Molecular divergenceNo suitable cal

Molecular divergence

No suitable calibration points were available for the chicken phylogeny, neither from the fossil record nor from ancient DNA data. Consequently, we could not calculate reliable dates of divergence for the haplogroups. We calculated molecular divergences by employing the Rho method to indirectly estimate ages (Table 1). Haplogroups/subhaplogroups B, C1, E1 and F were characterized by very similar, average amounts of sequence divergences based on both the complete mtDNA and synonymous mutations only. The estimated divergences for haplogroups A and D1 were slightly larger than those for haplogroups B, C1, E1 and F, although they overlapped when considering the 95% confidence intervals (Rho±2Sigma). For haplogroup G, discordance was observed between estimates based on entire mtDNA genome and synonymous mutations. Haplogroup C1 existed only in the domestic chicken, a pattern also supported by analyses of the CR data, although it might have occurred in red junglefowl not sampled in the current study. When the estimated age of haplogroup C1 was considered as a calibration point for chicken domestication, differentiation for haplogroups A, B, E1, F and G likely represented expansion after domestication of the chicken.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Divergence โมเลกุลจุดเทียบที่เหมาะสมไม่ได้สำหรับไก่ phylogeny ไม่ จากฟอสซิลระเบียน หรือข้อมูลดีเอ็นเอโบราณ ดังนั้น เราไม่สามารถคำนวณวันที่เชื่อถือได้ที่สามารถ divergence haplogroups เราได้ divergences ระดับโมเลกุล โดยใช้วิธีครออ้อมประเมินอายุ (ตารางที่ 1) Haplogroups/subhaplogroups B, C1, E1 และ F มีลักษณะ โดยเงินคล้าย ค่าเฉลี่ย divergences ลำดับที่สมบูรณ์ mtDNA และกลายพันธุ์พ้องเท่านั้น Divergences ประเมินสำหรับ haplogroups A และง 1 ได้เล็กน้อยมีขนาดใหญ่กว่าสำหรับ haplogroups B, C1, E1 และ F แม้ว่าพวกเขาซ้อนกันเมื่อพิจารณาช่วงความเชื่อมั่น 95% (Rho±2Sigma) สำหรับ haplogroup G, discordance ถูกสังเกตระหว่างประเมิน mtDNA ทั้งจีโนมและกลายพันธุ์พ้อง Haplogroup C1 อยู่เฉพาะในไก่ภายในประเทศ รูปแบบนอกจากนี้ยัง ได้รับการสนับสนุน โดยวิเคราะห์ข้อมูล CR แม้ว่ามันอาจเกิดขึ้นในตัวอย่างในการศึกษาปัจจุบันไม่ junglefowl สีแดง เมื่ออายุประมาณ haplogroup C1 ถูกถือว่าเป็นจุดเทียบสำหรับไก่ domestication สร้างความแตกต่างใน haplogroups A, B, E1, F และ G มีแนวโน้มแสดงขยายหลัง domestication ของไก่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความแตกต่างในระดับโมเลกุลไม่มีคะแนนการสอบเทียบที่เหมาะสมที่มีอยู่สำหรับเชื้อชาติไก่ทั้งจากบันทึกฟอสซิลหรือจากข้อมูลดีเอ็นเอโบราณ ดังนั้นเราจึงไม่สามารถคำนวณวันที่เชื่อถือได้ของความแตกต่างสำหรับ haplogroups เราคำนวณความแตกต่างในระดับโมเลกุลโดยการใช้วิธีการทางอ้อมโรประเมินทุกเพศทุกวัย (ตารางที่ 1) haplogroups / subhaplogroups B, C1, E1 และ F มีลักษณะคล้ายกันมากจำนวนเงินเฉลี่ยของความแตกต่างกันตามลำดับทั้ง mtDNA และการกลายพันธุ์ที่สมบูรณ์เพียง แต่ความหมายเหมือนกัน แตกต่างโดยประมาณสำหรับ haplogroups และ D1 มีขนาดใหญ่กว่าเล็กน้อยเหล่านั้นสำหรับ haplogroups B, C1, E1 และ F แม้ว่าพวกเขาจะซ้อนทับเมื่อพิจารณาช่วงความเชื่อมั่น 95% (โร± 2Sigma) สำหรับแฮ็ปโลกรุ๊ป G, ความบาดหมางกันก็สังเกตเห็นระหว่างประมาณการอยู่บนพื้นฐานของจีโนม mtDNA ทั้งหมดและการกลายพันธุ์ที่ความหมายเหมือนกัน แฮ็ปโลกรุ๊ป C1 มีอยู่เฉพาะในไก่ในประเทศรูปแบบนอกจากนี้ยังได้รับการสนับสนุนโดยการวิเคราะห์ข้อมูล CR แม้ว่ามันอาจจะเกิดขึ้นในไม่ไก่ป่าตัวอย่างในการศึกษาในปัจจุบัน เมื่ออายุประมาณของแฮ็ปโลกรุ๊ป C1 ได้รับการพิจารณาเป็นจุดสอบเทียบสำหรับ domestication ไก่แตกต่างสำหรับ haplogroups A, B, E1, F และ G เป็นตัวแทนการขยายตัวมีแนวโน้มหลังจาก domestication ของไก่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไม่มีจุดสอบเทียบความแตกต่างโมเลกุลเหมาะสมมีอยู่ในระบบเชื้อชาติ ไก่ ทั้งจากการบันทึกซากฟอสซิลโบราณหรือจากข้อมูลดีเอ็นเอ ดังนั้นเราสามารถคำนวณวันที่ที่เชื่อถือได้ของความแตกต่างสำหรับ haplogroups . เราคำนวณโมเลกุล divergences โดยใช้วิธีการประเมินอายุทางอ้อมโร ( ตารางที่ 1 ) haplogroups / subhaplogroups B , C1 ,E1 F มีลักษณะคล้ายคลึงกันมาก เฉลี่ยปริมาณลำดับความแตกต่างขึ้นอยู่กับทั้งสมบูรณ์แสดงและการกลายพันธุ์ตรงกันเท่านั้น ประมาณ divergences สำหรับ haplogroups และ D1 มีขนาดใหญ่กว่า haplogroups B , C1 , E1 F , แม้ว่าพวกเขาจะซ้อนกันเมื่อพิจารณา 95% ช่วงความเชื่อมั่น ( โร± 2sigma ) สำหรับแบบแผนกรัมความไม่ลงรอยกันระหว่างประมาณการพบว่าขึ้นอยู่กับพันธุกรรมแสดงทั้งหมดและการกลายพันธุ์ที่ตรงกัน แบบแผน C1 มีอยู่เฉพาะในไก่ในประเทศ , รูปแบบที่ได้รับการสนับสนุนโดยการวิเคราะห์ข้อมูล CR , ถึงแม้ว่ามันอาจจะเกิดขึ้นในไม่แดง ไก่ป่าเป็นตัวอย่างในการศึกษาปัจจุบัน เมื่อประมาณอายุของแบบแผน C1 ถือเป็นการสอบเทียบจุด domestication ของไก่แตกต่าง haplogroups A , B , E1 , F และ G อาจแสดงการขยายตัวหลังจาก domestication ของไก่