Another challenge in docking is acc

Another challenge in docking is accounting for the various
tautomeric and protomeric states the molecules can
adopt. In many databases molecules such as acids or amines
are stored in their neutral forms. Considering that they are
ionized under physiological conditions it is necessary to ionize
them prior to docking. However, while standard ionization
is easy to achieve, the problem of tautomer generation is
already much more challenging: which tautomer should one
use? Or should one use more than one (or all possible)
tautomers for a given molecule? Not only for tautomers, but
also for different ionization states balanced equilibria between
the different forms provide real challenges in docking.
One (radical) approach to this would be to generate all possible
forms, subsequently to dock all of them, and to choose
the relevant form based on the scores. However, it remains to
be seen whether such an approach would be beneficial or just
generate a large number of false positives

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความท้าทายอื่นในการเชื่อมต่อเป็นบัญ​​ชีสำหรับรัฐต่างๆ
tautomeric และ protomeric โมเลกุลสามารถนำมาใช้
ในโมเลกุลของฐานข้อมูลจำนวนมากเช่นกรดหรือเอมีน
จะถูกเก็บไว้ในรูปแบบของพวกเขาที่เป็นกลาง พิจารณาว่าพวกเขาจะแตกตัวเป็นไอออน
ภายใต้สภาพร่างกายมีความจำเป็นต้องเปลี่ยนเป็นอิออ
พวกเขาก่อนที่จะเทียบท่า แต่ในขณะที่ไอออนไนซ์มาตรฐาน
เป็นเรื่องง่ายที่จะบรรลุปัญหาของคนรุ่น tautomer เป็น
แล้วท้าทายมากขึ้น: ซึ่ง tautomer ควรหนึ่ง
ใช้งานหรือไม่ หรือควรใช้มากกว่าหนึ่ง (หรือเป็นไปได้)
tautomers โมเลกุลที่กำหนดหรือไม่ ไม่เพียง แต่สำหรับ tautomers แต่ยัง
สำหรับรัฐไอออนไนซ์ที่แตกต่างกันสมดุลสมดุลระหว่างรูปแบบที่แตกต่างกัน
ให้ความท้าทายที่แท้จริงในการเทียบท่า.
หนึ่ง (รุนแรง) วิธีการนี​​้จะมีการสร้างเป็นไปได้ทั้งหมด
รูปแบบต่อมาเทียบท่าทั้งหมดของพวกเขาและการเลือกรูปแบบที่เกี่ยวข้อง
ขึ้นอยู่กับคะแนน แต่ก็ยังคงที่
จะเห็นว่าวิธีการดังกล่าวจะเป็นประโยชน์หรือเพียงแค่
สร้างเป็นจำนวนมากของผลบวกปลอม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อีกความท้าทายในการเทียบเป็นบัญชีสำหรับการ
tautomeric และโมเลกุลสามารถระบุ protomeric
นำมาใช้ ในหลายฐานข้อมูลโมเลกุลเช่นกรดหรือ amines
ถูกเก็บไว้ในรูปแบบความเป็นกลาง พิจารณาว่า จะ
ionized ภายใต้เงื่อนไขที่จำเป็นต้อง ionize สรีรวิทยา
พวกเขาก่อนที่จะเทียบ อย่างไรก็ตาม ในขณะที่มาตรฐาน ionization
เพื่อบรรลุ ปัญหาของรุ่น tautomer
แล้วมากขึ้น: tautomer ใดควรหนึ่ง
ใช้ หรือหนึ่งควรใช้มากกว่าหนึ่ง (หรือเป็นที่เป็นไปได้ทั้งหมด)
tautomers สำหรับโมเลกุลที่กำหนดหรือไม่ ไม่เพียงแต่สำหรับ tautomers แต่
สำหรับ ionization ต่าง ๆ อเมริกา equilibria สมดุลระหว่าง
กันให้จริงความท้าทายในการเทียบการ
หนึ่ง (รุนแรง) วิธีนี้จะสร้างได้ทั้งหมด
แบบฟอร์ม ต่อมาเมื่อพวกเขาทั้งหมด และเลือก
รายตามคะแนน อย่างไรก็ตาม มันยังคงจะ
จะเห็นว่า วิธีการดังกล่าวจะเป็นประโยชน์ หรือเพียง
สร้างเท็จทำงานผิดพลาดเป็นจำนวนมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความท้าทายอีกประการคือการคิดบัญชีในการเชื่อมต่อสำหรับรัฐ
tautomeric และ protomeric ต่างๆที่โมเลกุลของ
ซึ่งจะช่วยให้คุณสามารถปรับใช้ ในฐานข้อมูลจำนวนมากโมเลกุลของเช่นกรดหรือ amines
จะถูกจัดเก็บไว้ในรูปแบบธรรมชาติของพวกเขา พิจารณาเห็นว่าพวกเขามี
มีประจุไอออนเพื่อคืน ภายใต้ เงื่อนไขในทางสรีรศาสตร์เป็นสิ่งจำเป็นที่ต้องทำให้เป็นละออง
ซึ่งจะช่วยให้เขาก่อนที่จะเชื่อมต่อ แต่ถึงอย่างไรก็ตามในขณะที่ควันไอออนไนเซชันแบบมาตรฐาน
ซึ่งจะช่วยได้อย่างง่ายดายเพื่อบรรลุเป้าหมายปัญหาของคนรุ่น tautomer
อยู่แล้วเป็นเรื่องที่ท้าทายมากขึ้นซึ่ง tautomer ควร
ใช้ หรือว่าจะใช้มากกว่าหนึ่ง(หรือเป็นไปได้ทั้งหมด)
tautomers สำหรับโมเลกุลที่ระบุ ไม่เพียงเฉพาะสำหรับ tautomers แต่
ซึ่งจะช่วยให้รัฐควันไอออนไนเซชันนอกจากนั้นยังแตกต่างกัน equilibria
ซึ่งจะช่วยมอบความสมดุลระหว่างรูปแบบที่แตกต่างกันไปให้ความท้าทายอย่างแท้จริงในการเชื่อมต่อ.
หนึ่ง(หัวรุนแรง)มาใช้สำหรับการนี้จะเป็นการสร้างเป็นไปได้ทั้งหมด
รูปแบบต่อมาเพื่อไปยังท่าเทียบได้ทั้งหมดและในการเลือกรูปแบบที่เกี่ยวข้อง
ตามคะแนนที่ได้ แต่ถึงอย่างไรก็ตามโรงแรมยัง
ซึ่งจะช่วยให้เห็นว่าวิธีการดังกล่าวจะเป็นประโยชน์ต่อหรือเพียง
ซึ่งจะช่วยสร้างหมายเลขขนาดใหญ่ที่มีการแจ้งเตือนที่ผิดพลาด