3.3 Network analysis of soil fungal

3.3 Network analysis of soil fungal communities
The relationships among different fungal taxa were explored
through construction of an OTU network. This network revealed
37 significant correlations (edges) of 28 OTUs (nods)
(Fig. 3). Short average path length (1.83) and network diameter
(4) showed that the network of different taxa in the fungal
community held a characteristic of small world. Notably, by
calculating the eigenvector centrality (EC), an index that measures
the importance of nod in a certain network, several important
taxa were identified in the soils. Cyanodermella
(OTU_51, EC 0.24), Ceramothyrium (OTU_156, EC 0.58),
Gibberella (OTU_16, EC 0.45) in Leotiomyceta, and
Clavulina (OTU_90, EC 0.48) in Agaricomycetes were important
nods closely related to the other OTUs.More importantly,
an uncultured soil fungi OTU_160 (EC 1.0) was identified as a
vital hub closely related to OTU_51 and OTU_90.
3.4 Effect of environmental factors in structuring fungal
abundance, alpha and beta diversity patterns along
the altitude
A distance-based multivariate linear model (DistLM) was
used to distinguish the effects of edaphic properties (including
soil pH, SOC, TN, moisture, CEC, and clay content), mean
annual temperature (MAT), and vegetation in shaping the fungal
abundance, alpha and beta diversity pattern along the altitudinal
gradient (Table 3). Although soil pH (11 %) and moisture
(10 %) explained the largest part of the community composition
variance as measured by the weighted UniFrac matrix,
neither of them had a statistically significant effect on
fungal beta diversity along altitude. The abundance pattern
was neither significantly influenced by any factors examined.
However, alpha diversity pattern was closely related with environmental
factors, for example, fungal richness was significantly
affected merely by soil pH (P

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.3 เครือข่ายวิเคราะห์ชุมชนเชื้อราดินความสัมพันธ์ระหว่าง taxa ที่เชื้อราต่าง ๆ ได้สำรวจผ่านงานก่อสร้างของเครือข่าย OTU เครือข่ายนี้เปิดเผย37 สำคัญสัมพันธ์ (ขอบ) ของ OTUs 28 (nods)(Fig. 3) ความยาวของเส้นค่าเฉลี่ยระยะสั้น (1.83) และเส้นผ่าศูนย์กลางของเครือข่าย(4) ชี้ให้เห็นว่าเครือข่ายของ taxa ที่แตกต่างกันในการเชื้อราชุมชนจัดขึ้นเป็นลักษณะของโลกขนาดเล็ก ยวด โดยคำนวณ eigenvector เอกภาพ (EC), ดัชนีที่วัดความสำคัญของพยักหน้าในบางเครือข่าย ต่าง ๆ ที่สำคัญtaxa ที่ระบุในดินเนื้อปูน Cyanodermella(OTU_51, EC 0.24), Ceramothyrium (OTU_156, EC 0.58),Gibberella (OTU_16, EC 0.45) ใน Leotiomyceta และClavulina (OTU_90, EC 0.48) ใน Agaricomycetes มีความสำคัญnods สัมพันธ์ใกล้ชิดกับ OTUs.More สำคัญเชื้อรา uncultured ดิน OTU_160 (EC 1.0) มีการระบุไว้เป็นการศูนย์กลางสำคัญที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ OTU_51 และ OTU_903.4 ผลกระทบของสิ่งแวดล้อมปัจจัยในการจัดโครงสร้างเชื้อราอุดมสมบูรณ์ อัลฟา และเบต้าการรูปแบบความหลากหลายตามระดับความสูงมีระยะทางตามตัวแปรพหุเชิงเส้นแบบ (DistLM)ใช้เพื่อแยกผลกระทบของคุณสมบัติ edaphic (รวมถึงpH ดิน SOC, TN ความชื้น พบกับ CEC และเนื้อหาดิน),อุณหภูมิประจำปี (ปู), และพืชพรรณในการกำหนดทิศเชื้อรารูปหลากหลายอุดมสมบูรณ์ อัลฟา และเบต้าตามที่ altitudinalไล่ระดับสี (ตาราง 3) แม้ว่า pH (11%) และความชื้นของดิน(10%) อธิบายส่วนที่ใหญ่ที่สุดขององค์ประกอบของชุมชนผลต่างที่วัดจากเมตริกซ์ UniFrac ถ่วงน้ำหนักไม่ได้มีผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติความหลากหลายของเชื้อราเบต้าตามระดับความสูง รูปแบบมากมายมีไม่มากรับอิทธิพลจากปัจจัยใด ๆ ตรวจสอบอย่างไรก็ตาม รูปแบบอักษรหลากหลายมีความสัมพันธ์กับสิ่งแวดล้อมปัจจัย ตัวอย่าง ร่ำรวยเชื้อราถูกมากได้รับผลกระทบเพียง โดยค่า pH ของดิน (P < 0.01), และ evenness และphylodiversity ถูกครอบงำ โดยค่า pH ของดินทั้งสอง (P < 0.001P < 0.05) และพรม (P < P 0.01, < 0.05), ตามลำดับ3.5 เชื้อราความอุดมสมบูรณ์ อัลฟา และเบต้าหลากหลายรูปแบบตามไล่ระดับ pH ของดินการตรวจสอบผลของ pH ดินกระจายเชื้อรา เพิ่มเติมหลากหลายเบต้า อุดมสมบูรณ์ และความหลากหลายอัลฟามีปัญหากับค่า pH ของดิน โดยฟังก์ชันกำลังสอง (Fig. 4)แกนแรกของการใช้หลักการประสานงานวิเคราะห์ (PCoA)เมตริกซ์ UniFrac ถ่วงน้ำหนัก ซึ่งอธิบาย 44.0% ของการชุมชนต่าง มีไม่มากที่เกี่ยวข้องกับดินpH (r2 = 0.09, P > 0.05) ไม่มีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญได้ตรวจพบเชื้อราที่อุดมสมบูรณ์และดิน pH (r2 = 0.12P > 0.05) เชื้อราอัลฟาหลากหลายจัดแสดงความสัมพันธ์ที่แข็งแกร่ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.3
การวิเคราะห์เครือข่ายของชุมชนเชื้อราในดินความสัมพันธ์ในหมู่แท็กซ่าเชื้อราที่แตกต่างกันได้รับการสำรวจผ่านการก่อสร้างของเครือข่าย
OTU เครือข่ายนี้เผยให้เห็น
37 ความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญ (ขอบ) วันที่ 28 Otus (พยักหน้า)
(รูปที่. 3) ความยาวเส้นทางเฉลี่ยสั้น (1.83) และมีขนาดเส้นผ่าศูนย์กลางเครือข่าย
(4)
แสดงให้เห็นว่าเครือข่ายของแท็กซ่าแตกต่างกันในเชื้อราที่ชุมชนจัดขึ้นลักษณะของโลกที่มีขนาดเล็ก โดยเฉพาะอย่างยิ่งจากการคำนวณเป็นศูนย์กลางวิคเตอร์ (EC) ซึ่งเป็นดัชนีที่ใช้วัดความสำคัญของการพยักหน้าในเครือข่ายบางอย่างที่สำคัญหลายแท็กซ่าถูกระบุไว้ในดิน Cyanodermella (OTU_51, EC 0.24) Ceramothyrium (OTU_156, EC 0.58) Gibberella (OTU_16, EC 0.45) ใน Leotiomyceta และClavulina (OTU_90, EC 0.48) ใน Agaricomycetes มีความสำคัญพยักหน้าที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับOTUs.More อื่น ๆ ที่สำคัญเชื้อราในดินไม่มีมารยาท OTU_160 (EC 1.0) ถูกระบุว่าเป็นศูนย์กลางที่สำคัญที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับOTU_51 และ OTU_90. 3.4 ผลของปัจจัยแวดล้อมในโครงสร้างเชื้อราความอุดมสมบูรณ์, อัลฟาและรูปแบบความหลากหลายเบต้าพร้อมความสูงเป็นระยะทางที่ใช้แบบจำลองเชิงเส้นหลายตัวแปร (DistLM) เป็น ใช้เพื่อแยกผลกระทบของคุณสมบัติทางดิน (รวมถึงค่าpH ของดิน, SOC, เทนเนสซี, ความชื้น, CEC และเนื้อหาดิน) หมายถึงปีอุณหภูมิ(MAT) และพืชผักในการสร้างเชื้อราความอุดมสมบูรณ์, อัลฟาและรูปแบบความหลากหลายเบต้าไปตามความสูงลาด (ตารางที่ 3) แม้ว่าค่า pH ของดิน (11%) และความชื้น(10%) อธิบายส่วนที่ใหญ่ที่สุดของชุมชนองค์ประกอบความแปรปรวนเป็นวัดโดยเมทริกซ์ถ่วงน้ำหนักUniFrac, ไม่ใช่ของพวกเขามีผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติในความหลากหลายของเชื้อราเบต้าพร้อมสูง รูปแบบที่อุดมสมบูรณ์ถูกไม่ได้รับอิทธิพลอย่างมีนัยสำคัญจากปัจจัยใด ๆ การตรวจสอบ. อย่างไรก็ตามรูปแบบอัลฟาหลากหลายที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสิ่งแวดล้อมปัจจัยเช่นความมีชีวิตชีวาของเชื้อราได้อย่างมีนัยสำคัญได้รับผลกระทบเพียงโดยค่าpH ของดิน (P <0.01) และความเรียบและphylodiversity ถูกครอบงำโดยทั้งสอง ค่า pH ของดิน (P <0.001, p <0.05) และ MAT (P <0.01, p <0.05) ตามลำดับ. 3.5 ความอุดมสมบูรณ์เชื้อราอัลฟาและรูปแบบความหลากหลายเบต้าพร้อมไล่ระดับค่าpH ของดินเพื่อเป็นการศึกษาผลของค่าpH ของดินกับการกระจายของเชื้อรา , ความหลากหลายเบต้าความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายของอัลฟาได้รับการถดถอยกับค่า pH ของดินโดยฟังก์ชันกำลังสอง (รูปที่. 