Several oxime containing molecules,

Several oxime containing molecules, characterized by a SAHA-like structure,
were explored to select a potentially new biasing binding element for the zinc in
HDAC catalytic site. All compounds were evaluated for their in vitro inhibitory activity
against the 11 human HDACs isoforms. After identification of a “hit” molecule, a
programmed variation at the cap group and at the linker was carried out in order to
increase HDAC inhibition and/or paralogue selectivity. Some of the new derivatives
showed increased activity against a number ofHDACisoforms, even if their overall activity
range is still far from the inhibition values reported for SAHA. Moreover, different from
what was reported for their hydroxamic acid analogues the new R-oxime amide derivatives
do not select between class I and class II HDACs; rather they target specific isoforms in
each class. These somehow contradictory results were finally rationalized by a computational
assisted SAR, which gave us the chance to understand how the oxime derivatives interact with the catalytic site and justify the
observed activity profile.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

oxime ที่มีหลายโมเลกุลโดดเด่นด้วยโครงสร้าง saha เหมือน
กำลังสำรวจเพื่อเลือกใหม่ที่อาจเกิดขึ้นในสภาพแวดล้อมที่มีผลผูกพัน biasing สำหรับสังกะสีในเว็บไซต์ของตัวเร่งปฏิกิริยา
HDAC สารทั้งหมดได้รับการประเมินสำหรับพวกเขาในการ
กิจกรรมหลอดทดลองยับยั้ง 11 ไอโซฟอร์ม hdacs มนุษย์ หลังจากที่บัตรประจำตัวของ "ตี" โมเลกุล
การเปลี่ยนแปลงโปรแกรมที่กลุ่มหมวกและลิงเกอร์ที่ถูกหามออกเพื่อที่จะยับยั้งการเพิ่มขึ้น
HDAC และ / หรือหัวกะทิ paralogue บางส่วนของ
อนุพันธ์ใหม่แสดงให้เห็นว่ากิจกรรมที่เพิ่มขึ้นกับจำนวน ofhdacisoforms แม้ว่าภาพรวมกิจกรรมของพวกเขาในช่วง
ยังคงห่างไกลจากค่าการยับยั้งการรายงาน saha นอกจากนี้ยังแตกต่างจาก
สิ่งที่ถูกรายงานว่าเป็น analogues กรด hydroxamic ของพวกเขาใหม่ R-oxime อนุพันธ์ amide
ไม่เลือกระหว่าง Class I และ II ชั้น hdacs; ค่อนข้างพวกเขากำหนดเป้​​าหมายที่เฉพาะเจาะจงในไอโซฟอร์ม
แต่ละชั้นเรียน ผลเหล่านี้ขัดแย้งอย่างใดถูกลัทธิในที่สุดโดยการคำนวณ
ช่วย sar ซึ่งทำให้เรามีโอกาสที่จะเข้าใจวิธีการที่ตลาดอนุพันธ์ oxime โต้ตอบกับเว็บไซต์ของตัวเร่งปฏิกิริยาและปรับ
รายละเอียดกิจกรรมการสังเกต

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หลาย oxime ประกอบด้วยโมเลกุล ลักษณะโครงสร้างเหมือนบริษัทสห,
ถูกสำรวจต้องเป็นองค์รวม biasing อาจใหม่สำหรับสังกะสีใน
HDAC ไซต์ตัวเร่งปฏิกิริยา สารทั้งหมดถูกประเมินสำหรับกิจกรรมของลิปกลอสไขใน
กับ isoforms HDACs มนุษย์ 11 หลังจากรหัสของโมเลกุล "ตี" เป็น
โปรแกรมการเปลี่ยนแปลงที่กลุ่มหมวก และที่ตัวเชื่อมโยงข้อมูลที่ถูกทำเพื่อ
เพิ่มวิธียับยั้งหรือ paralogue HDAC ของอนุพันธ์ใหม่
พบกิจกรรมเพิ่มขึ้นจาก ofHDACisoforms หมายเลข แม้ว่ากิจกรรมของพวกเขาโดยรวม
ช่วงเป็นยังมากค่ายับยั้งรายงานสำหรับบริษัทสห นอกจากนี้ แตกต่างจาก
อะไรมีรายงานสำหรับการ hydroxamic กรด analogues ใหม่ R oxime amide อนุพันธ์
เลือกระหว่างเรียนผมและชั้น II HDACs แต่ พวกเขาเป้าหมาย isoforms เฉพาะใน
ประเภทแต่ละประเภท ผลลัพธ์เหล่านี้ขัดแย้งอย่างใดถูก rationalized โดยการคำนวณสุดท้าย
ช่วยเขตบริหารพิเศษ ซึ่งให้เรามีโอกาสที่จะเข้าใจวิธีอนุพันธ์ oxime โต้ตอบกับไซต์ตัวเร่งปฏิกิริยา และจัด การ
สังเกตค่ากิจกรรม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

oxime หลายๆแบบที่ประกอบด้วยโมเลกุลของลักษณะโครงสร้างเบาบางที่มีลักษณะคล้าย
ได้สำรวจเพื่อเลือกส่วนที่อาจทำให้เกิดความเสียหายที่มีผลผูกพัน biasing ใหม่สำหรับสังกะสีที่อยู่ในเว็บไซต์มีเครื่องฟอกไอเสีย
hdac . คนไทยทั้งหมดได้รับการประเมินเพื่อการทำกิจกรรม inhibitory ใน Vitro ของเขา
ต่อ 11 isoforms hdacs มนุษย์ หลังจากการระบุตัวตนของ"ชน"โมเลกุลที่
ตามมาตรฐานการเปลี่ยนแปลงโปรแกรมที่กลุ่มและที่ครอบที่ Linker ที่เป็นการกระทำในการสั่งซื้อในตัวเลือกและ/หรือ paralogue ยับยั้ง hdac
ซึ่งจะช่วยเพิ่มขึ้น ใหม่สัญญาซื้อขายล่วงหน้า
ซึ่งจะช่วยให้การทำงานของบางอย่างที่เพิ่มขึ้นกับ ofhdacisoforms จำนวนหนึ่งได้หากการทำงานโดยรวมของพวกเขา
ช่วงยังอยู่ไกลจากค่าข้อห้ามที่แจ้งให้ทราบสำหรับเบาบาง ยิ่งไปกว่านั้นแตกต่างจาก
ตามมาตรฐานมีรายงานว่าสำหรับน้ำกรด hydroxamic ของสัญญาซื้อขายล่วงหน้านัก amide R - oxime ใหม่
ไม่ได้เลือกระหว่าง Class I และ II hdacs แต่เป้าหมาย isoforms เฉพาะใน
แต่ละ จะด้วยเหตุผลกลใดก็ตามทีให้ผลที่ขัดแย้งกันต่อไปนี้เป็นนวัตกรรมกระเตื้องขึ้นโดยค่า SAR
ซึ่งจะช่วยให้ความช่วยเหลือที่ให้เรามีโอกาสที่จะทำความเข้าใจว่าสัญญาซื้อขายล่วงหน้า oxime ที่ติดต่อกับไซต์มีเครื่องฟอกไอเสียและสร้างความชอบธรรมให้ได้
สุดท้ายสังเกตเห็นโปรไฟล์กิจกรรม