Phenotypic andmolecular identificat

Phenotypic andmolecular identification analyseswere performed to
identify the seven candidate strains. After Gram-staining and morphological
characterization the isolates were subjected to phenotypic tests
for conventional identification using the API 20E commercial kit (Api
System; BioMérieux, Marcy l'Etoile, France).
Extraction and amplification of bacterial template DNA for 16S rRNA
sequence analysis were carried out as described previously (Labreuche
et al., 2012; Walling et al., 2010). The DNA sequences were compared
against the sequences available in the databases obtained from the National
Center for Biotechnology Information using the BLAST algorithm
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/) to determine nucleotidenucleotide
similarity with sequences in the nr/nt database. The 16S
rRNA gene sequences determined in this study have been deposited in

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัตรประจำตัวฟีโนไทป์ andmolecular analyseswere ดำเนินการเพื่อ
ระบุเจ็ดสายพันธุ์ผู้สมัคร หลังจากที่แกรมการย้อมสีและลักษณะทางสัณฐานวิทยา
ลักษณะสายพันธุ์ถูกยัดเยียดให้ทดสอบฟีโนไทป์
สำหรับประชาชนทั่วไปโดยใช้ API 20E ชุดในเชิงพาณิชย์ (API
. ระบบ; bioMerieux ร์ซี่ Etoile แมง, ฝรั่งเศส)
การสกัดและการขยายของแม่แบบดีเอ็นเอของแบคทีเรียสำหรับ 16S rRNA
วิเคราะห์ลำดับได้ ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (Labreuche
, et al, 2012;.. Walling et al, 2010) ลำดับดีเอ็นเอถูกนำมาเปรียบเทียบ
กับลำดับที่มีอยู่ในฐานข้อมูลที่ได้รับจากแห่งชาติ
ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพโดยใช้อัลกอริทึมระเบิด
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/) เพื่อตรวจสอบ nucleotidenucleotide
ความคล้ายคลึงกันกับลำดับใน ไม่มีฐานข้อมูล / NT 16S
rRNA ลำดับยีนที่กำหนดไว้ในการศึกษาครั้งนี้ได้รับการฝากไว้ใน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การกระทำที่ใกล้เคียง andmolecular analyseswere
ระบุผู้สมัคร 7 สายพันธุ์ หลังจากย้อมสีกรัมและสัณฐานลักษณะที่แยกได้ถูก

การทดสอบฟีโนไทป์ชนิดธรรมดาใช้ API ( API
20e ชุดเชิงพาณิชย์ระบบ biom é rieux มาร์ซี่ l'etoile , ฝรั่งเศส ) .
การสกัดและเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอแม่แบบแบคทีเรียสำหรับ 16S rRNA
การวิเคราะห์ลำดับ ได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( labreuche
et al . , 2012 ; ผนัง et al . , 2010 ) ดีเอ็นเอลำดับเปรียบเทียบ
กับลำดับมีอยู่ในฐานข้อมูลที่ได้จากศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ใช้ระเบิดแบบ

( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/ ) เพื่อตรวจสอบ nucleotidenucleotide
ความเหมือนกับลำดับใน NR / nt ฐานข้อมูลการพิจารณาในลำดับยีน 16S rRNA
ศึกษานี้ ได้รับเงินใน