The preT ribosome contains a deacyl

The preT ribosome contains a deacylated tRNA in the P site (Figure 1b), which may be important for the GDP-to-GTP exchange reaction. This is suggested by experiments on guanine-nucleotide binding to EF-G in another type of ribo- some complex. Here, EF-G was incubated with [3H]-GDPNP and either post-termination (postTerm) or naked ribosomes at varying concentrations of unlabeled GDP (Figure 2d). The postTerm ribosome has a deacylated tRNA in the P site and an empty A site programmed with a stop codon (Figure 1d), while the naked ribosome lacks ligands. The fraction of [3H]-GDPNP retained on a nitrocellulose filter, correspond- ing to ribosome-bound EF-G•[3H]-GDPNP, was reduced to 50% at a 160-fold excess of GDP in the postTerm case, or a 13-fold excess for the naked ribosomes. This implies that EF-G, bound to either type of ribosome, had much higher affinity for GDPNP than for GDP, and that the difference was more pronounced for postTerm than for naked ribo- somes (Figure 2d,e). Accordingly, the presence of a deacylated tRNA in the P site of the preT ribosome led to more stable binding of EF-G•[3H]-GDPNP to this complex than to the naked ribosome. A corresponding stabilization of the EF-G•GTP complex on preT ribosomes by the P-site tRNA is expected, and would contribute to efficient guanine- nucleotide exchange (Figure 2c).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Deacylated ประกอบด้วยไรโบโซม preT tRNA ในไซต์ P (รูปที่ 1b), ซึ่งอาจจะสำคัญสำหรับปฏิกิริยาแลกเปลี่ยน GDP GTP นี้จะแนะนำ โดยทดลองกับ guanine-นิวคลีโอไทด์ผูก EF-G ชนิดอื่น ribo-คอมเพล็กซ์บาง ที่นี่ EF G ถูก incubated กับ [3H] -GDPNP และสิ้นสุดอย่างใดอย่างหนึ่งหลัง (postTerm) หรือ ribosomes เปลือยที่ความเข้มข้นแตกต่างกันของ GDP ไม่ (รูปที่ 2d) Deacylated มีไรโบโซม postTerm tRNA ในไซต์ P และไซต์โปรแกรม ด้วยรหัสพันธุกรรมหยุด (รูปที่ 1 d), ในขณะที่ไรโบโซมเปล่าว่างขาด ligands เศษ [3 H] -สะสมในกรอง nitrocellulose ตรงกำลังจะผูกกับไรโบโซม EF-G• [3H] GDPNP - GDPNP ถูกลด 50% ที่เกิน 160-fold ของ GDP ในกรณี postTerm หรือเกิน 13-fold สำหรับ ribosomes เปลือย หมายความว่า EF-G กับชนิดของไรโบโซม มีความสัมพันธ์สูงมากสำหรับ GDPNP กว่า GDP และว่า ความแตกต่างได้อย่างเด่นชัดสำหรับ postTerm กว่าเปลือย ribo-somes (รูป 2d, e) ตาม ของ deacylated เป็น tRNA ในไซต์ P ของไรโบโซม preT นำไปผูกที่มั่นคงของ EF-G• [3H] -GDPNP นี้ซับซ้อนกว่าการไรโบโซมเปลือย เสถียรภาพที่สอดคล้องกันของคอมเพล็กซ์ EF G•GTP บน ribosomes preT โดย tRNA P ไซต์คาดว่า และจะนำไปสู่การแลกเปลี่ยนมีประสิทธิภาพ guanine นิวคลีโอไทด์ (รูปที่ 2 c)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไรโบโซม Pret มี deacylated tRNA ในเว็บไซต์ P (รูปที่ 1b) ซึ่งอาจจะเป็นสิ่งสำคัญสำหรับจีดีพีที่จะฉี่ปฏิกิริยาแลกเปลี่ยน นี้เป็นข้อเสนอแนะจากการทดลองใน guanine เบื่อหน่ายผูกพันกับ EF-G ในรูปแบบของ ribo- ซับซ้อนบางอย่างอื่น นี่ EF-G ถูกบ่มด้วย [3H] -GDPNP และทั้งโพสต์สิ้นสุด (postterm) หรือไรโบโซมเปล่าที่ความเข้มข้นแตกต่างกันของจีดีพีที่ไม่มีป้ายกำกับ (รูปที่ 2d) ไรโบโซม postterm มี tRNA deacylated ในเว็บไซต์ P และเว็บไซต์ที่ว่างเปล่าที่มีโปรแกรมหยุด codon (รูปที่ 1D) ในขณะที่ไรโบโซมเปล่าขาดแกนด์ ส่วนของ [3H] -GDPNP สะสมกรอง nitrocellulose, ไอเอ็นจี correspond- ไรโบโซมที่จะผูกพัน EF-G • [3H] -GDPNP ถูกลดลงถึง 50% ในส่วนที่เกิน 160 เท่าของ GDP ในกรณี postterm หรือ ส่วนที่เกิน 13 เท่าสำหรับไรโบโซมเปล่า นี่ก็หมายความว่า EF-G, ผูกพันกับประเภทของไรโบโซมทั้งสองมีความใกล้ชิดมากขึ้นสำหรับ GDPNP กว่า GDP และความแตกต่างที่เด่นชัดมากขึ้นสำหรับ postterm กว่าโฟร์ซัม ribo- เปล่า (รูปที่ 2d, จ) ดังนั้นการปรากฏตัวของ deacylated tRNA ในเว็บไซต์ของไรโบโซม P Pret นำไปสู่​​การมีเสถียรภาพมากขึ้นผูกพันของ EF-G • [3H] -GDPNP ซับซ้อนกว่านี้เพื่อไรโบโซมเปล่า เสถียรภาพที่สอดคล้องกันของ EF-G •ฉี่ซับซ้อนในไรโบโซม Pret โดย tRNA P-เว็บไซต์ที่มีการคาดหวังและจะนำไปสู่​​การแลกเปลี่ยนที่มีประสิทธิภาพ guanine- เบื่อหน่าย (รูปที่ 2c)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Pret ไรโบโซมประกอบด้วย deacylated ทีอาร์เอ็นเอใน P site ( รูปที่ 1A ) ซึ่งอาจจะสำคัญสำหรับจีดีพี GTP ปฏิกิริยาแลกเปลี่ยน นี่คือที่แนะนำโดยการทดลองในเบสกัวนีน ผูกพันกับ ef-g ในประเภทของ ribo อีกบางส่วนที่ซับซ้อน ที่นี่ ef-g ถูกบ่มด้วย [ 3 ] - gdpnp และประกาศยกเลิก ( ยัง ) หรือไรโบโซมเปลือยที่ความเข้มข้นแตกต่างกันของ GDP ใกล้เคียงกัน ( รูปที่ 2 )ที่แร็ตเชตยังมี deacylated ทีอาร์เอ็นเอใน P site และว่างเปล่า เว็บไซต์ โปรแกรมที่มีรหัสหยุด ( คิดดี ) ส่วนไรโบโซมเปลือยขาดลิแกนด์ . ส่วนของ [ 3 ] - gdpnp เก็บไว้บนไนโตรกรองสอดคล้องกับ - ing ไรโบโซม ผูกพัน ef-g - [ 3 ] - gdpnp ถูกลด 50% ที่เกิน 160 เท่าของ GDP ในกรณียัง หรือ 13 พับส่วนเกินสำหรับไรโบโซมเปลือยนอกจากนี้ ef-g ผูกกับชนิดของไรโบโซมเช่นกัน มี affinity สูงมากสำหรับ gdpnp กว่า GDP และความแตกต่างที่เด่นชัดมากขึ้นสำหรับคุณลักษณะกว่าเปลือย ribo - ซั่ม ( รูป 2D , E ) ดังนั้นการปรากฏตัวของ deacylated ทีอาร์เอ็นเอใน P เว็บไซต์ของเปรตไรโบโซมนำไปสู่เสถียรภาพมากขึ้นผูกพันของ ef-g - [ 3 ] - gdpnp ซับซ้อนกว่าที่ให้ไรโบโซมเปลือยที่สอดคล้องเสถียรภาพของ ef-g GTP - คอมเพล็กซ์ เปรตไรโบโซม โดย p-site ทีอาร์เอ็นเอ คาดว่าจะส่งผลให้มีประสิทธิภาพ และกัวนีน - เบื่อหน่ายแลก ( รูปที่ 2 )