High-throughput phenotyping of crop

High-throughput phenotyping of crop root system architecture using digital image analysis requires costly special software (WinRHIZO). Novel freeware, ImageJ, has also been developed for the similar pur-pose,butthepresettingofthethresholdtocreaterootbinaryimagesmakesthismethodtime-consuming. This study compares the 16 algorithms available in the ImageJ for processing of rice root images. Among the algorithms, the Triangle algorithm proved to be the best binary method, where the coefficient of cor-relation between ImageJ-estimated and WinRHIZO-estimated root lengths is extremely high (r=0.986). However, using the Triangle algorithm, ImageJ overestimated the rice root length compared with Win-RHIZO. By multiplying the values obtained using ImageJ by 2/3, the estimates closely corresponded to thoseestimatedbyWinRHIZO.ThecorrespondenceofrootlengthsestimatedusingWinRHIZOandImageJ withTrianglealgorithmwasvalidforrootsofvariousmorphologies,andforriceplantsgrowninuplands, rainfed lowlands, and irrigated lowlands. This report proposes the completely automated estimation of rice root length using freeware ImageJ with the appropriate threshold algorithm for image processing.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อัตราความเร็วสูง phenotyping ของสถาปัตยกรรมระบบรากพืชที่ใช้วิเคราะห์ภาพดิจิตอลต้องการซอฟต์แวร์พิเศษค่าใช้จ่าย (WinRHIZO) ฟรีแวร์นวนิยาย ImageJ ได้รับการพัฒนาสำหรับการคล้ายเทนแบบก่อให้เกิด ใช้ butthepresettingofthethresholdtocreaterootbinaryimagesmakesthismethodtime ยัง ศึกษาเปรียบเทียบ 16 อัลกอริทึมใน ImageJ สำหรับการประมวลผลภาพรากข้าว ในอัลกอริทึม อัลกอริทึมสามเหลี่ยมเกี่ยวกับ วิธีไบนารีสุด coefficient ของประกอบ ความสัมพันธ์ระหว่างความยาวของราก ประมาณ ImageJ และ ประเมิน WinRHIZO อยู่สูงมาก (r = 0.986) อย่างไรก็ตาม ImageJ ใช้อัลกอริทึมสามเหลี่ยม overestimated ความยาวรากข้าวเปรียบเทียบกับ RHIZO ชนะ โดยการคูณค่าที่ได้ใช้ ImageJ โดย 2/3 ประเมินอย่างใกล้ชิด corresponded thoseestimatedbyWinRHIZO.ThecorrespondenceofrootlengthsestimatedusingWinRHIZOandImageJ withTrianglealgorithmwasvalidforrootsofvariousmorphologies, andforriceplantsgrowninuplands, rainfed สกอตแลนด์ตอนใต้ และชลประทานสกอตแลนด์ตอนใต้ รายงานนี้เสนอการประเมินอย่างสมบูรณ์อัตโนมัติความยาวรากข้าวโดยใช้ฟรีแวร์ ImageJ กับอัลกอริทึมขีดจำกัดที่เหมาะสมสำหรับการประมวลผลภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

phenotyping สูงผ่านระบบรากของพืชสถาปัตยกรรมโดยใช้การวิเคราะห์ภาพดิจิตอลต้องใช้ซอฟต์แวร์พิเศษค่าใช้จ่าย (WinRHIZO) ฟรีแวร์นวนิยาย ImageJ ยังได้รับการพัฒนาสำหรับ PUR-ท่าที่คล้ายกัน butthepresettingofthethresholdtocreaterootbinaryimagesmakesthismethodtime นาน การศึกษาครั้งนี้เปรียบเทียบขั้นตอนวิธีการที่มีอยู่ใน 16 ImageJ สำหรับการประมวลผลของภาพรากข้าว ท่ามกลางขั้นตอนวิธีอัลกอริทึมสามเหลี่ยมพิสูจน์แล้วว่าเป็นวิธีการที่ดีที่สุดไบนารีที่สาย COEF เพียงพอของคร-ความสัมพันธ์ระหว่าง ImageJ คาดและคาด WinRHIZO ความยาวรากสูงมาก (r = 0.986) อย่างไรก็ตามการใช้อัลกอริทึมสามเหลี่ยม ImageJ เกินความยาวรากข้าวเมื่อเทียบกับ Win-RHIZO โดยการคูณค่าที่ได้ใช้ ImageJ โดย 2/3 ประมาณการอย่างใกล้ชิดตรงกับ thoseestimatedbyWinRHIZO.ThecorrespondenceofrootlengthsestimatedusingWinRHIZOandImageJ withTrianglealgorithmwasvalidforrootsofvariousmorphologies, andforriceplantsgrowninuplands ที่ราบลุ่มน้ำฝนและน้ำท่าที่ราบลุ่ม รายงานนี้เสนอการประมาณค่าอัตโนมัติที่สมบูรณ์ของความยาวรากข้าวโดยใช้ ImageJ ฟรีแวร์ที่มีขั้นตอนวิธีเกณฑ์ที่เหมาะสมสำหรับการประมวลผลภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สูง throughput ของระบบรากพืชอสถาปัตยกรรมโดยใช้การวิเคราะห์ภาพดิจิตอลต้องใช้ค่าใช้จ่ายซอฟต์แวร์พิเศษ ( winrhizo ) นวนิยายฟรีแวร์ ImageJ ยังได้ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อที่คล้ายกัน pur ก่อให้เกิด butthepresettingofthethresholdtocreaterootbinaryimagesmakesthismethodtime การบริโภค การศึกษาเปรียบเทียบ 16 ขั้นตอนวิธีที่มีอยู่ใน ImageJ เพื่อการประมวลผลของภาพรากข้าวในขั้นตอนวิธี ขั้นตอนวิธีสามเหลี่ยมได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นวิธีที่ดีที่สุดไบนารีที่ coef จึง cient ของ COR ความสัมพันธ์ระหว่าง ImageJ ประมาณและ winrhizo ประมาณรากยาวสูงมาก ( r = 0.986 ) อย่างไรก็ตาม การใช้สามเหลี่ยมขั้นตอนวิธี ImageJ ประเมินค่า รากยาว เมื่อเทียบกับ ชนะ rhizo . โดยการคูณค่าได้มาโดย ImageJ โดย 2 / 3การประเมินอย่างใกล้ชิดสอดคล้องกับ thoseestimatedbywinrhizo.thecorrespondenceofrootlengthsestimatedusingwinrhizoandimagej withtrianglealgorithmwasvalidforrootsofvariousmorphologies andforriceplantsgrowninuplands , น้ำฝน , พื้นที่ราบ และชลประทานที่ต่ำ .รายงานนี้นำเสนอโดยอัตโนมัติทั้งหมดประมาณของรากข้าวความยาวโดยใช้ฟรีแวร์ ImageJ กับขั้นตอนวิธีการเกณฑ์สำหรับการประมวลผลภาพ