2.1. DNA Sequence Data, Alignment a

2.1. DNA Sequence Data, Alignment and Gap Coding
The Early Bird [13] data matrix comprises ~25 kilobases (kb) of sequence data per species (before alignment) from 19 nuclear loci obtained from 169 bird species (supporting information, file 1). The 19 loci are located on 15 different chromosomes in the chicken genome [40], and they are likely to be unlinked in most or all avian lineages given the general conservation of avian karyotypes [41]. There was clear evidence that one locus (GH1) underwent a gene duplication within birds [42]; a single GH1 paralog was included for the taxa (Passeriformes) with two copies. Other details of the data matrix and alignment methods are provided in Hackett et al. [13] and Braun et al. [35].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.1 DNA ลำดับข้อมูล การจัดตำแหน่ง และช่องว่างรหัส เบิร์ด [13] ข้อมูลเมตริกซ์ประกอบด้วย ~ 25 kilobases (kb) ของข้อมูลลำดับต่อสปีชีส์ (ก่อนตำแหน่ง) จากนิวเคลียร์ loci 19 ที่ได้รับจากชนิดนก 169 (สนับสนุนข้อมูล แฟ้ม 1) 19 loci อยู่ chromosomes 15 แตกต่างกันในกลุ่มไก่ [40], และพวกเขาจะไม่ได้เชื่อมโยงในทั้งหมด หรือส่วนใหญ่นกเชื้อชาติให้อนุรักษ์ทั่วไปของนก karyotypes [41] มีหลักฐานชัดเจนที่โลกัสโพลหนึ่ง (GH1) แต่ละยีนซ้ำซ้อนภายในนก [42]; paralog GH1 เดียวถูกรวมสำหรับ taxa (Passeriformes) พร้อมสำเนา มีรายละเอียดอื่น ๆ ของข้อมูลเมตริกซ์และการจัดตำแหน่งวิธี Hackett et al. [13] และ al. et Braun [35]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.1 ดีเอ็นเอลำดับข้อมูลการจัดและช่องว่างการเข้ารหัส
น Early Bird [13] เมทริกซ์ข้อมูลประกอบด้วย ~ 25 kilobases (KB) ของข้อมูลลำดับต่อสายพันธุ์ (ก่อนการจัดตำแหน่ง) ตั้งแต่วันที่ 19 loci นิวเคลียร์ที่ได้รับจาก 169 สายพันธุ์นก (สนับสนุนข้อมูลไฟล์ 1) 19 loci จะอยู่ในวันที่ 15 โครโมโซมที่แตกต่างกันในจีโนมของไก่ [40] และพวกเขามีแนวโน้มที่จะยกเลิกการเชื่อมโยงในส่วนใหญ่หรือ lineages นกทั้งหมดได้รับการอนุรักษ์ทั่วไปของโครโมโซมนก [41] มีหลักฐานที่ชัดเจนว่าหนึ่งในสถานที (GH1) เปลี่ยนการทำสำเนายีนภายในนก [42]; paralog GH1 เดียวถูกรวมสำหรับแท็กซ่า (พาส) ที่มีสองชุด รายละเอียดอื่น ๆ ของเมทริกซ์ข้อมูลและวิธีการจัดตำแหน่งที่มีอยู่ใน Hackett และคณะ [13] และ Braun และคณะ [35]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.1 . ดีเอ็นเอลำดับข้อมูลการจัดตำแหน่งและการเข้ารหัส
Early Bird [ 13 ] ข้อมูลเมทริกซ์ประกอบด้วย ~ 25 กิโลเบสช่องว่าง ( KB ) ของลำดับข้อมูล ( ก่อนจัดต่อสายพันธุ์ ) จาก 19 นิวเคลียร์ได้จาก 169 ชนิดของนก ( สนับสนุนข้อมูลไฟล์ , 1 ) 19 ตำแหน่งอยู่บนโครโมโซมต่าง ๆ 15 ในจีโนมไก่ [ 40 ]และพวกเขามีแนวโน้มที่จะยกเลิกการเชื่อมโยงในส่วนใหญ่หรือทั้งหมดได้รับการอนุรักษ์พันธุ์นกทั่วไปของสัตว์ปีกทาง [ 41 ] มีหลักฐานชัดเจนว่าหนึ่งในสถานที่ ( gh1 ) ได้รับยีนซ้ำซ้อนภายในนก [ 42 ] ; เดียว gh1 paralog ถูกรวมอยู่ในแทกซา ( ฤดูกาลของสโมสรฟุตบอลนิวคาสเซิลยูไนเต็ด ) สองเล่ม รายละเอียดอื่นๆของ Data Matrix และวิธีการจัดไว้ แฮกเก็ตต์ et al .[ 13 ] และ Braun et al . [ 3 ]