Results: In order to determine the

Results: In order to determine the potential substrate preference of bifidobacteria, we compared the glycoside hydrolase (GH) profiles of a pooled-bifidobacterial genome (PBG) with a representative microbiome (RM) of the human gut. In bifidobacterial genomes, only 15% of GHs contained signal peptides, suggesting their weakness in utilization of complex carbohydrate, such as plant cell wall polysaccharides. However, compared with other intestinal bacteria, bifidobacteiral genomes encoded more GH genes for degrading starch and starch hydrolysates, indicating that they have genetic advantages in utilizing these substrates. Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68 isolated from centenarian’s faeces was used as a model strain to further investigate the carbohydrate utilization. The pathway for degrading starch and starch hydrolysates was the only complete pathway for complex carbohydrates in human gut. It is noteworthy that all of the GH genes for degrading starch and starch hydrolysates in the BBMN68 genome were conserved in all studied bifidobacterial strains. The in silico analyses of BBMN68 were further confirmed by growth experiments, proteomic and real-time quantitative PCR (RT-PCR) analyses.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์: เพื่อกำหนดกำหนดลักษณะพื้นผิวเป็นของ bifidobacteria เราเปรียบเทียบโพรไฟล์ hydrolase (GH) glycoside ของจีโนม bifidobacterial ทางถูกพู (PBG) กับ microbiome เป็นตัวแทน (RM) ของลำไส้มนุษย์ ใน bifidobacterial genomes เพียง 15% ของกฏ GHs ประกอบด้วยเปปไทด์สัญญาณ การแนะนำจุดอ่อนของพวกเขาในการใช้ประโยชน์ของคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อน เช่น polysaccharides ผนังเซลล์พืช อย่างไรก็ตาม เมื่อเทียบกับอื่น ๆ แบคทีเรียในลำไส้ bifidobacteiral genomes เข้ารหัสยีนของ GH เพิ่มเติมลดแป้งและแป้ง hydrolysates ระบุว่า พวกเขามีข้อได้เปรียบทางพันธุกรรมในการใช้พื้นผิวเหล่านี้ Bifidobacterium longum ถั่ว longum BBMN68 โดดเดี่ยว faeces ของ centenarian ถูกใช้เป็นต้องใช้รูปแบบการตรวจสอบการใช้ประโยชน์คาร์โบไฮเดรตเพิ่มเติม ทางเดินสำหรับลดแป้งและแป้ง hydrolysates มีทางเดินเฉพาะเมื่อเสร็จสมบูรณ์สำหรับคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อนในลำไส้มนุษย์ เป็นที่น่าสังเกตว่า ทั้งหมดของยีน GH ลดแป้งและแป้ง hydrolysates ในกลุ่ม BBMN68 ที่อยู่ในสายพันธุ์ bifidobacterial ที่ศึกษาทั้งหมด ยืนยัน silico ในการวิเคราะห์ของ BBMN68 ถูกเพิ่มเติม โดยการทดลองการเจริญเติบโต proteomic และ PCR จริงเชิงปริมาณวิเคราะห์ (RT-PCR)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลการศึกษา: เพื่อตรวจสอบการตั้งค่าพื้นผิวที่มีศักยภาพของ bifidobacteria เราเมื่อเทียบ glycoside hydrolase นี้ (GH) โพรไฟล์ของจีโนม pooled-bifidobacterial (PBG) กับ microbiome ตัวแทน (RM) ของทางเดินอาหารของมนุษย์ ในจีโนม bifidobacterial เพียง 15% ของเปปไทด์ที่มี GHS สัญญาณบอกจุดอ่อนของพวกเขาในการใช้ประโยชน์จากคาร์โบไฮเดรตเชิงซ้อนเช่น polysaccharides ผนังเซลล์พืช แต่เมื่อเทียบกับแบคทีเรียในลำไส้อื่น ๆ bifidobacteiral จีโนมการเข้ารหัสยีน GH มากขึ้นสำหรับการย่อยสลายแป้งและไฮโดรไลเซแป้งแสดงให้เห็นว่าพวกเขามีข้อได้เปรียบทางพันธุกรรมในการใช้พื้นผิวเหล่านี้ Bifidobacterium longum subsp longum BBMN68 ที่แยกได้จากอุจจาระครบร้อยปีของเขาถูกนำมาใช้เป็นสายพันธุ์รูปแบบเพื่อตรวจสอบการใช้คาร์โบไฮเดรต ทางเดินสำหรับย่อยสลายแป้งและไฮโดรไลเซแป้งเป็นเพียงทางเดินที่สมบูรณ์แบบสำหรับคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อนในลำไส้ของมนุษย์ เป็นที่น่าสังเกตว่าทั้งหมดของยีน GH สำหรับย่อยสลายแป้งและไฮโดรไลเซแป้งในจีโนม BBMN68 ถูกอนุรักษ์ในทุกการศึกษาสายพันธุ์ bifidobacterial ใน silico วิเคราะห์ BBMN68 ได้รับการยืนยันต่อไปโดยการทดลองการเจริญเติบโตของโปรตีนและ real-time PCR เชิงปริมาณ (RT-PCR) วิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลลัพธ์ : เพื่อตรวจสอบศักยภาพหลากหลายความชอบ บิฟิโดแบคทีเรีย เราเทียบ Glycoside ไฮโดรเลส ( GH ) โปรไฟล์ของพู bifidobacterial จีโนม ( PBG ) กับตัวแทนไมโครไบโ ( RM ) ของลำไส้ของมนุษย์ ใน bifidobacterial จีโนมเพียง 15% ของ GHS ประกอบด้วยเปปไทด์สัญญาณชี้ให้เห็นจุดอ่อนในการใช้ประโยชน์ของคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อนเช่นผนังเซลล์ของพืชโดย . อย่างไรก็ตาม เมื่อเทียบกับแบคทีเรียในลำไส้อื่น ๆ bifidobacteiral จีโนมเข้ารหัสยีน GH สำหรับสลายแป้งและแป้งของ ระบุว่า พวกเขามีข้อได้เปรียบทางพันธุกรรมในการใช้พื้นผิวเหล่านี้ ไบฟิโดแบคทีเรีย longum subsp .ที่แยกได้จากอุจจาระ longum bbmn68 ฝังหัวก็ถูกใช้เป็นแบบจำลองความเครียดที่จะศึกษาเพิ่มเติมเป็นประโยชน์ . ทางเดินสำหรับการย่อยสลายของแป้งและแป้งเป็นเพียงสมบูรณ์ทางเดินสำหรับคาร์โบไฮเดรตเชิงซ้อนในลำไส้ของมนุษย์มันเป็นน่าสังเกตว่าทั้งหมดของ GH ยีนสลายแป้งและแป้งในจีโนมของ bbmn68 เป็นป่าสงวนในการศึกษาสายพันธุ์ bifidobacterial . ในการวิเคราะห์ bbmn68 นได้ยืนยันโดยการทดลองการเจริญเติบโตและปริมาณโปรตีนเรียลไทม์พีซีอาร์ ( RT-PCR ) วิเคราะห์ข้อมูล