Dendrobium officinale Kimura et Mig

Dendrobium officinale Kimura et Migo is a traditional Chinese orchid herb that has both ornamental value and a broad range of therapeutic effects. Here, we report the first de novo assembled 1.35 Gb genome sequences for D. officinale by combining the second-generation Illumina Hiseq 2000 and third-generation PacBio sequencing technologies. We found that orchids have a complete inflorescence gene set and have some specific inflorescence genes. We observed gene expansion in gene families related to fungus symbiosis and drought resistance. We analyzed biosynthesis pathways of medicinal components of D. officinale and found extensive duplication of SPS and SuSy genes, which are related to polysaccharide generation, and that the pathway of D. officinale alkaloid synthesis could be extended to generate 16-epivellosimine. The D. officinale genome assembly demonstrates a new approach to deciphering large complex genomes and, as an important orchid species and a traditional Chinese medicine, the D. officinale genome will facilitate future research on the evolution of orchid plants, as well as the study of medicinal components and potential genetic breeding of the dendrobe.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กล้วยไม้สกุลหวาย officinale คิมุระโยเอ็ดมิโกเป็นดั้งเดิมจีนกล้วยไม้สมุนไพรที่มีค่าสวยงามและหลากหลายของผลการรักษา ที่นี่ เรารายงานแรก de novo ประกอบ 1.35 Gb จีโนมลำดับที่สำหรับ D. officinale โดย second-generation Illumina Hiseq 2000 และรุ่นที่สาม PacBio ลำดับเทคโนโลยี เราพบว่า กล้วยไม้มียีน inflorescence สมบูรณ์ตั้ง และมียีน inflorescence เฉพาะบาง เราสังเกตการขยายยีนในครอบครัวยีนที่เกี่ยวข้องกับการต้านทานเชื้อรา symbiosis และภัยแล้ง เราวิเคราะห์หลักการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาของ D. officinale และพบซ้ำอย่างละเอียดของ SPS และ SuSy ซึ่งเกี่ยวข้องกับรุ่น polysaccharide และทางเดินของการสังเคราะห์อัลคาลอยด์ D. officinale อาจขยายสร้าง 16-epivellosimine แอสเซมบลีจีโนม D. officinale แสดงให้เห็นถึงวิธีการแบบใหม่เพื่อ deciphering genomes ขนาดใหญ่ซับซ้อน และ เป็นพันธุ์กล้วยไม้สำคัญและการแพทย์แผนจีน จีโนม D. officinale จะช่วยในการวิวัฒนาการของพืชออร์คิด ตลอดจนการศึกษาส่วนประกอบของยาและพันธุ์มีศักยภาพทางพันธุกรรมของ dendrobe การวิจัยในอนาคต

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กล้วยไม้สกุลหวาย officinale คิมูระและ Migo เป็นสมุนไพรจีนโบราณกล้วยไม้ที่มีทั้งค่าไม้ประดับและความหลากหลายของผลการรักษา ที่นี่เรารายงานโนโวแรกที่ประกอบ 1.35 Gb ลำดับจีโนมดีสำหรับ officinale โดยการรวมรุ่นที่สอง Illumina Hiseq 2000 และรุ่นที่สาม PacBio ลำดับเทคโนโลยี เราพบว่ากล้วยไม้มียีนช่อดอกที่สมบูรณ์แบบชุดและมีบางยีนช่อดอกที่เฉพาะเจาะจง เราสังเกตเห็นการขยายตัวของยีนในครอบครัวของยีนที่เกี่ยวข้องกับการ symbiosis เชื้อราและทนต่อความแห้งแล้ง เราวิเคราะห์วิถีการสังเคราะห์ของส่วนประกอบของยาของดี officinale และพบว่าการทำสำเนาที่กว้างขวางของ SPS และยีน Susy ซึ่งมีความสัมพันธ์กับรุ่น polysaccharide และทางเดินของดี officinale การสังเคราะห์สารอาจจะขยายการสร้าง 16 epivellosimine ดีประกอบจีโนม officinale แสดงให้เห็นถึงวิธีการใหม่ในการถอดรหัสจีโนมที่ซับซ้อนขนาดใหญ่และเป็นพันธุ์กล้วยไม้ที่สำคัญและการแพทย์แผน​​จีนที่ดี officinale จีโนมจะอำนวยความสะดวกการวิจัยในอนาคตเกี่ยวกับวิวัฒนาการของพืชกล้วยไม้เช่นเดียวกับการศึกษา ส่วนประกอบของสมุนไพรและการปรับปรุงพันธุ์ทางพันธุกรรมที่อาจเกิดขึ้นจาก dendrobe