RESULTS AND DISCUSSION The high deg

RESULTS AND DISCUSSION The high degree of SSR polymorphism that was observed
Out of 86 primers tested, 51 produced other crop species [17, 18]. About 31% of the of SSR
non-polymorphic fragments, 1 gave non-scorable band markers were polymorphic in all cassava genotypes under
and 3 had no amplification. The remaining 31 primers study. SSR markers have been used to study genetic
amplified from 1 to 24 polymorphic fragments which diversity in a large number of plant species, including
ranged from 50 to 500 bp. Polymorphic and monomorphic wheat, sunflower and many other crops. In this study,
SSR loci were detected (Fig 1). In some cases, it could not they also showed clear distinctions in the cassava
be unambiguously determined whether a particular SSR genotypes.
locus was monomorphic or polymorphic. However, as In addition to measuring genetic diversity,
shown in Fig.1, lanes with no bands were observed, verification in mutual relatedness of these cassava
indicating either absence of alleles (null alleles) or alleles genotypes from different regions in Africa was
below the detection limit. Due to the limited resolution of assessed. The dendrogram constructed on NTSYS
the SFR gels to about 5 bp, the number of alleles using similarity index based on UPGMA showed
determined in this assay, represent a minimum estimate. genetic similarity among cassava genotypes, with the
The actual number of alleles per locus as well as the coefficient of genetic similarity ranging from 0.43 to
number of alleles per genotypes may be higher. 0.86. At 0.70 similarity coefficient, the 24 cassava
For some SSR loci, the bands observed on the SFR genotypes clustered into ten main groups (Table 2).
gels were larger than the expected size, based on the There was a strong genetic relationship between the
predicted location of the primers on the sequence. Nigeria landraces and strong similarities between
Since the primers for PCR were based on cDNA TME 1786 from Kenya and TME 530 from
sequences while the PCR reaction for amplification of the Malawi and between TME 225, TME 638 and TME 568
SSR was carried out on genomic DNA, these larger bands (Fig.2). This indicates the strength of SSR markers in
most likely indicate the presence of intron sequences. detecting relationships and diversity among germplasm.
in cassava in this study is comparable to the results of
Fig. 1: Allelic variation of selected SSR loci of cassava genotypes
a: Example

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลการอภิปรายและโพลีมอร์ฟิซึม SSR ที่ถูกตรวจสอบในระดับสูงจากไพรเมอร์ 86 ทดสอบ 51 ผลิตชนิดพืชอื่น ๆ [17, 18] ประมาณ 31% ของการของ SSRชิ้นส่วนไม่ใช่ polymorphic, 1 ให้กับวง scorable ไม่ใช่เครื่องหมายมี polymorphic ในการศึกษาจีโนไทป์มันสำปะหลังทั้งหมดภายใต้และ 3 ขยายไม่ ไพรเมอร์ 31 เหลือศึกษา การใช้เครื่องหมาย SSR เพื่อศึกษาทางพันธุกรรมขยายจาก 1 เป็น 24 polymorphic fragments ที่ความหลากหลายในจำนวนพืชชนิด รวมถึงอยู่ในช่วง 50 ถึง 500 bp. Polymorphic และ monomorphic ข้าวสาลี ทานตะวันและพืชอื่น ๆ ในการศึกษานี้SSR loci พบ (ฟิก 1) ในบางกรณี มันไม่สามารถจะแสดงให้เห็นความชัดเจนในมันสำปะหลังยังไม่กำกวมสามารถกำหนดว่าการศึกษาจีโนไทป์ SSR เฉพาะโลกัสโพลเป็น monomorphic หรือ polymorphic