The complete viral genome was ampli

The complete viral genome was amplified by using 8 overlapping subgenomic fragments (Figure 1). Thermocycling conditions and sequences for primers 58, 409, 730, 1101, 1450, 1860, 2440, and 2853 were obtained from Hu et al. (20). Additional primers used were 1575 (5′-CCGGCAGATGAGAAGGCACAGACGG-3′), 1528 (5′-ACCTCTCTTTACGCGGTCTC-3′), 1552 (5′-TCTGTGCCTTCTCATCTGCC-3′), 1800 (5′-AGACCAATTTATGCCTACAGCCTCCTA-3′), 1803 (5′-CGCAGACCAATTTATGCCTAC–3′), 1898 (5′-GGCATGGACATTGACCCGTA-3′), 1921 (5′-TTTATACGGGTCAATGTC-3′), 2800 (5′-CAGGTAGCGCCTCATTTTGTGGGTCACCATATTCT-3′), and 2898 (5′-GAGGATTGGGAACAGAAAGATT-3′). All nucleotide numbering refers to the position from the EcoRI site as position 1.
Amplicons were sequenced directly by using the BigDye Terminator version 3.1 Cycle Sequencing Ready Reaction Kit (Applied Biosystems., Foster City, CA, USA) and sequenced on an ABI3130xl Genetic Analyzer with 16 capillaries (Applied Biosystems) and the same primers that were used for amplification. The sequence has been deposited in GenBank under accession no. JX507080. The HBV genomic sequence obtained from the baboon was compared with corresponding sequences of HBV from GenBank as described (4).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จีโนมของไวรัสที่สมบูรณ์ได้รับการขยายโดยใช้ชิ้นส่วนที่ 8 subgenomic ที่ทับซ้อนกัน (รูปที่ 1) เงื่อนไขและลำดับ thermocycling กับไพรเมอร์ 58, 409, 730, 1101, 1450, 1860, 2440, และ 2853 ที่ได้รับจาก hu ตอัล (20) ไพรเมอร์ที่ใช้เพิ่มเติมได้ 1575 (5'-ccggcagatgagaaggcacagacgg-3 '), 1528 (5'-acctctctttacgcggtctc-3'), 1552 (5'-tctgtgccttctcatctgcc-3 '),1800 (5'-agaccaatttatgcctacagcctccta-3 '), 1803 (5'-cgcagaccaatttatgcctac-3'), 1898 (5'-ggcatggacattgacccgta-3 '), 1921 (5'-tttatacgggtcaatgtc-3'), 2800 (5'-caggtagcgcctcattttgtgggtcaccatattct -3 ') และ 2898 (5'-gaggattgggaacagaaagatt-3') ทุกหมายเลขเบื่อหน่ายหมายถึงตำแหน่งจากเว็บไซต์ EcoRI เป็นตำแหน่ง 1.
amplicons มีลำดับขั้นตอนได้โดยตรงโดยใช้รุ่น 3.1 bigdye ยุติวงจรลำดับชุดปฏิกิริยาพร้อม (ศาสตร์ในการใช้. เมืองอุปถัมภ์แคลิฟอร์เนียประเทศสหรัฐอเมริกา) และติดใจกับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม abi3130xl กับ 16 เส้นเลือดฝอย (ศาสตร์ประยุกต์) และไพรเมอร์เดียวกันกับที่ถูกนำมาใช้ การขยาย ลำดับที่ได้รับการฝากไว้ใน GenBank ภายใต้การเข้าไม่ jx507080ไวรัสตับอักเสบบีลำดับจีโนมที่ได้รับจากลิงบาบูนที่ถูกเมื่อเทียบกับลำดับสอดคล้องกันของไวรัสตับอักเสบบีจาก genbank ตามที่อธิบายไว้ (4)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กลุ่มไวรัสสมบูรณ์ถูกขยายโดยแยก 8 เหลื่อม subgenomic ส่วน (รูปที่ 1) Thermocycling เงื่อนไขและลำดับสำหรับไพรเมอร์ 58, 409, 730 คะแนน 1101, 1450, 1860, 2440 และ 2853 ได้รับจาก Hu et al. (20) ไพรเมอร์เพิ่มเติมใช้ได้ 1575 (5′-CCGGCAGATGAGAAGGCACAGACGG-3′), และกำแพงเพชร (5′-ACCTCTCTTTACGCGGTCTC-3′), 1552 (5′-TCTGTGCCTTCTCATCTGCC-3′), 1800 (5′-AGACCAATTTATGCCTACAGCCTCCTA-3′), 1803 (5′-CGCAGACCAATTTATGCCTAC–3′), 1898 (5′-GGCATGGACATTGACCCGTA-3′), 1921 (5′-TTTATACGGGTCAATGTC-3′), 2800 (5′-CAGGTAGCGCCTCATTTTGTGGGTCACCATATTCT-3′), แล้ว 2898 (5′-GAGGATTGGGAACAGAAAGATT-3′) ลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งหมดอ้างอิงตำแหน่งจากไซต์ EcoRI เป็นตำแหน่ง 1.
