับมอบหมายให้ ribotype เดียวกันกับ
สายพันธุ์ชนิดถูกนำมาประกอบกับชนิดที่
การแปล กรุณารอสักครู่..
ribotyping แบบประมวลผลและวิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้bionumerics ซอฟต์แวร์ ( รุ่น 5.10 ; ประยุกต์คณิตศาสตร์ , ซินท์มาร์เทน -latem , เบลเยียม ) แบบปกติโดยใช้เครื่องหมาย วงดนตรีตำแหน่งมาตรฐานของขนาดโมเลกุล และเก็บไว้ในห้องของเราแล็บ - ribotyping ฐานข้อมูลที่มี ( 2015 ) ribotypingรูปแบบเป็นชนิดสายพันธุ์ การ ribotyping - ฐานข้อมูลได้พิสูจน์แล้วว่ามีประโยชน์และมีประสิทธิภาพในการระบุ Lab จากอาหารต่าง ๆและแหล่งข้อมูลด้านสิ่งแวดล้อม ( BJ orkroth et al . , 2002 ; koort et al . ,2006 ; rahkila et al . , 2011 ; ตี้ ไว เวเนน et al . , 2007 , 2008 ) รูปแบบของที่แยกได้จากการศึกษานี้ถูกนำไปเปรียบเทียบกับแต่ละอื่น ๆและบรรดาประเภทสายพันธุ์ โดยการวิเคราะห์กลุ่ม : กลุ่มของ ribopatternsถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานของความคล้ายคลึงกันระหว่างลูกเต๋าและเดนโดรแกรมที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้วิธีการถ่วงน้ำหนักกลุ่มคู่ด้วยค่าเฉลี่ย ( UPGMA ) วิธี พันธุกรรมในผล ,เป็น ribotype ถูกกำหนดไว้ เป็นการแยกที่ให้กันribopattern หรือกลุ่มของสายพันธุ์ที่ให้แยก หรือรูปแบบคล้ายคลึงกันอย่างมาก สายพันธุ์เดียวกันกับ ribotype มอบหมายชนิดสายพันธุ์ถูกประกอบกับที่ชนิด
การแปล กรุณารอสักครู่..