อย่างไรก็ตาม ในที่นี้วัดความหลากหลายทางพันธุกรรมแสดงในภาพ ถนนหนทางกับวงไม่ได้สังเกต ตรวจสอบใน relatedness ซึ่งกันและกันของมันสำปะหลังเหล่านี้แสดงของ alleles (null alleles) อย่างใดอย่างหนึ่งหรือศึกษาจีโนไทป์ของ alleles จากภูมิภาคต่าง ๆ ในทวีปแอฟริกาได้ขีดจำกัดการตรวจสอบ เนื่องจากความจำกัดของประเมิน Dendrogram ที่สร้างขึ้นบน NTSYSเจ SFR จะให้ประมาณ 5 bp จำนวน alleles ที่ใช้ยึด UPGMA พบดัชนีความคล้ายคลึงกันกำหนดในการทดสอบนี้ หมายถึงการประเมินขั้นต่ำ ความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมระหว่างศึกษาจีโนไทป์ของมันสำปะหลัง มีการจำนวนที่แท้จริงของ alleles ต่อโลกัสโพลเป็นค่าสัมประสิทธิ์ของความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมตั้งแต่ 0.43 ถึงจำนวน alleles ต่อศึกษาจีโนไทป์อาจจะสูงกว่า 0.86 การที่สัมประสิทธิ์คล้าย 0.70 มันสำปะหลัง 24สำหรับบาง SSR loci วงดนตรีที่พบในการศึกษาจีโนไทป์ SFR จับกลุ่มเป็นกลุ่มหลักสิบ (ตาราง 2)เจมีขนาดใหญ่กว่าขนาดที่คาดไว้ ตามมีมีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่ดีระหว่างการสถานที่คาดการณ์ของไพรเมอร์ในลำดับ Landraces ไนจีเรียและความแข็งแกร่งเหมือนระหว่างเนื่องจากไพรเมอร์สำหรับ PCR ถูกใช้ cDNA 1786 แต่งตั้งจากเคนยาและ 530 แต่งตั้งจากลำดับในขณะที่ปฏิกิริยา PCR สำหรับขยาย ของมาลาวี และ ระหว่างแต่งตั้ง 225, 638 แต่งตั้งแต่งตั้ง 568SSR ถูกดำเนินการบน genomic DNA เหล่านี้วงใหญ่ (Fig.2) บ่งชี้ความแรงของเครื่องหมาย SSR ในจะระบุสถานะของ intron ลำดับ ตรวจสอบความสัมพันธ์และความหลากหลายระหว่าง germplasmในมันสำปะหลังในการศึกษานี้จะเทียบได้กับผลลัพธ์ของFig. 1: Allelic ผันแปรของเลือก SSR loci ของมันสำปะหลังa:ตัวอย่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

และอภิปรายผลระดับสูงของความแตกต่าง SSR ที่ถูกตั้งข้อสังเกต
จาก 86 ไพรทดสอบผลิต 51 สายพันธุ์พืชอื่น ๆ [17, 18] เกี่ยวกับ 31% ของของ SSR
ชิ้นส่วนที่ไม่ polymorphic 1 ให้เครื่องหมายวงดนตรีที่ไม่ scorable เป็น polymorphic ในทุกสายพันธุ์มันสำปะหลังภายใต้
และ 3 มีการขยายไม่มี ส่วนที่เหลืออีก 31 ไพรศึกษา เครื่องหมาย SSR ได้รับการใช้ในการศึกษาทางพันธุกรรม
ขยาย 1-24 เศษ polymorphic ซึ่งความหลากหลายในจำนวนมากของสายพันธุ์พืชรวมทั้ง
อยู่ในช่วง 50-500 bp ข้าวสาลี Polymorphic และดีเอ็นเอทานตะวันและพืชอื่น ๆ อีกมากมาย ในการศึกษานี้
loci SSR ตรวจพบ (รูปที่ 1) ในบางกรณีก็ไม่สามารถที่พวกเขายังแสดงให้เห็นความแตกต่างที่ชัดเจนในมันสำปะหลัง
ได้รับการพิจารณาอย่างไม่น่าสงสัยว่าจะเป็นยีน SSR โดยเฉพาะอย่างยิ่ง.
สถานทีเป็น monomorphic หรือ polymorphic อย่างไรก็ตามในขณะที่นอกเหนือจากการวัดความหลากหลายทางพันธุกรรม
ที่แสดงในรูปที่ 1 เลนกับวงไม่ถูกตั้งข้อสังเกตการตรวจสอบในสัมพันธ์ร่วมกันของมันสำปะหลังเหล่านี้
แสดงให้เห็นทั้งตัวตนของอัลลีล (อัลลีล null) หรือยีนอัลลีลจากภูมิภาคต่างๆในทวีปแอฟริกาเป็น
ดังต่อไปนี้ ขีด จำกัด ของการตรวจสอบ เนื่องจากมติที่ จำกัด ในการประเมิน dendrogram สร้างขึ้นบน NTSYS
เจล SFR ไปประมาณ 5 bp จำนวนของอัลลีลโดยใช้ดัชนีความคล้ายคลึงกันขึ้นอยู่กับ UPGMA แสดงให้เห็น
ความมุ่งมั่นในการทดสอบนี้เป็นตัวแทนของประมาณการขั้นต่ำ ความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมของยีนมันสำปะหลังกับ
ตัวเลขจริงของอัลลีลต่อทางเดินเช่นเดียวกับค่าสัมประสิทธิ์ของความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมตั้งแต่ 0.43 การ
จำนวนของอัลลีลต่อยีนอาจจะสูง 0.86 ที่ 0.70 ค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงกัน 24 มันสำปะหลัง
สำหรับบาง loci SSR วงตั้งข้อสังเกตเกี่ยวกับยีน SFR คลัสเตอร์เป็นสิบกลุ่มหลัก (ตารางที่ 2).
