The microbial compositions of the f

The microbial compositions of the four bioreactors were monitored over 8 days using a cultivation independent method based on the classification of partial 16S rRNA gene sequences. A total of 993,415 high quality amplicon sequences from 18 microbial samples were obtained. The sequencing data and the microbial diversity indices are shown in Table 2. The bioreactors were all seeded using activate sludge on day 0 (SPP-0, WPP-0, BP-0 and OP-0) and sequencing data showed that they had a high number of operational taxonomic units (OTUs; 560-616), which is in accordance with the microbial diversity of activated sludge (Liang et al., 2015a, Wang et al., 2012 and Zhang et al., 2012). The number of OTUs decreased significantly as the reactor operation time increased and only 72-111 OTUs were observed on day 8. Similar results were also reported for the diversity found in the mixed cultures fermentation of food products (Jung et al., 2012 and Park et al., 2012). The Shannon-Wiener index and evenness were calculated to assess the internal complexity of individual microbial communities. During the fermentation the Shannon-Wiener indices decreased from 3.05–3.54 to 0.92–1.64. In addition, the evenness of all the bioreactor microbial populations showed a comparable trend, which decreased from 0.75–0.88 to 0.36–0.52. Statistical analysis using PCA was performed to assess the overall variation between microbial communities in the 18 samples (Fig. 2). Results showed that communities of the initial four bioreactors bacteria initially were quite similar and clustered together. The community composition changed during fermentation and ultimately formed a distinct cluster at the end of the fermentation on day 8. This phenomenon was mainly due to the LAB in the seed cultures that can tolerate and thrive at low pH, and produce LA and antimicrobial agents to inhibit and/or kill the growth of other microbes (Dalie et al., 2010).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

องค์ประกอบของ bioreactors 4 จุลินทรีย์ถูกตรวจสอบมากกว่า 8 วันใช้เพาะปลูกเป็นวิธีที่อิสระตามการจัดประเภทบางส่วน 16S rRNA ลำดับยีน รวมลำดับ amplicon คุณภาพสูง 993,415 จาก 18 ตัวอย่างจุลินทรีย์ที่ได้รับ ตารางที่ 2 แสดงข้อมูลลำดับและดัชนีความหลากหลายของจุลินทรีย์ Bioreactors ถูกเรียกใช้โดยใช้เงินทั้งหมดตะกอนในวันที่ 0 (SPP-0, WPP 0, BP-0 และ OP 0) และลำดับข้อมูลแสดงให้เห็นว่า พวกเขามีจำนวนของการดำเนินงานหน่วยอนุกรมวิธาน (OTUs; 560-616), ที่สูงซึ่งสอดคล้องกับความหลากหลายของงานตะกอน (เหลียง et al. 2015a วัง et al. 2012 และ Zhang et al. 2012) จุลินทรีย์ จำนวน OTUs ลดลงอย่างมากเป็นเวลาการดำเนินการเครื่องปฏิกรณ์เพิ่มขึ้นและเพียง 72-111 OTUs ถูกสังเกตวัน 8 ยังมีรายงานผลที่คล้ายกันสำหรับความหลากหลายที่พบในการหมักผสมวัฒนธรรมของผลิตภัณฑ์อาหาร (Jung et al. 2012 และ Park et al. 2012) มีคำนวณดัชนี Wiener แชนนอนและ evenness เพื่อประเมินความซับซ้อนภายในของแต่ละชุมชนที่จุลินทรีย์ ระหว่างการหมัก แชนนอน Wiener ดัชนีลดลงจาก 3.05 – 3.54 เป็น 0.92 – 1.64 นอกจากนี้ evenness ของประชากรทั้งหมดในถังปฏิกรณ์ชีวภาพจุลินทรีย์พบว่าแนวโน้มเปรียบเทียบ ซึ่งลดลงจาก 0.75 – 0.88 เป็น 0.36 – 0.52 การวิเคราะห์ทางสถิติโดยใช้ PCA ที่ได้ดำเนินการประเมินความผันแปรโดยรวมระหว่างชุมชนจุลินทรีย์ในตัวอย่างที่ 18 (2 รูป) ผลลัพธ์แสดงให้เห็นว่า ชุมชนของเชื้อแบคทีเรีย bioreactors สี่เริ่มต้นตอนแรกค่อนข้างคล้ายกัน และคลัสเตอร์ร่วมกัน องค์ประกอบชุมชนเปลี่ยนแปลงในระหว่างการหมัก และในที่สุด เกิดคลัสเตอร์แตกต่างกันเมื่อสิ้นสุดการหมักวัน 8 ปรากฏการณ์นี้เป็นส่วนใหญ่เนื่องจากห้องปฏิบัติการในวัฒนธรรมของเมล็ดพันธุ์ที่สามารถยอมรับ และเติบโตได้ดีที่ pH ต่ำ และผลิตลาและตัวแทนยาต้านจุลชีพเพื่อยับยั้ง และฆ่าการเติบโตของจุลินทรีย์อื่น ๆ (Dalie et al. 2010)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