4). แกนแรกของหลักประสานงานการวิเคราะห์ (PCoA) โดยใช้ถ่วงน้ำหนักเมทริกซ์UniFrac ซึ่งอธิบาย 44.0% ของความแปรปรวนของชุมชนไม่เกี่ยวข้องอย่างมีนัยสำคัญที่มีดินเป็นกรดเป็นด่าง (r2 = 0.09, P> 0.05) ไม่มีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญได้รับการตรวจพบระหว่างความอุดมสมบูรณ์ของเชื้อราและค่า pH ของดิน (r2 = 0.12, P> 0.05) ความหลากหลายของเชื้อราอัลฟาแสดงความสัมพันธ์ที่แข็งแกร่ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.3 การวิเคราะห์เครือข่ายของชุมชนบนดิน
ความสัมพันธ์ระหว่างเชื้อราและแตกต่างกันโดยการสํารวจ
ผ่านการก่อสร้างของ otu เครือข่าย เครือข่ายนี้เปิดเผย
37 ด้าน ( ขอบใน ) 28 ( พยักหน้า )
( รูปที่ 3 ) ความยาวของเส้นทางสั้นเฉลี่ย ( 1.83 ) และเส้นผ่าศูนย์กลางเครือข่าย
( 4 ) พบว่าเครือข่ายที่แตกต่างกันและในชุมชนรา
จัดลักษณะของโลกขนาดเล็กโดยเฉพาะ โดย
การคำนวณเวกเตอร์ลักษณะเฉพาะความเป็นศูนย์กลาง ( EC ) , ดัชนีที่ใช้วัด
ความสำคัญของพยักหน้าในเครือข่ายหนึ่ง และที่สำคัญ
หลายที่ระบุไว้ในดิน cyanodermella
( otu_51 EC 0.24 ) ceramothyrium ( otu_156 EC 0.58 )
gibberella ( otu_16 EC 0.45 ) ใน leotiomyceta และ
clavulina ( otu_90 EC 0.48 ) Agaricomycetes เป็นคนสำคัญ
พยักหน้าที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับอื่น ๆใน .ที่สำคัญคือ เป็นดินชนิด otu_160
ไร้การศึกษา ( EC 1.0 ) ถูกระบุว่าเป็นฮับ
สําคัญที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ otu_51 และ otu_90 .
3.4 ผลกระทบของปัจจัยแวดล้อมในการเชื้อรา
ไพบูลย์ อัลฟ่ากับเบต้าหลากหลายรูปแบบตาม

ระยะทางความสูงตามแบบจำลองเชิงเส้นหลายตัวแปร ( distlm ) คือ
ใช้แยกแยะผลของสมบัติครั้งนี้ ( รวมทั้ง
ดินส , TN , ความชื้นCEC , ปริมาณดินเหนียว ) หมายถึง
อุณหภูมิรายปี ( เสื่อ ) และพืชในการสร้างความอุดมสมบูรณ์ของเชื้อรา
อัลฟาและเบต้าหลากหลายรูปแบบตามระดับความสูงบริเวณ
( ตารางที่ 3 ) although ph soil ( แผน ( เช่น moisture
( 10 เช่น explained ลง 33 ของ the community composition
variance as พรุน by the matrix unifrac ไอ้ตัวเล็ก ,
neither ได้ had เซียมแล้วไงต่อ on
แวนเชื้อราเบต้าความหลากหลายตามระดับความสูง ความอุดมสมบูรณ์รูปแบบ
ไม่มีผลต่อทุกปัจจัยที่ศึกษา .
แต่อัลฟา ความหลากหลาย รูปแบบความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับสิ่งแวดล้อม
ปัจจัย เช่น เชื้อราความมั่งคั่งอย่างมีนัยสำคัญ
ผลกระทบเพียงโดยของดิน ( P < 0.01 ) และสมดุลและ
phylodiversity ถูกครอบงำโดยทั้งสอง pH ของดิน ( P < 0.001 ,
p < 0.05 ) และเสื่อ ( p < 0.01 , p < 0.05 )
3.5 ตามลำดับ ที่มีความอุดมสมบูรณ์ อัลฟ่ากับเบต้าความหลากหลายรูปแบบดินลาด

ไปสืบสวนต่อผลของ pH ของดินการกระจายของเชื้อรา
เบต้าความหลากหลาย ความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายของอัลฟ่า ถูก
กลับไปกับดินโดยฟังก์ชันกำลังสอง ( ภาพที่ 4 ) .
แกนแรกของการวิเคราะห์ประสานงานหลัก ( pcoa ) โดยใช้
เมทริกซ์ unifrac ถ่วงน้ำหนักซึ่งอธิบาย 440 % ของ the
variance community , was not significantly related with ph soil
( r2 = 0.09 , p > รู้ไหม ) . ไม่พบความสัมพันธ์ระหว่างราและ
พบความอุดมสมบูรณ์ของดิน ( R2 = 0.12 ,
p > 0.05 ) มีความสัมพันธ์ที่แข็งแกร่งของเชื้อราอัลฟา