เจลมีขนาดใหญ่กว่าขนาดที่คาดว่าจะขึ้นอยู่กับการมีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่แข็งแกร่งระหว่างเป็น
ที่คาดการณ์ไว้ สถานที่ตั้งของไพรลำดับ ไนจีเรียพื้นเมืองและความคล้ายคลึงกันที่แข็งแกร่งระหว่าง
ตั้งแต่ไพรเมอร์สำหรับ PCR อยู่บนพื้นฐานของ cDNA TME 1786 จากเคนยาและ TME 530 จาก
ลำดับในขณะที่ปฏิกิริยา PCR สำหรับการขยายของมาลาวีและระหว่าง TME 225, 638 และ TME TME 568
SSR ได้รับการดำเนินการในดีเอ็นเอ เหล่านี้วงดนตรีขนาดใหญ่ (รูปที่ 2) นี้แสดงให้เห็นความแข็งแรงของเครื่องหมาย SSR ใน
ส่วนใหญ่จะระบุตัวตนของลำดับ Intron การตรวจสอบความสัมพันธ์และความหลากหลายทางพันธุกรรมในหมู่.
ในมันสำปะหลังในการศึกษาครั้งนี้เทียบได้กับผลที่ได้จาก
รูป 1: การเปลี่ยนแปลง allelic ที่เลือก loci SSR ของยีนมันสำปะหลัง
: ตัวอย่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลและการอภิปรายระดับสูงของ SSR ) ที่พบ
จาก 86 ชนิดทดสอบ 51 ผลิตพืชชนิดอื่น ๆ [ 17 , 18 ) เกี่ยวกับ 31% ของ SSR
ไม่ใช่ polymorphic เศษ 1 ให้เครื่องหมายวง scorable โนน ( polymorphic ในมันสำปะหลังพันธุ์ภายใต้
3 ไม่มีการเพิ่ม . เหลืออีก 31 ได้ทำการศึกษา SSR markers ถูกใช้เพื่อศึกษาพันธุกรรม
ขยายจาก 1 ถึง 24 เศษที่มีความหลากหลายซึ่งเป็นจำนวนมากของสายพันธุ์ของพืช รวมทั้ง
ตั้งแต่ 50 ถึง 500 BP . จำนวน monomorphic และข้าวสาลี เมล็ดทานตะวัน และพืชอื่น ๆ อีกมากมาย ในการศึกษานี้พบว่ามี SSR
ตามลำดับ ( ตารางที่ 1 ) ในบางกรณีมันอาจจะไม่ได้มีความแตกต่างที่ชัดเจนในมันสำปะหลัง
เป็นกันกำหนดว่าเมื่อ
SSR โดยเฉพาะความเชื่อคือ monomorphic หรือจำนวน . อย่างไรก็ตาม นอกเหนือจากการวัดความหลากหลายทางพันธุกรรม ,
แสดง” เส้นทางที่ไม่มีวง พบว่ามีการตรวจสอบในสัมพันธ์ซึ่งกันและกันเหล่านี้แสดงให้มันสำปะหลัง
ขาดอัลลีล ( null อัลลีล ) หรือยีนพันธุ์จากภูมิภาคต่างๆในแอฟริกาใต้
ใต้ขีดจำกัด . เนื่องจากการ จำกัด ความละเอียดของการประเมินสร้างแผนภูมิเดนโดรแกรม NTSYS
เจลที่ใช้ในการประมาณ 5 สัปดาห์ จำนวนของยีนโดยใช้ค่าดัชนีความเหมือนโดย UPGMA พบ
มุ่งมั่นในการทดสอบนี้แสดงประมาณการขั้นต่ำ ความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมของพันธุ์มันสำปะหลังด้วย
ตัวเลขจริงของอัลลีลต่อความเชื่อ ตลอดจนค่าความเหมือนทางพันธุกรรมระหว่าง 0.43
จำนวนอัลลีลต่อพันธุ์อาจจะสูงกว่า 086 . ในความเหมือนเท่ากับ 0.70 , 24 มันสำปะหลัง
บางโลไซ SSR , วงสังเกตบน SFR พันธุ์เป็นกลุ่มเป็นกลุ่มหลัก 10 ( ตารางที่ 2 ) .
เจลมีขนาดใหญ่กว่าที่คาดขนาดขึ้นอยู่กับมีแข็งแรงความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่าง
ทำนายตำแหน่งของดีเอ็นเอในลำดับ ไนจีเรีย landraces และความคล้ายคลึงกันระหว่าง
แข็งแรงเพราะไพรเมอร์สำหรับ PCR ตามสายพันธุ์ TME 1786 จากเคนยาและ TME 530 จาก
ลำดับในขณะที่เพื่อตรวจหาสำหรับเด็กของมาลาวีและระหว่าง TME 225 , TME แล้วแม่เรา
SSR ได้ดําเนินการในดีเอ็นเอ วงเหล่านี้มีขนาดใหญ่ขึ้น ( fig.2 ) นี้บ่งชี้ว่า ความแข็งแกร่งของเครื่องหมาย SSR ใน
น่าจะบ่งชี้ของ iNtRON ลำดับการตรวจหาความสัมพันธ์และความหลากหลายของเชื้อพันธุกรรม
ในมันสำปะหลังในการศึกษานี้ได้ผล
รูปที่ 1 : การเปลี่ยนแปลง allelic คัดเลือก SSR โลกัสของพันธุ์มันสำปะหลัง
: ตัวอย่างเช่น