Strains and culture conditionsOur r

Strains and culture conditions

Our re-identification of Fusarium strains in the CBS-KNAW collection was based on BLAST analysis in GenBank using sequences of the following genes: internal transcribed spacer region (ITS; White et al. 1990), partial nuclear large subunit (LSU; Hopple & Vilgalys 1999), elongation factor 1α (TEF1; O'Donnell et al. 1998), the second largest subunit of RNA polymerase (RPB2; Reeb et al. 2004), and β-tubulin (BT2; Glass and Donaldson, 1995 and O'Donnell and Cigelnik, 1997) ( Table 1). A total of 100 Fusarium strains were isolated during June of two consecutive years (2007–2008), Fusarium species associated with fig fruit samples of two non-edible fig cultivars [Danesefid and Pouzdonbali of Capri fig (Ficus carica cv. Capri)] were isolated from Estahban and EiJ areas of Fars province. Edible fig samples were collected from Calimyrna trees (Ficus carica cv. Calimyrna) of Estahban during harvest time, before processing, during processing stages and after packaging in October and November of 2008 and 2009. Fig fruits were cultured on potato dextrose agar (PDA, Merck, Whitehouse Station, NJ, U.S.A.) and incubated at 25 °C for 5–7 d. Preliminary identification was done using morphological characteristics observed on carnation leaf agar (CLA) medium. Based on the morphological identification, representatives of seven strains were sent to the CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre, Utrecht, The Netherlands, for further characterization.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สายพันธุ์และเงื่อนไขวัฒนธรรมใหม่ประจำตัวประชาชนของเราสายพันธุ์เชื้อรา Fusarium ในคอลเลกชันซีบีเอส KNAW อยู่บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ระเบิดใน GenBank โดยใช้ลำดับของยีนดังต่อไปนี้คัดลอกภูมิภาค spacer ภายใน (ITS; สีขาว et al, 1990.) หน่วยย่อยที่มีขนาดใหญ่บางส่วนนิวเคลียร์ ( LSU; Hopple และ Vilgalys 1999) ปัจจัยการยืดตัว1α (TEF1; ดอนเนลล์ et al, 1998) ซึ่งเป็นหน่วยย่อยใหญ่อันดับสองของโพลิเมอร์อาร์เอ็นเอ (RPB2.. Reeb et al, 2004) และβ-tubulin (BT2; แก้วและโดนัลด์ 1995 และดอนเนลล์และ Cigelnik 1997) (ตารางที่ 1) ทั้งหมด 100 สายพันธุ์เชื้อรา Fusarium ที่แยกได้ในช่วงเดือนมิถุนายนของสองปีติดต่อกัน (2007-2008), สายพันธุ์เชื้อรา Fusarium ที่เกี่ยวข้องกับผลไม้มะเดื่อตัวอย่างของทั้งสองสายพันธุ์มะเดื่อที่ไม่กิน [Danesefid และ Pouzdonbali คาปรีมะเดื่อ (Ficus carica พันธุ์. คาปรี)] เป็น แยกออกจากพื้นที่และ Estahban EIJ ของจังหวัดฟาร์ส ตัวอย่างรูปที่กินที่ถูกเก็บรวบรวมจากต้นไม้ Calimyrna (Ficus carica พันธุ์. Calimyrna) ของ Estahban ในช่วงเวลาการเก็บเกี่ยวก่อนที่จะประมวลผลในระหว่างขั้นตอนการประมวลผลและหลังการบรรจุภัณฑ์ในเดือนตุลาคมและเดือนพฤศจิกายนของปี 2008 และ 2009 รูปผลไม้ที่เพาะเลี้ยงในอาหารเลี้ยงเชื้อเดกซ์โทรสมันฝรั่ง (PDA, เมอร์ค, สถานีทำเนียบขาว, นิวเจอร์ซีย์สหรัฐอเมริกา) และบ่มที่อุณหภูมิ 25 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5-7 วัน การระบุเบื้องต้นได้รับการดำเนินการโดยใช้ลักษณะทางสัณฐานวิทยาพบในอาหารเลี้ยงเชื้อใบดอกคาร์เนชั่น (CLA) ขนาดกลาง ขึ้นอยู่กับการระบุก้านตัวแทนของเจ็ดสายพันธุ์ที่ถูกส่งไปยังซีบีเอส KNAW เชื้อราศูนย์ความหลากหลายทางชีวภาพ, อูเทรค, เนเธอร์แลนด์สำหรับตัวละครต่อไป

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สายพันธุ์ และเพาะเลี้ยง

ของเราอีกครั้งการจำแนกสายพันธุ์ Fusarium ใน cbs-knaw คอลเลกชันถูกใช้ในการวิเคราะห์ระเบิดบริเวณโดยใช้ลำดับของยีนดังต่อไปนี้ ภายในเขตของตน และ spacer ( สีขาว et al . 1990 ) , บางส่วนนิวเคลียร์ขนาดใหญ่ subunit ( LSU ; hopple & vilgalys 1999 ) การยืดตัว ปัจจัยที่ 1 α ( tef1 ; ดอนเนลล์ et al . 1998 )ส่วนใบที่สองที่ใหญ่ที่สุดของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส ( rpb2 ; รีบ et al . 2004 ) และบีตา - ทิวบูลิน ( 2 บาท ; แก้วและโดนัลด์ , 1995 และเนล และ cigelnik , 1997 ) ( ตารางที่ 1 ) ทั้งหมด 100 สายพันธุ์ ที่แยกได้ในช่วงเดือนมิถุนายนของฟูซาเรียมสองปีติดต่อกัน ( 2007 – 2008 )Fusarium ชนิดที่เกี่ยวข้องกับมะเดื่อผลไม้ตัวอย่างสองกินมะเดื่อพันธุ์ [ danesefid pouzdonbali คาปรีและมะเดื่อ ( Ficus ซึ่งไม่ใช่พันธุ์ คาปรี ) ] และพื้นที่ที่แยกได้จาก estahban eij ฟาร์สจังหวัด ตัวอย่างรูปที่ได้จากการเก็บ calimyrna ( Ficus ต้นไม้ยางพันธุ์ calimyrna ) ของ estahban ช่วงเวลาเก็บเกี่ยวก่อนการประมวลผลในระหว่างขั้นตอนการประมวลผล และหลังจากการบรรจุในเดือนตุลาคมและพฤศจิกายนของปี 2008 และ 2009 ผลไม้มะเดื่อถูกเพาะเลี้ยงในอาหารเลี้ยงเชื้อ potato dextrose agar ( Merck ไวต์เฮาส์ , PDA , สถานี , NJ , USA ) และอุณหภูมิ 25 ° C 5 – 7 วัน เบื้องต้นกำหนด โดยใช้ลักษณะที่สังเกตบนอาหารวุ้นใบคาร์เนชั่น ( CLA ) ปานกลาง ขึ้นอยู่กับการกำหนดลักษณะทางสัณฐานวิทยาตัวแทนของเจ็ดสายพันธุ์ที่ถูกส่งไป cbs-knaw เชื้อราความหลากหลายทางชีวภาพศูนย์ , Utrecht , เนเธอร์แลนด์ , สำหรับคุณสมบัติเพิ่มเติม