องค์ประกอบของจุลินทรีย์ในสี่ของเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพถูกตรวจสอบในช่วง 8 วันโดยใช้วิธีการเพาะปลูกที่เป็นอิสระอยู่บนพื้นฐานของการจำแนกประเภทของบางส่วน 16S rRNA ลำดับยีน รวม 993,415 ลำดับ amplicon ที่มีคุณภาพสูงจาก 18 ตัวอย่างจุลินทรีย์ที่ได้รับ ข้อมูลการจัดลำดับและจุลินทรีย์ดัชนีความหลากหลายที่แสดงในตารางที่ 2 bioreactors ทุกเมล็ดใช้เปิดใช้งานตะกอนในวันที่ 0 (SPP-0, WPP-0, BP-0 และ OP-0) และลำดับข้อมูลที่แสดงให้เห็นว่าพวกเขามี จำนวนที่สูงของหน่วยงานการจัดหมวดหมู่การดำเนินงาน (Otus; 560-616) ซึ่งเป็นไปตามความหลากหลายของจุลินทรีย์ตะกอนเร่ง (เหลียง, et al, 2015a วัง et al, 2012 และ Zhang et al, 2012...) จำนวน Otus ลดลงอย่างมีนัยสำคัญเมื่อเวลาการดำเนินงานของเครื่องปฏิกรณ์เพิ่มขึ้นและมีเพียง 72-111 Otus ถูกตั้งข้อสังเกตในวัน 8. ผลที่คล้ายกันนอกจากนี้ยังได้รับรายงานความหลากหลายที่พบในการหมักเชื้อผสมของผลิตภัณฑ์อาหาร (Jung et al., 2012 และอุทยาน et al., 2012) ดัชนี Shannon-Wiener และสมดุลถูกคำนวณในการประเมินความซับซ้อนภายในของกลุ่มจุลินทรีย์ของแต่ละบุคคล ในระหว่างการหมักดัชนี Shannon-Wiener ลดลง 3.05-3.54 0.92-1.64 ไป นอกจากนี้ความเรียบของทุกเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพประชากรจุลินทรีย์พบว่ามีแนวโน้มเทียบเคียงซึ่งลดลง 0.75-0.88 0.36-0.52 ไป การวิเคราะห์ทางสถิติโดยใช้ PCA ได้ดำเนินการในการประเมินรูปแบบโดยรวมระหว่างชุมชนจุลินทรีย์ใน 18 ตัวอย่าง (รูปที่. 2) ผลการศึกษาพบว่าชุมชนของเริ่มต้นสี่ถังหมักแบคทีเรียขั้นต้นค่อนข้างคล้ายกันและร่วมกันคลัสเตอร์ องค์ประกอบชุมชนเปลี่ยนแปลงในระหว่างการหมักและในที่สุดกลายเป็นคลัสเตอร์ที่แตกต่างกันในตอนท้ายของการหมักในวันที่ 8 ปรากฏการณ์นี้เป็นส่วนใหญ่เนื่องจากการห้องปฏิบัติการในวัฒนธรรมของเมล็ดพันธุ์ที่สามารถทนต่อการเจริญเติบโตและที่ pH ต่ำและผลิตแอลเอและตัวแทน antimicrobial ไป ยับยั้งและ / หรือฆ่าเจริญเติบโตของจุลินทรีย์อื่น ๆ (Dalie et al., 2010)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ส่วนประกอบของเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพจุลินทรีย์ทั้งสี่ถูกกว่า 8 วัน โดยใช้วิธีการปลูกอิสระขึ้นอยู่กับประเภทของบางส่วนของยีน 16S rRNA ลำดับ รวม 993415 คุณภาพสูงและลำดับ 18 ตัวอย่างจากจุลินทรีย์ได้ การจัดข้อมูลและดัชนีความหลากหลายของจุลินทรีย์จะถูกแสดงในตารางที่ 2 การใช้กากเมล็ดโดยใช้เครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพทั้งหมด ในวันที่ 0 ( spp-0 wpp-0 bp-0 , และ , op-0 ) และข้อมูลลำดับ พบว่า มีจำนวนสูงของหน่วยปฏิบัติการ ( ในทาง ; 560-616 ) ซึ่งสอดคล้องกับความหลากหลายของจุลินทรีย์ในกากตะกอนน้ำเสีย ( Liang et al . , 2015a วัง et al . , 2012 และ Zhang et al . , 2012 ) เลขในเครื่องปฏิกรณ์ลดลงเมื่อเวลาเพิ่มขึ้น และพบว่ามีเพียง 72-111 ในวันที่ 8 ซึ่งการรายงานสำหรับความหลากหลายที่พบในการหมักเชื้อผสมของผลิตภัณฑ์อาหาร ( จอง et al . , 2012 และสวนสาธารณะ et al . , 2012 ) โดยแชนนอนไส้กรอกดัชนีและ evenness คำนวณประเมินความซับซ้อนภายในของชุมชนจุลินทรีย์แต่ละ ในระหว่างการหมัก แชนนอน วีเนอร์ ดัชนีลดลงจาก 3.05 และ 3.54 ถึง 0.92 และ 1.64 นอกจากนี้ สมดุลทุกเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพจุลินทรีย์กลุ่มมีแนวโน้มเปรียบ ซึ่งลดลงจาก 0.75 0.88 ถึง 0.36 และ 0.52 – . สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล โดยใช้วิธีการประเมินรูปแบบโดยรวมระหว่างชุมชนจุลินทรีย์ใน 18 ตัวอย่าง ( รูปที่ 2 ) ผลการศึกษาพบว่า ชุมชนของ เริ่มต้น สี่เครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพแบคทีเรียเริ่มต้นมีความคล้ายคลึงกันมากและกระจุกกัน องค์ประกอบของชุมชนเปลี่ยนแปลงไปในระหว่างการหมักและในที่สุดเกิดกลุ่มที่แตกต่างกันในตอนท้ายของกระบวนการหมักในวันที่ 8 ปรากฏการณ์นี้เป็นส่วนใหญ่เนื่องจากห้องแล็บในวัฒนธรรมเมล็ดที่สามารถทนและเจริญเติบโตที่ pH ต่ำ และผลิตยาต้านจุลชีพที่ LA และยับยั้งและ / หรือฆ่าการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์อื่น ๆ ( dalie et al . , 2010 )