RNAs adopt specific, stable tertiar

RNAs adopt specific, stable tertiary architectures to perform their activities. Knowledge of RNA tertiary structure is fundamental to understand RNA functions beginning with transcription and ending with turnover. Contrary to advanced RNA secondary structure prediction algorithms, which allow good accuracy when experimental data are integrated into the prediction, tertiary structure prediction of large RNAs still remains a significant challenge. However, the field of RNA tertiary structure prediction is rapidly developing and new computational methods based on different strategies are emerging.

RNAComposer is a user-friendly and freely available server for 3D structure prediction of RNA up to 500 nucleotide residues. RNAComposer employs fully automated fragment assembly based on RNA secondary structure specified by the user. Importantly, this method allows incorporation of distance restraints derived from the experimental data to strengthen the 3D predictions. The potential and limitations of RNAComposer are discussed and an application to RNA design for nanotechnology is presented.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

RNAs นำเฉพาะ เสถียรสถาปัตยกรรมระดับตติยภูมิเพื่อทำกิจกรรมของพวกเขา ความรู้เกี่ยวกับโครงสร้างระดับตติยภูมิของ RNA เป็นพื้นฐานเพื่อทำความเข้าใจฟังก์ชันอาร์เอ็นเอเริ่มต้น ด้วยการถอดรหัส และลงท้าย ด้วยการหมุนเวียน ขัดต่อขั้นสูง RNA โครงสร้างรองทำนายอัลกอริทึม ซึ่งช่วยให้แม่นเมื่อทดลองข้อมูลถูกรวมอยู่ในการคาดการณ์ คาดเดาโครงสร้างระดับตติยภูมิของ RNAs ใหญ่ยังคง ความท้าทายสำคัญ อย่างไรก็ตาม ฟิลด์ของ RNA ทำนายโครงสร้างระดับตติยภูมิมีการพัฒนาอย่างรวดเร็ว และวิธีการคำนวณใหม่ตามกลยุทธ์ที่แตกต่างเกิดขึ้นใหม่RNAComposer เป็นเซิร์ฟเวอร์ที่ใช้งานง่าย และมีอิสระสำหรับทำนายโครงสร้าง 3 มิติของอาร์เอ็นเอสูงสุดตกค้างนิวคลีโอไทด์ 500 RNAComposer มีพนักงานอัตโนมัติส่วนประกอบตามโครงสร้าง RNA รองระบุ โดยผู้ใช้ สำคัญ วิธีนี้ช่วยให้การรวมตัวกันของระยะที่รัดได้มาจากข้อมูลการทดลองเสริมสร้างคาดการณ์ 3D ศักยภาพและข้อจำกัดของ RNAComposer มีการกล่าวถึง และแสดงโปรแกรมประยุกต์การออกแบบ RNA สำหรับนาโนเทคโนโลยี

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

RNAs นำมาใช้เฉพาะสถาปัตยกรรมในระดับอุดมศึกษาที่มีเสถียรภาพในการดำเนินกิจกรรมของพวกเขา ความรู้เกี่ยวกับ RNA โครงสร้างในระดับอุดมศึกษาเป็นพื้นฐานในการเข้าใจการทำงาน RNA เริ่มต้นด้วยการถอดความและลงท้ายด้วยมูลค่าการซื้อขาย ตรงกันข้ามกับอาร์เอ็นเอที่ทันสมัยโครงสร้างทุติยภูมิขั้นตอนวิธีการคาดคะเนซึ่งจะช่วยให้ความถูกต้องดีเมื่อข้อมูลการทดลองจะรวมอยู่ในการคาดคะเนทำนายโครงสร้างในระดับอุดมศึกษาของ RNAs ขนาดใหญ่ยังคงเป็นความท้าทายที่สำคัญ อย่างไรก็ตามข้อมูลของ RNA โครงสร้างการพยากรณ์ในระดับอุดมศึกษาที่มีการพัฒนาอย่างรวดเร็วและวิธีการคำนวณใหม่บนพื้นฐานของกลยุทธ์ที่แตกต่างที่เกิดขึ้นใหม่. RNAComposer เป็นเซิร์ฟเวอร์ที่ใช้งานง่ายและสามารถใช้ได้อย่างอิสระสำหรับโครงสร้าง 3 มิติของการทำนาย RNA ถึง 500 ตกค้างเบื่อหน่าย RNAComposer พนักงานการประกอบชิ้นส่วนโดยอัตโนมัติอย่างเต็มที่ขึ้นอยู่กับโครงสร้างทุติยภูมิอาร์เอ็นเอระบุโดยผู้ใช้ ที่สำคัญวิธีการนี้จะช่วยให้รวมตัวกันของหมอนรองระยะทางที่ได้มาจากข้อมูลการทดลองเพื่อเสริมสร้างการคาดการณ์ 3D ที่มีศักยภาพและข้อ จำกัด ของ RNAComposer จะกล่าวถึงและการประยุกต์ใช้ในการออกแบบอาร์เอ็นเอของนาโนเทคโนโลยีที่จะนำเสนอ