A serine protease (N. protease), fr

A serine protease (N. protease), from Nocardiopsis sp., was cloned and expressed in Escherichia coli and investigated for its potential kinetic stability. Protein expression using two vectors, pET-22b (+) and pET-39b (+) was compared based on proper folding and soluble expression of the protein. pET-39b (+) was found to be a better vector for soluble expression of this protease containing disulfide bonds. In silico studies were also carried out for N. protease. Homology modeling suggested N. protease to be a member of PA clan of proteases. The phylogenetic analysis showed relatedness of N. protease to kinetically stable proteases. Molecular docking studies performed exhibited interaction of a peptide substrate with catalytic pocket of the enzyme. High temperature MD simulations were performed on N. protease to study its unfolding behavior and comparisons were made with αLP. A novel approach to study ‘cooperativity’ of protein unfolding was undertaken, wherein ‘P’ value analysis based on φ and ψ values of the protein was performed. Data showed sharper P value transition for αLP when compared to N. protease thus indicating relatively less kinetic stability of N. protease. Present study holds significance as the non-streptomycete actinomycetes group is least explored and ensures industrially important enzymes with exceptional stabilities.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การแถรติเอส (ตอนเหนือรติเอส), จาก sp. Nocardiopsis โคลน และแสดงใน Escherichia coli และสอบสวนสำหรับเสถียรภาพของเดิม ๆ เป็นไป นิพจน์โปรตีนโดยใช้เวกเตอร์สอง สัตว์เลี้ยง-22b (+) และสัตว์เลี้ยง-39b (+) เปรียบเทียบตามเหมาะสมพับและการละลายของโปรตีน พบสัตว์เลี้ยง-39b (+) เป็น เวกเตอร์สำหรับนิพจน์รติเอสนี้ประกอบด้วยพันธบัตรไดซัลไฟด์ละลายน้ำได้ดี ใน silico ศึกษาก็ยังดำเนินการสำหรับรติเอสตอนเหนือ สร้างโมเดล homology แนะนำรติเอสตอนเหนือเป็นสมาชิกของตระกูล PA ของ proteases วิเคราะห์ phylogenetic พบ relatedness รติเอสตอนเหนือจะมีเสถียรภาพ proteases kinetically โมเลกุลศึกษาต่อดำเนินการจัดแสดงโต้ตอบของพื้นผิวเป็นเพปไทด์กับกระเป๋าตัวเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์ จำลองอุณหภูมิ MD ดำเนินบนรติเอสตอนเหนือเพื่อศึกษาพฤติกรรมของ unfolding และเปรียบเทียบที่ทำกับ αLP ดำเนินวิธีนวนิยายเรียน 'cooperativity' ของกลุ่มโปรตีน นั้นวิเคราะห์ค่า 'P' ตามค่าφและψของโปรตีนที่ทำ ข้อมูลแสดงให้เห็นว่าคม P เปลี่ยนค่าสำหรับ αLP เมื่อเทียบกับรติเอสตอนเหนือจึง บ่งชี้เสถียรภาพค่อนข้างน้อยเดิม ๆ รติเอสตอนเหนือ ศึกษาอยู่มีความสำคัญเป็นกลุ่ม actinomycetes streptomycete ไม่น้อยอุดม และเอนไซม์ industrially สำคัญกับหงิม ๆ พิเศษเพื่อให้แน่ใจ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โปรติเอสซีรีน (เอ็นโปรติเอส) จาก Nocardiopsis sp. เป็นโคลนและแสดงออกใน Escherichia coli และการตรวจสอบเพื่อความมั่นคงเกี่ยวกับการเคลื่อนไหวของมันที่อาจเกิดขึ้น การแสดงออกของโปรตีนโดยใช้สองเวกเตอร์สำหรับผู้รักสัตว์ 22b (+) และสำหรับผู้รักสัตว์ 39B (+) เมื่อเทียบบนพื้นฐานของการพับที่เหมาะสมและการแสดงออกของโปรตีนที่ละลายน้ำได้ สำหรับผู้รักสัตว์ 39B (+) ถูกพบว่าเป็นเวกเตอร์ที่ดีกว่าสำหรับการแสดงออกของโปรติเอสที่ละลายน้ำที่มีซัลไฟด์พันธบัตรนี้ ในการศึกษา silico ถูกดำเนินการยังออกสำหรับโปรติเอสเอ็น การสร้างแบบจำลองที่คล้ายคลึงกันแนะนำโปรติเอสเอ็นจะเป็นสมาชิกของตระกูล PA ของโปรตีเอส phylogenetic วิเคราะห์แสดงให้เห็นความสัมพันธ์ของโปรติเอสเอ็นโปรตีเอสที่จะมีเสถียรภาพ kinetically การศึกษาเชื่อมต่อโมเลกุลดำเนินการจัดแสดงการทำงานร่วมกันของพื้นผิวเปปไทด์ที่มีกระเป๋าเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์ อุณหภูมิสูงจำลอง MD ได้ดำเนินการในโปรติเอสเอ็นเพื่อศึกษาพฤติกรรมแฉและการเปรียบเทียบที่ทำกับαLP แนวทางใหม่ในการศึกษา 'cooperativity' ของโปรตีนแฉได้ดำเนินการในประเด็นการวิเคราะห์ค่า 'P' ขึ้นอยู่กับค่าφψและโปรตีนที่ได้ดำเนินการ ข้อมูลแสดงให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงค่า P ​​คมชัดสำหรับαLPเมื่อเทียบกับโปรติเอสเอ็นจึงแสดงให้เห็นความมีเสถียรภาพค่อนข้างน้อยเกี่ยวกับการเคลื่อนไหวของโปรติเอสเอ็น การศึกษาครั้งนี้ถือเป็นความสำคัญที่ไม่ streptomycete กลุ่มแอคติโนมัยเป็นอย่างน้อยการสำรวจและสร้างความมั่นใจเอนไซม์ที่สำคัญในอุตสาหกรรมที่มีเสถียรภาพที่โดดเด่น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นเอนไซม์โปรติเอส ( เอ็นเอส ) จาก nocardiopsis sp . , โคลนและแสดงออกในแบคทีเรีย Escherichia coli และตรวจสอบความมั่นคงของพลังงานจลน์ศักยภาพ . การแสดงออกของโปรตีนที่ใช้สองเวกเตอร์ pet-22b ( ) และ ( ) pet-39b เทียบตามเหมาะสมที่พับและการแสดงออกของโปรตีนpet-39b ( ) พบว่าเป็นเวกเตอร์ที่ดีในการแสดงออกของโปรตีนที่ประกอบด้วยพันธะไดซัลไฟด์ละลาย . สำหรับการศึกษายังทำจากเอ็น โปรติเอส แนะนำเป็นแบบเอ็นเอสเป็นสมาชิกของตระกูลของปา คุณค่าทางอาหาร การวิเคราะห์ phylogenetic พบสัมพันธ์ ( โปรติเอสกับจลนศาสตร์ทางที่มั่นคงสำหรับการจัดแสดงโมเลกุลศึกษาปฏิสัมพันธ์ของพื้นผิวเปปไทด์ที่มีกระเป๋าเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์ จำลอง MD อุณหภูมิสูงจำนวนเอ็นเอส เพื่อศึกษาและเปรียบเทียบการแฉพฤติกรรมให้กับα หจก. แนวทางใหม่ในการศึกษา ' ' cooperativity โปรตีนแฉถูกแลกที่นั้น ' P ' การวิเคราะห์คุณค่าและค่านิยม ตามφψของโปรตีนคือการปฏิบัติ ข้อมูลที่แสดงการเปลี่ยนแปลงสำหรับαคมชัด P ค่า LP เมื่อเทียบกับเอ็นโปรค่อนข้างน้อยจึงแสดงจลนศาสตร์เสถียรภาพของเอ็นโปรติเอส การศึกษาครั้งนี้ มีความสําคัญที่ไม่ streptomycete เชื้อแอคติโนมัยสีทกลุ่มอย่างน้อยสํารวจและให้เอนไซม์สำคัญทางอุตสาหกรรม กับเสถียรภาพที่ยอดเยี่ยม