Over seven years ago, in 2005, Toml

Over seven years ago, in 2005, Tomlins and colleagues reported an interesting discovery of gene
fusions in PC that is one of the most prevalent epithelial malignancies in the world. By analyzing
DNA microarray data with a specific unconventional bioinformatics approach called the cancer
outlier profile analysis (COPA) algorithm (described in Tomlins et al. 2005), they discovered
recurrent TMPRSS2:ETS (E-twenty six) translocations in PC. They performed COPA analysis in
Oncomine 3.0 with 132 different gene expression data sets (10,486 microarray experiments). Instead
of using cancer samples and analyzing them with common analytical methods to search for
activation of genes (e.g. t test) they used COPA for the search of genes that have marked
overexpression profiles (outlier profiles) in specific cancer types. Furthermore, Tomlins and coworkers
found that ERG (21q22.3) and ETV1 (7p21.2), which encode ETS oncogenic transcription
factors, had the strongest outlier profiles in several data sets observed in PC and the respective genes
were among the top 10 outlier genes in six different PC profiling studies.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กว่า 7 ปี ในปี 2005, Tomlins และผู้ร่วมงานรายงานการค้นพบยีนน่าสนใจfusions ในพีซีที่เป็นหนึ่งของ malignancies epithelial แพร่หลายมากที่สุดในโลก โดยวิเคราะห์มะเร็งเรียกว่า DNA microarray ข้อมูลวิธี bioinformatics เฉพาะกระเป๋าoutlier โปรไฟล์ (โคปา) การวิเคราะห์อัลกอริทึม (อธิบายไว้ใน Tomlins et al. 2005), พวกเขาค้นพบเกิดซ้ำ TMPRSS2:ETS (อียี่สิบหก) translocations ในเครื่องคอมพิวเตอร์ ดำเนินการวิเคราะห์ฟุตบอลโคปาในOncomine 3.0 กับ 132 ยีนต่าง ๆ นิพจน์ค่า (10,486 microarray ทดลอง) แทนใช้ตัวอย่างมะเร็ง และวิเคราะห์ ด้วยวิธีวิเคราะห์เพื่อค้นหาเปิดใช้งานของยีน (เช่นทดสอบ t) จะใช้โคปาหายีนที่มีเครื่องหมายoverexpression ค่า (outlier) ในมะเร็งบางชนิด นอกจากนี้ Tomlins และพบว่า ERG (21q22.3) และ ETV1 (7p21.2), การเข้ารหัส ETS oncogenic transcriptionปัจจัย มีค่า outlier แข็งแกร่งหลายชุดข้อมูลในพีซีและยีนที่เกี่ยวข้องขึ้นระหว่างยีน outlier 10 ชั้นในหกต่าง ๆ PC สร้างโพรไฟล์การศึกษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กว่าเจ็ดปีที่ผ่านมาในปี 2005 Tomlins และเพื่อนร่วมงานได้รายงานการค้นพบที่น่าสนใจของยีน
Fusions ในคอมพิวเตอร์ที่เป็นหนึ่งในโรคมะเร็งเยื่อบุผิวที่แพร่หลายมากที่สุดในโลก โดยการวิเคราะห์ข้อมูล microarray ดีเอ็นเอด้วยวิธีชีวสารสนเทศทางการเฉพาะที่เรียกว่าโรคมะเร็งการวิเคราะห์ค่าผิดปกติรายละเอียด(โคปา) อัลกอริทึม (. อธิบายไว้ใน Tomlins et al, 2005) พวกเขาค้นพบTMPRSS2 กำเริบ: ETS (E ยี่สิบหกบาท) translocations ในเครื่องคอมพิวเตอร์ พวกเขาดำเนินการวิเคราะห์ในโคปาOncomine 3.0 132 ชุดข้อมูลการแสดงออกของยีนที่แตกต่างกัน (10,486 ทดลอง microarray) แทนการใช้ตัวอย่างโรคมะเร็งและการวิเคราะห์พวกเขาด้วยวิธีการวิเคราะห์ร่วมกันในการค้นหากระตุ้นการทำงานของยีน(เช่นการทดสอบที) ที่พวกเขาใช้โคปาสำหรับการค้นหาของยีนที่มีการทำเครื่องหมายโปรไฟล์แสดงออก(โพรไฟล์ขอบเขต) ในรูปแบบที่เป็นโรคมะเร็งที่เฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ Tomlins และเพื่อนร่วมงานพบว่าERG (21q22.3) และ ETV1 (7p21.2) ซึ่งเข้ารหัสถอดรหัส ETS oncogenic ปัจจัยที่มีโปรไฟล์ที่แข็งแกร่งค่าผิดปกติในชุดข้อมูลหลายข้อสังเกตในเครื่องคอมพิวเตอร์และยีนที่เกี่ยวข้องอยู่ในกลุ่ม 10 อันดับแรกค่าผิดปกติ ยีนในหกการศึกษาที่แตกต่างกันโปรไฟล์เครื่องคอมพิวเตอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กว่า 7 ปี ในปี 2005 tomlins และเพื่อนร่วมงานรายงานการค้นพบที่น่าสนใจของยีน
fusions ในเครื่องคอมพิวเตอร์ที่เป็นหนึ่งในมะเร็งที่เยื่อบุผิวที่แพร่หลายมากที่สุดในโลก โดยการวิเคราะห์ข้อมูลดีเอ็นเอ microarray
กับ Bioinformatics แหกคอกแนวทางเฉพาะเรียกว่ามะเร็ง
ค่าโปรไฟล์การวิเคราะห์ ( โคปา ) ซึ่งได้อธิบายไว้ใน tomlins et al . 2005 ) , พวกเขาค้นพบ
ดำเนินการ tmprss2 : ETS ( e-twenty หก ) โยกย้ายในเครื่องคอมพิวเตอร์ที่พวกเขาแสดงการวิเคราะห์โคปาใน
oncomine 3.0 กับ 132 แตกต่างกันข้อมูลการแสดงออกของยีนชุด ( 10486 microarray ทดลอง ) แทนการใช้ตัวอย่างและวิเคราะห์
มะเร็งด้วยวิธีทั่วไปในการค้นหา
การกระตุ้นยีน ( เช่น T Test ) จะใช้สำหรับการค้นหายีนที่โคปามีเครื่องหมาย
overexpression โปรไฟล์ ( โปรไฟล์ผิดปกติ ) ในมะเร็งชนิดที่เฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ tomlins และเพื่อนร่วมงาน
พบว่าเอิร์ท ( 21q22.3 ) และ etv1 ( 7p21.2 ) ซึ่งเข้ารหัส ETS ปัจจัย transcription
oncogenic มีค่าในชุดข้อมูลหลายโปรไฟล์ที่พบในพีซีและยีนที่เกี่ยวข้อง
เป็นในด้านบน 10 ยีนผิดปกติในหกที่แตกต่างกันพีซี การศึกษา