rRNA-targeted oligonucleotide probe

rRNA-targeted oligonucleotide probes were synthesised and labelled by Sigma-Aldrich (Steinheim, Germany). EUB338-I (Amann et al. 1990)andEUB338-IIand EUB338-III (Daims et al. 1999)wereusedinanequimolar mixture at different formamide concentrations. To detect the genus Geobacter, an equimolar mixture of the 16S rRNA targeted probes Geo1A and Geo1B was used at a 35% formamide concentration. Geo1A is specific for G. sulfur- reducens, Geobacter hydrogenophilus, Geobacter grbiciae and G. metallireducens; Geo1B detects most other Geo- bacter species (Demaneche et al. 2008).Todetectthe Ruminococcaceae group members Ruminococcus bromii, Clostridium sporosphaeroides and Clostridium leptum, the Rbro730 probe (Harmsen et al. 2002)wasapplied in the presence of 20% formamide. To detect most mem- bers of Clostridium clusters I and II, the Chis150 probe (Collins et al. 1994;Franksetal.1998)wasusedwith 35% formamide.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป้าหมายของ rRNA oligonucleotide หัว synthesised และฉลาก โดย Sigma Aldrich (Steinheim เยอรมัน) EUB338-ฉัน (Amann et al. 1990) EUB338 andEUB338-IIand-ส่วนผสม wereusedinanequimolar III (Daims et al. 1999) ที่ความเข้มข้นต่าง ๆ formamide การตรวจสอบสกุล Geobacter ผสม equimolar ของ 16S rRNA เป้าหมายวัด Geo1A และ Geo1B ใช้ที่ความเข้มข้น 35% formamide Geo1A มีเฉพาะสำหรับกรัมกำมะถัน-reducens, Geobacter hydrogenophilus, Geobacter grbiciae และ metallireducens กรัม Geo1B ตรวจพบมากที่สุดทางภูมิศาสตร์ bacter ชนิดอื่น ๆ (Demaneche et al. 2008) Bromii Ruminococcus Todetectthe Ruminococcaceae กลุ่มสมาชิก Clostridium sporosphaeroides และ Clostridium leptum, wasapplied การรบ (Harmsen et al. 2002) Rbro730 ใน formamide 20% การตรวจสอบส่วนใหญ่ mem bers ของ Clostridium คลัสเตอร์ I และ II โพรบ Chis150 (คอลลินส์ et al. 1994 Formamide 35% Franksetal.1998)wasusedwith

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

rRNA กำหนดเป้​​าหมาย probes oligonucleotide ถูกสังเคราะห์และติดป้ายโดย Sigma-Aldrich (Steinheim, เยอรมนี) EUB338-I (Amann et al. 1990) andEUB338-IIand EUB338-III (Daims et al. 1999) ส่วนผสม wereusedinanequimolar ที่ระดับความเข้มข้นที่แตกต่างกัน formamide ในการตรวจสอบประเภท Geobacter ที่ส่วนผสม equimolar ของ 16S rRNA กำหนดเป้​​าหมาย probes Geo1A และ Geo1B ถูกนำมาใช้ที่ความเข้มข้น 35% formamide Geo1A เป็นที่เฉพาะเจาะจงสำหรับกรัม sulfur- reducens, Geobacter hydrogenophilus, Geobacter grbiciae กรัมและ metallireducens; Geo1B ตรวจพบสายพันธุ์อื่น ๆ ส่วนใหญ่ภูมิศาสตร์ bacter (Demaneche et al. 2008) .Todetectthe Ruminococcaceae สมาชิกในกลุ่ม Ruminococcus bromii, sporosphaeroides Clostridium และ Clostridium leptum, การสอบสวน Rbro730 (Harmsen et al. 2002) wasapplied ในการปรากฏตัวของ 20% formamide ในการตรวจสอบหน่วยความ Bers ที่สุดของ Clostridium กลุ่ม I และ II, การสอบสวน Chis150 (คอลลิน et al, 1994;. Franksetal.1998) wasusedwith 35% formamide