The gene expression profile of GSE1

The gene expression profile of GSE16134, comprising 241 gingival tissue specimens and 69 healthy samples as control which were obtained from 120 systemically healthy patients with periodontitis (65 with chronic and 55 with aggressive periodontitis), was downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) in periodontitis samples were screened using the limma package in R compared with control samples. Gene Ontology (GO) and pathway enrichment analysis upon the DEGs were carried out using Hypergeometric Distribution test. Protein-protein interaction

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ส่วนกำหนดค่านิพจน์ยีนของ GSE16134 ประกอบด้วยเนื้อเยื่อ gingival 241 specimens และ 69 ตัวอย่างที่ดีต่อสุขภาพเป็นตัวควบคุมที่ได้รับมาจากผู้ป่วยมีสุขภาพดี systemically 120 ปริทันต์ (65 กับเรื้อรังและ 55 กับปริทันต์ก้าวร้าว), ดาวน์โหลดจากฐานข้อมูลยีนนิพจน์ Omnibus (แก้ว) Differentially แสดงยีน (DEGs) ในตัวอย่างถูกฉายใช้แพคเกจ limma R เทียบกับตัวอย่างควบคุมปริทันต์ ยีนภววิทยา (GO) และทางเดินขอวิเคราะห์ตาม DEGs ได้ดำเนินการใช้แจกจ่ายเมตริกทดสอบ โปรตีนโปรตีนโต้ตอบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รายละเอียดการแสดงออกของยีนของ GSE16134 ประกอบไปด้วย 241 ตัวอย่างเนื้อเยื่อของเหงือกและ 69 ตัวอย่างที่ดีต่อสุขภาพเป็นตัวควบคุมซึ่งได้จาก 120 ผู้ป่วยที่มีสุขภาพดีมีระบบที่มีปริทันต์ (65 เรื้อรังและ 55 กับปริทันต์ก้าวร้าว) ดาวน์โหลดจากการแสดงออกของยีนรถโดยสาร (GEO) ฐานข้อมูล . ยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (degs) ในตัวอย่างปริทันต์ได้รับการคัดเลือกโดยใช้แพคเกจ Limma ใน R เมื่อเทียบกับตัวอย่างควบคุม ยีนอภิปรัชญา (GO) และการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าทางเดินเมื่อ degs ถูกดำเนินการโดยใช้การทดสอบการกระจาย hypergeometric ปฏิสัมพันธ์โปรตีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การแสดงออกของยีนโปรไฟล์ของ gse16134 จำนวน 241 ตัวอย่างเนื้อเยื่อเหงือกและสุขภาพควบคุม 69 ตัวอย่างซึ่งได้จากผู้ป่วยโรคปริทันต์อักเสบ ( 120 มีระบบสุขภาพเรื้อรังและ 55 65 กับโรคปริทันต์ก้าวร้าว ) ก็ดาวน์โหลดได้จากการแสดงออกของยีนแบบ ( กอ ) ฐานข้อมูลแสดงออกแตกต่างกันยีน ( degs ) ในตัวอย่างโรคปริทันต์อักเสบมีใช้ limma ชุด R เปรียบเทียบกับตัวอย่างควบคุม ยีนอภิปรัชญา ( ไป ) และเส้นทางเสริมการวิเคราะห์บน degs ทดลองใช้แบบทดสอบการแจกแจงไฮเปอร์จีออเมตริก . ปฏิสัมพันธ์โปรตีนโปรตีน