Maximum parsimonyand maximum likeli

Maximum parsimony
and maximum likelihood trees were generated with heuristic
searches. Starting tree(s) were obtained via stepwise addition.
Addition of sequences was at random with 100 replicates. The
branch-swapping algorithm was tree-bisection reconnection
(TBR). We ran two Bayesian analyses with four chains each, one
million generations, sampling frequency of 100, and a burn-in of
250,000 generations. Support for nodes was assessed with bootstrap
(1000 replicates for neighbour joining and maximum parsimony
and 100 replicates for maximum likelihood) and posterior
probability for Bayesian analyses.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Parsimony สูงสุดและต้นไม้สูงโอกาสเกิด ด้วย heuristicค้นหา Tree(s) เริ่มต้นได้รับมาทางนี้ stepwiseนอกจากนี้ลำดับถูกสุ่ม ด้วยเหมือนกับ 100 ที่อัลกอริทึมที่เปลี่ยนสาขามีต้นไม้ bisection เชื่อมต่ออีก(TBR) เราวิ่งสองทฤษฎีวิเคราะห์ ด้วยโซ่ 4 ละรุ่นล้าน ความถี่ในการสุ่มตัวอย่าง 100 และการเผาไหม้ในของรุ่น 250000 สนับสนุนโหนถูกประเมินกับ bootstrap(1000 เหมือนกับเพื่อนบ้านที่เข้าร่วมและ parsimony สูงสุดและเหมือนกับในความเป็นไปได้สูงสุด 100) และหลังน่าเป็นทฤษฎีวิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประหยัดสูงสุด
และความน่าจะเป็นต้นไม้ที่สูงสุดถูกสร้างขึ้นด้วยแก้ปัญหา
การค้นหา เริ่มต้น (s) ที่ได้รับผ่านทางนอกจากนี้ขั้นตอน.
นอกเหนือจากลำดับที่สุ่มที่มี 100 ซ้ำ
อัลกอริทึมสาขาการแลกเปลี่ยนเป็นต้นไม้แยกเป็นสองส่วนเชื่อมต่อ
(TBR) เราวิ่งสองวิเคราะห์คชกรรมกับสี่โซ่แต่ละหนึ่ง
ล้านรุ่นความถี่ 100 และการเผาไหม้ในที่
250,000 คนรุ่น การสนับสนุนสำหรับโหนดได้รับการประเมินด้วยบูต
(1000 ซ้ำเพื่อนบ้านเข้าร่วมและความประหยัดสูงสุด
และ 100 ซ้ำสำหรับความน่าจะเป็นสูงสุด) และหลัง
น่าจะเป็นสำหรับการวิเคราะห์แบบเบย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตระหนี่สูงสุดและต้นไม้ความน่าจะเป็นสูงสุดถูกสร้างขึ้น ด้วยการค้นหาแบบ

เริ่มต้น ( s ) ที่ได้รับผ่าน ? นอกจากนี้ นอกจากนี้ได้สุ่มลำดับ
100 ได้แก่
สาขาการเปลี่ยนขั้นตอนวิธีต้นไม้ bisection ต่อสัญญาณ
( TBR ) เราตรวจวิเคราะห์แบบสองกับสี่โซ่แต่ละหนึ่ง
ล้านรุ่นการสุ่มตัวอย่างความถี่ 100 และเผาของ
250 ,000 ชั่วอายุ การสนับสนุนสำหรับโหนดที่ได้รับกับบู
( 1000 ซ้ำสำหรับเพื่อนบ้านร่วมงานและ
ตระหนี่สูงสุด 100 แบบสำหรับโอกาสสูงสุด ) และด้านหลัง
ความน่าจะเป็นการวิเคราะห์คชกรรม .