Sequence analysis of OsMAX1 genes i

Sequence analysis of OsMAX1 genes in rice
Using the tool of homologous sequence alignment in
NCBI, we predicted the AtMAX1 homologous genes in
rice genome database (http://rice.plantbiology.msu.edu/
index.shtml) and identified five OsMAX1 candidate
genes with high homology to AtMAX1, OsMAX1a
(LOC_Os01g50530 and LOC_Os01g50520, and cDNA
sequencing showed that these two annotated loci are
in the same ORF), OsMAX1b (LOC_Os06g36920),
OsMAX1c (LOC_Os01g50590), OsMAX1d (LOC_
Os01g50580) and OsMAX1e (LOC_Os02g12890)
(Table 1). These candidate genes shared 50%–63%
sequence homology with AtMAX1.
These five candidate genes were searched in Gramene
(http://www.gramene.org/Multi/blastview) to determine
their chromosomal distributions. Using genome sequence
and cDNA sequence, we analyzed the structural
characteristics of their introns and exons (Fig. 1). The
results showed that these OsMAX1 candidate genes

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์ของ OsMAX1 ยีนในข้าวใช้เครื่องมือจัดลำดับเซทจะมีโครโมโซมในNCBI เราคาดการณ์ AtMAX1 เซทจะมีโครโมโซมยีนในฐานข้อมูลพันธุข้าว (http://rice.plantbiology.msu.edu/index.shtml) และผู้สมัคร OsMAX1 ห้ายีน มี homology สูงถึง AtMAX1, OsMAX1a(LOC_Os01g50530 และ LOC_Os01g50520 และ cDNAแสดงลำดับ loci ใส่คำอธิบายประกอบเหล่านี้สองในเดียวกัน ORF), OsMAX1b (LOC_Os06g36920),OsMAX1c (LOC_Os01g50590), OsMAX1d (LOC_Os01g50580) และ OsMAX1e (LOC_Os02g12890)(ตารางที่ 1) ยีนเหล่านี้ผู้สมัครร่วม 50-63%ลำดับ homology กับ AtMAX1ยีนเหล่านี้ผู้สมัครห้าค้นใน Gramene(http://www.gramene.org/Multi/blastview) to determineการกระจายโอกาสของพวกเขา ใช้ลำดับพันธุและ ลำดับ cDNA เราวิเคราะห์โครงสร้างการลักษณะของ introns และ exons (1 รูป) การผลลัพธ์แสดงให้เห็นว่ายีนเหล่านี้เป็น OsMAX1

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ลำดับของยีน OsMAX1 ในนาข้าว
โดยใช้เครื่องมือของลำดับการจัดเรียงคล้ายคลึงกันใน
NCBI เราคาดการณ์ AtMAX1 ยีนคล้ายคลึงกันใน
ฐานข้อมูลจีโนมข้าว (http://rice.plantbiology.msu.edu/
index.shtml) และระบุห้า OsMAX1 ผู้สมัคร
ยีน กับที่คล้ายคลึงกันสูงเพื่อ AtMAX1, OsMAX1a
(LOC_Os01g50530 และ LOC_Os01g50520 และยีน
ลำดับแสดงให้เห็นว่าทั้งสองตำแหน่งข้อเขียนที่มี
ใน ORF เดียวกัน) OsMAX1b (LOC_Os06g36920)
OsMAX1c (LOC_Os01g50590) OsMAX1d (LOC_
Os01g50580) และ OsMAX1e (LOC_Os02g12890)
(ตารางที่ 1) เหล่ายีนที่ใช้ร่วมกัน 50% -63%
ลำดับที่คล้ายคลึงกันกับ AtMAX1.
ทั้งห้ายีนถูกค้นใน Gramene
(http://www.gramene.org/Multi/blastview) เพื่อตรวจสอบ
การกระจายของโครโมโซมของพวกเขา โดยใช้ลำดับจีโนม
และลำดับยีนเราวิเคราะห์โครงสร้าง
ลักษณะของ introns และ exons ของพวกเขา (รูปที่ 1).
ผลการศึกษาพบว่าสิ่งเหล่านี้ยีน OsMAX1 ผู้สมัคร

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ลำดับของยีนในข้าว osmax1การใช้เครื่องมือของโฮโมโลกัสแนวลำดับncbi เราคาดการณ์ atmax1 โฮโมโลกัสยีนในฐานข้อมูลจีโนมข้าว ( http://rice.plantbiology.msu.edu/ดัชนี shtml ) และระบุห้า osmax1 ผู้สมัครยีนที่มีลำดับสูง atmax1 osmax1a ,( loc_os01g50530 และ loc_os01g50520 และยีนลำดับ พบว่า ทั้งสองแสดงสถานะเป็นใน ORF เดียวกัน ) osmax1b ( loc_os06g36920 )osmax1c ( loc_os01g50590 osmax1d ( loc_ )os01g50580 ) และ osmax1e ( loc_os02g12890 )( ตารางที่ 1 ) ยีนผู้สมัครเหล่านี้ร่วมกัน 50% – 63 %ลำดับลำดับกับ atmax1 .เหล่านี้ห้าผู้สมัครยีนถูกตรวจค้นใน gramene( http://www.gramene.org/multi/blastview ) เพื่อหาการกระจายของโครโมโซม . การใช้ลำดับจีโนมและลำดับยีน เราวิเคราะห์โครงสร้างคุณลักษณะของพวกเขาและ introns ที่มี ( รูปที่ 1 ) ที่ผลการศึกษาพบว่า ยีนเหล่านี้ osmax1 ผู้สมัคร