Human CDP/cut and its murine counte

Human CDP/cut and its murine counterpart, cux1/CDP are homeodomain repressor proteins in the family of Drosophila Cut. Northern blot analysis reveals complex alternative splicing, including forms too small to encode the full 1505 amino acid protein. We have characterized a CDP/cut alternatively spliced cDNA (CASP) of 3.4 kb. Human CASP, a predicted 678 amino acid polypeptide, shares 400 amino acids with CDP, but has an alternate N terminal exon of 20 aa, and the C-terminal 258 amino acids diverge from CDP/cut entirely. As the unique C-terminus of CASP lacks the three 'cut-repeats' and homeodomain of CDP/cut, we predict it does not bind DNA. Murine CASP, 96% similar to human, shares these features. Database searches identify homologs in chicken (86% identical to human CASP) and yeast (29% identical to human). Murine CASP mRNA is ubiquitous in mouse tissues and in tissue-culture cell lines. We generated a specific antiserum against the unique C-terminus of CASP, and used this reagent to demonstrate that CASP protein is expressed as an approx. 80 kDa protein in human and murine cells. Co-translation of in vitro-translated CDP and CASP mRNA, followed by immunoprecipitation with specific anti-CASP IgG, shows that CASP polypeptide can from a complex with CDP. Studies of the intron/exon structure of the murine cux/CDP/mCASP locus (>> 100 kb) reveal that the unique 3' exons of CASP are interposed between cut-repeats 2 and 3 of the cux gene. We speculate that a primordial CASP-like gene captured a cut-repeat-homeobox gene to give rise to the eukaryotic Cut/CDP family of proteins.FAU - Lievens, P MAU - Lievens P.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มนุษย์ CDP/ตัด และคู่ของ murine, cux1/CDP เป็นโปรตีน repressor homeodomain ในครอบครัวของแมลงตัด วิเคราะห์น้าเหนือเผยซับซ้อนอื่นประกบ รวมทั้งรูปแบบขนาดเล็กเกินไปที่เข้ารหัสโปรตีนกรดอะมิโนทั้งหมด 1505 เรามีลักษณะ cDNA CDP/ตัด หรือ ทาสี (CASP) 3.4 kb มนุษย์ CASP กรดอะมิโน 678 polypeptide คาดการณ์ หุ้น 400 กรดอะมิโนกับ CDP แต่มีการสลับ N นัล exon 20 aa และอาคารผู้โดยสาร C กรดอะมิโน 258 ปมากจาก CDP/ตัด ทั้งหมด เป็นเฉพาะ C terminus ของ CASP ขาด 'ตัดทำซ้ำ' สามและ homeodomain ของ CDP/ตัด เราคาดผูกดีเอ็นเอ CASP murine คล้ายกับมนุษย์ 96% หุ้นคุณลักษณะเหล่านี้ ค้นหาฐานข้อมูลระบุ homologs ในไก่ (เหมือนกับมนุษย์ CASP 86%) และยีสต์ (29% เหมือนกับมนุษย์) CASP murine mRNA จะแพร่หลาย ในเมาส์เนื้อเยื่อ และเซลล์เนื้อเยื่อเส้น เราสร้าง antiserum ที่เฉพาะเจาะจงกับเฉพาะ C terminus ของ CASP และใช้รีเอเจนต์นี้แสดงให้เห็นว่า โปรตีน CASP แสดงเป็นโปรตีน 80 kDa การประมาณในเซลล์มนุษย์ และ murine แปลร่วมในหลอดทดลองแปล CDP และ CASP mRNA ตาม ด้วย immunoprecipitation จึงมี IgG เฉพาะต่อต้าน-CASP แสดงว่า CASP polypeptide สามารถจากซับซ้อนที่มี CDP ด้วย ศึกษาโครงสร้างของที cux/CDP/mCASP murine intron/exon (>> 100 kb) เปิดเผยว่า exons เฉพาะ 3' ของ CASP คนนี้จะ interposed ระหว่างตัดทำซ้ำ 2 และ 3 ของยีน cux เราคาดว่า CASP เหมือนยีนแรกจับยีนตัดทำซ้ำ-homeobox มาครอบครัว ตัด/CDP eukaryotic ของโปรตีน P. Lievens FAU - P MAU, Lievens-