Amplicons ถูกเรียงลำดับโดยตรง โดยใช้การ BigDye เทอร์มิเนเตอร์รุ่น 3.1 วงจรลำดับเบสพร้อมปฏิกิริยาชุด (ใช้ Biosystems ฟอสเตอร์ City, CA, USA) และตามลำดับการวิเคราะห์พันธุกรรม ABI3130xl กับเส้นเลือดฝอย 16 (Biosystems ใช้) และไพรเมอร์เดียวกันที่ใช้สำหรับขยายการ ลำดับที่ได้รับฝากไว้ใน GenBank ภายใต้ทะเบียนไม่ JX507080 ลำดับ genomic ด้วยขั้นได้จากลิงบาบูนถูกเปรียบเทียบกับลำดับที่สอดคล้องกันของด้วยขั้นจาก GenBank เป็นอธิบาย (4)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ยีนร่องรอยของไวรัสที่สมบรูณ์แบบเป็นแอมพลิฟายโดยการใช้ 8 เศษ subgenomic ทับซ้อนกัน(รูปที่ 1 ) thermocycling ลำดับและเงื่อนไขสำหรับ primers 584097301101 พร้อมตั้งเวลา 1450 ปี 18602440 และ 2853 ได้จากประธานาธิบดีหู et al . ( 20 ). primers เพิ่มเติมใช้ 1575 ( 5 ' - ccggcagatgagaaggcacagacgg - 3 ') 1528 ( 5 ' - acctctctttacgcggtctc - 3 ') 1552 ( 5 ' - tctgtgccttctcatctgcc - 3 ')ยีนร่องรอยของไวรัสที่สมบรูณ์แบบเป็นแอมพลิฟายโดยการใช้ 8 เศษ subgenomic ทับซ้อนกัน(รูปที่ 1 ) thermocycling ลำดับและเงื่อนไขสำหรับ primers 584097301101 พร้อมตั้งเวลา 1450 ปี 18602440 และ 2853 ได้จากประธานาธิบดีหู et al . ( 20 ). primers เพิ่มเติมใช้ 1575 ( 5 ' - ccggcagatgagaaggcacagacgg - 3 ') 1528 ( 5 ' - acctctctttacgcggtctc - 3 ') 1552 ( 5 ' - tctgtgccttctcatctgcc - 3 ')1800 ( 5 ' - agaccaatttatgcctacagcctccta - 3 ') 1803 ( 5 ' - cgcagaccaatttatgcctac - 3 ')ปี 1898 ( 5 ' - ggcatggacattgacccgta - 3 ') 1921 ( 5 ' - tttatacgggtcaatgtc - 3 ') 2800 ( 5 ' - caggtagcgcctcattttgtgggtcaccatattct - 3 ')และ .2898 ( 5 ' - gaggattgggaacagaaagatt - 3 ') nucleotide ทั้งหมดการกำหนดหมายเลขอ้างอิงถึงตำแหน่งออกจากเว็บไซต์ ecori ที่เป็นตำแหน่ง 1 .
ลำดับ genomic hbv ที่ได้รับจากลิงหน้าหมูที่เป็นลำดับเมื่อเทียบกับที่เกี่ยวข้องของ hbv จากเลี้ยงดูตามที่อธิบายไว้( 4 )amplicons เป็นอักษรเรียงลำดับ\โดยตรงโดยใช้ bigdye เพชฌฆาตเวอร์ชัน 3.1 การจัดลำดับการตอบสนองพร้อมชุด(ใช้ biosystems ., Foster City , CA ,สหรัฐอเมริกา)และอักษรเรียงลำดับ\ที่ ABI 3130 ขนาด XL พันธุกรรมตัววิเคราะห์ความสมบูรณ์พร้อมด้วย 16 capillaries (ใช้ biosystems )และที่เหมือนกับ primers ที่ถูกนำไปใช้เพื่อการขยายสัญญาณเสียง. ตามลำดับที่ได้รับการเก็บรักษาไว้ในเลี้ยงดูตาม ภาค ยานุวัติฉบับที่ jx507080 .