GA3-responsive transcription factor

GA3-responsive transcription factors
A large number of differentially expressed GA3-responsive
transcription factors (TFs) were identified in this
study (Figure 6; Additional file 2: Figure S4; Additional
file 1: Table S9). In total, 157 (7.7% of total DEGs) and
175 (7.23% of total DEGs) DEGs were classed into 30
distinct transcription factor families 1 h and 24 h after
GA3 treatment, respectively. One hour following treatment,
103 genes encoding transcription factors were
found to be up-regulated and 54 were down-regulated.
Similarly, 100 genes encoding transcription factors were
found to be up-regulated and 124 down-regulated 24 h
after GA3 application. The majority of transcription
factor-encoding DEGs were members of the AP2/EREBP
family, followed by MYB, bHLH, WRKY, NAC, and ARF
families. In the case of the AP2/EREBP family, 16 genes
were up-regulated 1 h following GA3 treatment, whereas
32 genes were down-regulated 24 h post-treatment.
Similarly, DEGs belonging to the WRKY, NAC, TIFY,
GRAS, MADS-box and PLATZ families were for the
most part induced 1 h following GA3 treatment and repressed
24 h post-treatment. In the case of both MYB and
bHLH family DEGs, a higher number of up-regulated
genes were observed 1 and 24 h post-treatment than
down-regulated genes. In the case of ARF, GRF, HB, TCP
and zf-HD family DEGs, there generally tended to be
more up-regulation occurring at 24 h post-treatment than
down-regulation.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ถอดความ GA3
ที่ตอบสนองต่อปัจจัยจำนวนมากแสดงความแตกต่างกันGA3
ที่ตอบสนองต่อปัจจัยการถอดความ(TFS)
ที่ถูกระบุในการศึกษา(รูปที่ 6; แฟ้มเพิ่มเติม 2: รูปที่ S4;
เพิ่มเติมไฟล์ที่1: ตาราง S9) รวม 157 (7.7% ของ degs ทั้งหมด) และ
175 (7.23% ของ degs ทั้งหมด) degs ถูกจัดลงในวันที่ 30
ถอดความปัจจัยครอบครัวที่แตกต่างกัน 1 ชั่วโมงและ 24
ชั่วโมงหลังการรักษาGA3 ตามลำดับ หนึ่งชั่วโมงต่อไปนี้การรักษา
103
ยีนถอดความปัจจัยถูกพบว่ามีการขึ้นควบคุมและ54 ถูกควบคุมลง.
ในทำนองเดียวกัน 100
ยีนถอดความปัจจัยถูกพบว่ามีการขึ้นควบคุมและ124 ควบคุมลง 24
ชั่วโมงหลังจากการประยุกต์ใช้GA3 ส่วนใหญ่ของการถอดรหัสการเข้ารหัสปัจจัย degs เป็นสมาชิกของ AP2 / EREBP ครอบครัวตาม MYB, bHLH, WRKY, NAC และสุนัขครอบครัว ในกรณีของครอบครัว AP2 / EREBP 16 ยีนที่เพิ่มขึ้นการควบคุม1 ชั่วโมงหลังการรักษา GA3 ในขณะที่32 ยีนที่ถูกควบคุมลง 24 ชั่วโมงหลังการรักษา. ในทำนองเดียวกัน degs เป็นของ WRKY, NAC, TIFY, GRAS, MADS -box และครอบครัว Platz ได้สำหรับส่วนใหญ่เหนี่ยวนำ1 ชั่วโมงหลังการรักษา GA3 และอัดอั้น24 ชั่วโมงหลังการรักษา ในกรณีของทั้งสอง MYB และbHLH degs ครอบครัวเป็นจำนวนที่สูงขึ้นของขึ้นควบคุมยีนที่ถูกตั้งข้อสังเกตที่1 และ 24 ชั่วโมงหลังการรักษากว่ายีนควบคุมลง ในกรณีที่สุนัข, GRF, HB, TCP และ ZF-HD degs ครอบครัวมีโดยทั่วไปมีแนวโน้มที่จะขึ้นการควบคุมที่เกิดขึ้นใน24 ชั่วโมงหลังการรักษากว่ากฎระเบียบลง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การถอดความปัจจัย GA3
จํานวนแสดงออกแตกต่างกัน GA3 ตอบสนอง
ถอดความปัจจัย ( TFS ) ระบุในการศึกษา
( รูปที่ 6 ; 2 : เพิ่มไฟล์รูป S4
; เพิ่มเติมไฟล์ 1 : ตารางที่ 3 ) ทั้งหมด 157 ( 7.7% ของ degs ทั้งหมด ) และ
175 ( 7.23 % ของ degs ทั้งหมด ) degs เป็น classed เป็น 30
ถอดความปัจจัยครอบครัวที่แตกต่างกัน 1 ชั่วโมงและ 24 ชั่วโมงหลังจาก
GA3 รักษาตามลำดับ หนึ่งชั่วโมงต่อไปนี้การรักษา
103 ยีนเข้ารหัสถูกพบว่าเป็นปัจจัยการถอดความ
คา 54 ลงมาควบคุม
ในทํานองเดียวกัน 100 ยีนเข้ารหัสปัจจัยที่พบว่าสามารถถอดความได้

และ 124 ลงควบคุม 24 ชั่วโมงหลังจาก GA3 ใบสมัคร ส่วนใหญ่ของปัจจัยการถอดความ
การเข้ารหัส degs เป็นสมาชิกของ ap2 / erebp
ครอบครัว รองลงมา คือ myb bhlh wrky แนค , , , ,ARF
และครอบครัว ในกรณีของครอบครัว ap2 / erebp 16
1 H คือยีนกระตุ้นการรักษาต่อไปนี้ GA3 และยีนควบคุมการลง
32 24 h .
ในทํานองเดียวกัน degs เป็นของ wrky แนค tify
, , , รสชาติและแมดส์ กล่องพลาสครอบครัวสำหรับ
1 H ) GA3 ส่วนใหญ่ดังต่อไปนี้ การรักษาและการหักห้ามใจ
24 H . ในกรณีของทั้ง myb
degs bhlh และครอบครัว ,ตัวเลขที่สูงขึ้นของคา
ยีนพบ 1 และหลังการรักษา 24 ชั่วโมงกว่า
ลงควบคุมยีน ในกรณีของเอ็ม grf , HB , TCP
ZF HD และครอบครัว degs , โดยทั่วไปมีแนวโน้มที่จะมากขึ้นของการเกิดขึ้นที่

down-regulation 24 ชั่วโมงกว่า .