RAP is a novel molecular marker tec

RAP is a novel molecular marker technique which has been effectively used in genetic diversity analysis of germplasm and genetic mapping. However, it has not yet been applied to radish. In this study, novel TRAP markers based on expressed sequence tag (EST) and resistance gene analog (RGAs) were developed and applied to the genetic diversity analysis of radish genotypes. With data-mining method, a total of 50 RGAs including 35 unigenes and 15 singletons were identified from the public sequence databases and employed to design the fixed primers of TRAP markers. Fifty-nine RGA-derived fixed primers were combined with five arbitrary primers, and these TRAP primer combinations were tested in two genotypes (‘NAU-YH’ and ‘NAU-DY’). Furthermore, 65 TRAP primer combinations were selected for genetic diversity analysis and 385 polymorphic fragments were produced among 30 radish genotypes. Dendrograms constructed by UPGMA method showed that these genotypes could be clustered into four groups. Interestingly, these groups were in highly accordance with the results of resistance evaluation to Turnip Mosaic Virus (TuMV). A cultivar identification diagram (CID) was made manually to discriminate the 30 radish genotypes using four polymorphic TRAP primer combinations. The results indicated that TRAP is an efficient genetic marker system, which could provide an effective tool for genetic mapping and for marker-assisted selection in radish breeding programs.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

RAP เป็นเทคนิคหนึ่งที่เครื่องหมายโมเลกุลนวนิยายซึ่งมีใช้อย่างมีประสิทธิภาพในการวิเคราะห์พันธุ germplasm และแผนที่ทางพันธุกรรมแล้ว อย่างไรก็ตาม ก็ยังไม่ได้ถูกใช้กับหัวผักกาด ในการศึกษานี้ เครื่องหมายจับนวนิยายตามแสดงลำดับแท็ก (EST) และแบบแอนะล็อกยีนต้านทาน (RGAs) ถูกพัฒนา และประยุกต์ใช้ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของหัวผักกาด มีวิธีการทำเหมืองข้อมูล จำนวน 50 RGAs 35 unigenes และ 15 singletons ได้ระบุจากฐานข้อมูลลำดับที่สาธารณะ และการออกแบบไพรเมอร์คงเครื่องหมายจับ สิบเก้ามา RGA คงไพรเมอร์ได้ร่วมกับไพรเมอร์กำหนดห้า และชุดรองพื้นกับดักเหล่านี้ถูกทดสอบในการศึกษาจีโนไทป์สอง ('NAU-เหยี่ยว' และ 'NAU-DY') นอกจากนี้ 65 ชุดรองพื้นกับดักถูกเลือกสำหรับการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม และผลิตชิ้นส่วน polymorphic 385 ระหว่างศึกษาจีโนไทป์ 30 หัวผักกาด สร้าง โดยวิธี UPGMA Dendrograms พบว่า สามารถจับกลุ่มศึกษาจีโนไทป์เหล่านี้ออกเป็น 4 กลุ่ม เป็นเรื่องน่าสนใจ กลุ่มเหล่านี้ได้ในคำมีผลการประเมินความต้านทานการไวรัสโมเสกหัวผักกาด (TuMV) รหัส cultivar ไดอะแกรม (ซิด) ทำด้วยตนเองถือพรรคถือพวกศึกษาจีโนไทป์ 30 หัวผักกาดที่ใช้รองพื้นกับดักสี่ polymorphic ชุด ผลระบุว่า กับดักเป็นระบบเครื่องหมายพันธุมีประสิทธิภาพ ซึ่งสามารถให้เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพ สำหรับการแม็ปพันธุกรรม และช่วยทำเครื่องหมายเลือกในโปรแกรมการเพาะพันธุ์หัวผักกาด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