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มนุษย์ CDP / ตัดและคู่หมาของ cux1 / CDP จะ Homeodomain โปรตีนอดกลั้นในครอบครัวของแมลงหวี่ตัด วิเคราะห์ blot ภาคเหนือเผยประกบทางเลือกที่ซับซ้อนรวมทั้งรูปแบบขนาดเล็กเกินไปในการเข้ารหัสเต็ม 1505 อะมิโนโปรตีนกรด เรามีความโดดเด่น CDP / ตัดแต่งงานผลัดยีน (CASP) 3.4 KB CASP มนุษยชนที่คาดการณ์ไว้ 678 กรดอะมิโน polypeptide หุ้น 400 กรดอะมิโนที่มี CDP แต่มีการสลับขั้ว N เอกซ์ซอน 20 AA และกรดอะมิโน 258 C-ขั้วแตกต่างจาก CDP / ตัดทั้งหมด ในฐานะที่เป็นที่ไม่ซ้ำกัน C-ปลายทางของ CASP ขาดสาม 'ตัดซ้ำและ Homeodomain ของ CDP / ตัดเราคาดการณ์ว่ามันไม่ได้ผูกดีเอ็นเอ หมา CASP 96% คล้ายกับมนุษย์หุ้นคุณสมบัติเหล่านี้ ค้นหาฐานข้อมูลระบุ homologs ในไก่ (86% เหมือนกันกับมนุษย์ CASP) และยีสต์ (29% เหมือนกันกับมนุษย์) หมา CASP mRNA เป็นที่แพร่หลายในเนื้อเยื่อเมาส์และในเซลล์เนื้อเยื่อวัฒนธรรม ทางเราได้สร้าง antiserum เฉพาะที่ไม่ซ้ำกันกับ C-ปลายทางของ CASP และใช้น้ำยานี้เพื่อแสดงให้เห็นว่า CASP โปรตีนจะแสดงเป็นประมาณ 80 กิโลดาลตันโปรตีนในเซลล์มนุษย์และหมา ร่วมแปลของ CDP ในหลอดทดลองแปลและ CASP mRNA ตาม immunoprecipitation กับเฉพาะป้องกัน CASP IgG แสดงให้เห็นว่า CASP polypeptide สามารถจากที่ซับซ้อนที่มี CDP การศึกษาโครงสร้าง intron / เอกซ์ซอนของหมา Cux / CDP / mCASP สถานที (>> 100 Kb) เปิดเผยว่าที่ไม่ซ้ำกัน 3 'exons ของ CASP จะ interposed ระหว่างตัดซ้ำที่ 2 และ 3 ของยีน Cux เราคาดการณ์ว่าลำดับของยีน CASP เหมือนจับยีนตัดซ้ำ homeobox ที่จะก่อให้เกิด eukaryotic ตัด / ครอบครัวของ CDP proteins.FAU - Lievens, P MAU - Lievens พี

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตัด CDP / มนุษย์และ ~ คู่ cux1 / CDP เป็นผู้ควบคุม homeodomain โปรตีนในครอบครัวของบ้านตัด Northern blot analysis พบซับซ้อน splicing ทางเลือก รวมทั้งรูปแบบขนาดเล็กเกินไปที่จะเข้ารหัสเต็มห กรดอะมิโน โปรตีน ขณะนี้มีลักษณะเป็น CDP / ตัดยีนหรือไม ( casp ) 3.4 กิโลไบต์ casp มนุษย์ ทำนายด้วยกรดอะมิโน polypeptide , หุ้น 400 กรดอะมิโนกับ CDP แต่ได้สลับขั้ว N ล้อหน้า 20 AA และ 258 กรดอะมิโนซึ่งแตกต่างจาก CDP / ตัดทั้งหมด เป็น c-terminus เฉพาะของ casp ขาดสาม " ตัดซ้ำ " และ homeodomain ของ CDP / ตัด เราคาดการณ์ไม่ได้ผูกดีเอ็นเอ ~ casp 96 % คล้ายกับมนุษย์หุ้นคุณลักษณะเหล่านี้ การค้นหาฐานข้อมูลระบุโฮโมลอกส์ในไก่ ( 86 % เหมือนกัน casp มนุษย์ ) และยีสต์ ( 29 % เหมือนมนุษย์ ) ~ casp mRNA เป็นที่แพร่หลายในเนื้อเยื่อเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อเซลล์เมาส์และในบรรทัด เราสร้างแอนติซีรัมที่เฉพาะเจาะจงกับ c-terminus เฉพาะของ casp และใช้รีเอเจนต์นี้แสดงให้เห็นว่าโปรตีน casp แสดงเป็นประมาณ 80 kDa และโปรตีนในเซลล์มนุษย์และ ~ . ร่วมแปลในหลอดทดลองแปล CDP casp mRNA และตามด้วย immunoprecipitation เฉพาะ anti IgG casp แสดงว่า casp polypeptide สามารถจากที่ซับซ้อนกับ CDP . การศึกษาโครงสร้าง iNtRON / ชนิดของ ~ cux / CDP / mcasp โลคัส ( > 100 KB ) เปิดเผยว่า เฉพาะ 3 " ที่มีของ casp เป็น interposed ระหว่างตัดซ้ำที่ 2 และ 3 ของยีน cux . เราคาดการณ์ว่า casp ประถม อย่างจีน จับตัดย้ำ homeobox ยีนให้สูงขึ้นเพื่อตัด / CDP เข้ามาในครอบครัวของ proteins.fau - lievens P MAU - lievens P