Knowing the location of the binding

Knowing the location of the binding site before docking processes significantly increases the
docking efficiency. In many cases, the binding site is indeed known before docking ligands
into it. Also, one can obtain information about the sites by comparison of the target protein
with a family of proteins sharing a similar function or with proteins co-crystallized with
other ligands. In the absence of knowledge about the binding sites, cavity detection
programs or online servers, e.g. GRID[20, 21], POCKET [22], SurfNet [23, 24], PASS [25]
and MMC [26] can be utilized to identify putative active sites within proteins. Docking
without any assumption about the binding site is called blind docking.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รู้สถานที่ตั้งของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันก่อนที่จะเชื่อมต่อกระบวนการมีนัยสำคัญเพิ่ม
ประสิทธิภาพการเชื่อมต่อ ในหลายกรณีเว็บไซต์ผูกพันเป็นที่รู้จักกันอย่างแน่นอนก่อนที่จะเชื่อมต่อแกนด์
เป็นมัน นอกจากนี้หนึ่งสามารถได้รับข้อมูลเกี่ยวกับเว็บไซต์โดยเปรียบเทียบของโปรตีนเป้าหมาย
กับครอบครัวของโปรตีนที่ใช้งานร่วมกันฟังก์ชั่นที่คล้ายกันหรือกับโปรตีนร่วมตกผลึกกับ
แกนด์อื่น ๆ ในกรณีที่ไม่มีความรู้เกี่ยวกับเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันการตรวจสอบโพรง
โปรแกรมหรือเซิร์ฟเวอร์ออนไลน์เช่น GRID [20, 21], POCKET [22], SurfNet [23, 24], PASS [25]
และ MMC [26] สามารถนำมาใช้เพื่อ ระบุเว็บไซต์ที่ใช้งานสมมุติภายในโปรตีน เชื่อมต่อ
โดยไม่ต้องสมมติฐานเกี่ยวกับเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันใด ๆ ที่เรียกว่าเชื่อมต่อตาบอด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รู้ที่ตั้งของเว็บไซต์ผูกพันก่อน docking กระบวนการอย่างมากเพิ่ม
docking ประสิทธิภาพ ในหลายกรณี เว็บไซต์ผูกพันย่อมรู้จักก่อน docking ลิแกนด์
เข้าไป นอกจากนี้หนึ่งสามารถรับข้อมูลเกี่ยวกับเว็บไซต์โดยการเปรียบเทียบเป้าหมายโปรตีน
กับครอบครัวของโปรตีนแบ่งการทำงานคล้ายกันหรือมีโปรตีน Co ตกผลึกกับ
ลิแกนด์อื่น ๆในการขาดของความรู้เกี่ยวกับเว็บไซต์ผูกพันในการตรวจสอบ
โปรแกรมหรือเซิร์ฟเวอร์ออนไลน์ เช่น ตาราง [ 20 , 21 ] กระเป๋า [ 22 ] surfnet [ 23 , 24 ] ผ่าน [ 25 ]
แล้ว MMC [ 26 ] สามารถใช้เพื่อระบุถึงการใช้งานเว็บไซต์ภายในเส้นใยโปรตีน Docking
ไม่มีข้อสมมติเกี่ยวกับเว็บไซต์ผูกพันเรียกว่าตาบอด docking .