RAP เป็นเทคนิคเครื่องหมายโมเลกุลนวนิยายที่ได้รับการใช้อย่างมีประสิทธิภาพในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อพันธุกรรมและการทำแผนที่พันธุกรรม แต่ก็ยังไม่ได้รับนำไปใช้กับหัวไชเท้า ในการศึกษานี้บ่งชี้ TRAP นวนิยายขึ้นอยู่กับแท็กลำดับแสดง (EST) และยีนต้านทานอนาล็อก (RGAs) ได้รับการพัฒนาและนำไปใช้ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีนหัวไชเท้า ด้วยวิธีการทำเหมืองข้อมูลทั้งหมด 50 RGAs รวมทั้ง 35 และ 15 unigenes ซิงเกิลถูกระบุจากฐานข้อมูลลำดับสาธารณะและการจ้างงานในการออกแบบไพรเมอร์คงที่ของเครื่องหมาย TRAP ห้าสิบเก้าไพรคง RGA มาถูกรวมกับห้าไพรเมอร์โดยพลการและการผสมรองพื้น TRAP เหล่านี้ได้รับการทดสอบในสองสายพันธุ์ ('NAU-ยงฮวา' และ 'NAU-DY') นอกจากนี้ 65 TRAP การผสมรองพื้นได้รับการคัดเลือกในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมและ 385 เศษ polymorphic ถูกผลิตในหมู่ 30 สายพันธุ์หัวไชเท้า Dendrograms สร้างโดยวิธี UPGMA แสดงให้เห็นว่ายีนเหล่านี้อาจจะกระจุกตัวออกเป็นสี่กลุ่ม ที่น่าสนใจกลุ่มคนเหล่านี้อยู่ในที่สูงตามผลของการประเมินผลความต้านทานต่อหัวผักกาดโมเสกไวรัส (TuMV) แผนภาพการระบุพันธุ์ (CID) ที่ถูกสร้างขึ้นด้วยตนเองเพื่อให้เห็นความแตกต่างสายพันธุ์หัวไชเท้า 30 โดยใช้ชุดไพร TRAP สี่ polymorphic ผลการศึกษาพบว่า TRAP เป็นระบบเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพที่จะให้เครื่องมือที่มีประสิทธิภาพสำหรับการทำแผนที่ทางพันธุกรรมและสำหรับการเลือกเครื่องหมายช่วยในโปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์หัวไชเท้า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แร็พเป็นนวนิยายเทคนิคเครื่องหมายโมเลกุลซึ่งได้รับการใช้อย่างมีประสิทธิภาพในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อพันธุกรรมและการทำแผนที่ทางพันธุกรรม อย่างไรก็ตาม มันยังใช้กับหัวไชเท้า การศึกษานวนิยายกับดักเครื่องหมายแสดงแท็กตามลำดับ ( EST ) และความต้านทานของอนาล็อก ( rgas ) ได้มีการพัฒนาและใช้ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของหัวไชเท้าพันธุ์ . ข้อมูลวิธีการทำเหมืองทั้งหมด 50 rgas รวม 35 unigenes 15 singletons ถูกระบุจากประชาชนลำดับฐานข้อมูลและออกแบบไพรเมอร์จำนวนคงที่ของกับดักเครื่องหมาย ห้าสิบเก้า rga ได้แก้ไขโดยรวมกับห้าพลไพรเมอร์ผสมรองพื้นและกับดักเหล่านี้ถูกทดสอบใน 2 พันธุ์ ( 'nau-yh ' และ ' nau-dy ' ) นอกจากนี้65 กับดักผสมรองพื้นเลือกการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมและ 385 จำนวนชิ้นส่วนถูกผลิตใน 30 สายพันธุ์ หัวไชเท้า dendrograms สร้างโดยวิธี UPGMA พบว่าสายพันธุ์เหล่านี้อาจจะกระจายออกเป็นสี่กลุ่ม ทั้งนี้ กลุ่มเหล่านี้มีสูง สอดคล้องกับผลการประเมินความต้านทานหัวผักกาดฝังไวรัส ( tumv )พันธุ์ รหัสแผนภาพ ( CID ) ได้ด้วยตนเอง เพื่อแยกแยะ 30 หัวไชเท้าพันธุ์ใช้สี่จำนวนกับดักผสมรองพื้น . ผลการศึกษาพบว่า กับดักเป็นระบบเครื่องหมายพันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพซึ่งสามารถให้เครื่องมือที่มีประสิทธิภาพสำหรับการทำแผนที่ทางพันธุกรรมและดีเอ็นเอเครื่องหมายช่วยในการคัดเลือกหัวไชเท้าโปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์