2.3. Primer design and PCR specificity and sensitivity analysis
In the present study, the primers used for PCR and real-time
PCR were designed using primer express software v2.0 (Applied
Biosystems, USA) and Primer Design Assistant (National Health
Research Institute, Taiwan) based on the gene sequences for TnI
(pork: NM_213912, chicken: NM_205417, and goat: AY033589),
MRP (beef: NM_001045926) and tropomodulin (ostrich:
AB254879) (Chen, Lin, Cho, Lo, & Hsiung, 2003) retrieved from
the National Center for Biotechnology Information (NCBI)
GenBank. The primer and amplicon sequences are shown in
Supplemental Tables 2 and 3.
For the primer sensitivity test, a series of primer concentrations
(1, 0.5, 0.25, 0.1 and 0.05 lM) were examined in PCR reactions containing
100 ng cDNA template. For the cDNA template sensitivity
test, ten-fold serial dilutions (100, 10, 1, 0.1, and 0.01 ng) were prepared
for the cDNA template generated from each species. To
assess meat adulteration, 20, 2, 0.2 and 0.02 ng of cDNA were used
as templates per PCR reaction.
2.3 การรองพื้นการออกแบบและวิเคราะห์ specificity และความไวของ PCRในการศึกษาปัจจุบัน สังกะสี วัสดุที่ใช้ สำหรับ PCR แบบเรียลไทม์PCR ถูกออกแบบใช้พื้นด่วนซอฟต์แวร์ v2.0 (ประยุกต์Biosystems สหรัฐอเมริกา) และผู้ช่วยออกแบบพื้น (สุขภาพแห่งชาติสถาบันวิจัย ไต้หวัน) ตามลำดับยีนใน TnI(หมู: NM_213912 ไก่: NM_205417 และแพะ: AY033589),MRP (เนื้อ: NM_001045926) และ tropomodulin (นกกระจอกเทศ:AB254879) (เฉิน หลิน ช่อ หล่อ และ Hsiung, 2003) การเรียกข้อมูลจากแห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (NCBI)GenBank แสดงลำดับรองพื้นและ ampliconเพิ่มเติมตาราง 2 และ 3การทดสอบพื้นความไว ชุดของความเข้มข้นของสีรองพื้น(lM 1, 0.5, 0.25, 0.1 และ 0.05) ถูกตรวจสอบในปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยแม่ cDNA ng 100 สำหรับความไวแม่ cDNAทดสอบ dilutions ประจำ ten-fold (100, 10, 1, 0.1 และ 0.01 ng) เตรียมไว้สำหรับต้นแบบ cDNA สร้างขึ้นจากแต่ละพันธุ์ ถึงประเมิน adulteration เนื้อ 20, 2, 0.2 และ 0.02 ng ของ cDNA ที่เคยเป็นแม่แบบต่อปฏิกิริยา PCR
การแปล กรุณารอสักครู่..

2.3 การออกแบบไพรเมอร์และความจำเพาะ PCR
และการวิเคราะห์ความไวในการศึกษาปัจจุบันไพรเมอร์ที่ใช้สำหรับPCR และ real-time
PCR ได้รับการออกแบบโดยใช้ไพรเมอร์ v2.0 ซอฟต์แวร์ด่วน (Applied
Biosystems สหรัฐอเมริกา) และไพรเมอร์ช่วยออกแบบ
(สุขภาพแห่งชาติสถาบันวิจัยไต้หวัน) ขึ้นอยู่กับลำดับยีนสำหรับ TNI
(หมู: NM_213912 ไก่: NM_205417 และแพะ: AY033589)
MRP (เนื้อ: NM_001045926) และ tropomodulin (นกกระจอกเทศ:
AB254879) (เฉินหลินโชโลและ Hsiung, 2003) ดึง
จากศูนย์แห่งชาติสำหรับข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ(NCBI)
GenBank ไพรเมอร์และลำดับ amplicon ที่แสดงอยู่ในตารางเสริมที่ 2 และ 3 สำหรับการทดสอบความไวของไพรเมอร์ชุดของความเข้มข้นของไพรเมอร์(1, 0.5, 0.25, 0.1 และ 0.05 LM) ได้รับการตรวจสอบในปฏิกิริยา PCR ที่มี100 นาโนกรัมแม่แบบของยีน สำหรับยีนแม่แบบไวทดสอบสิบเท่าเจือจางอนุกรม (100, 10, 1, 0.1 และ 0.01 นาโนกรัม) ได้จัดทำสำหรับแม่แบบยีนที่เกิดจากแต่ละสายพันธุ์ เพื่อประเมินการปลอมปนเนื้อสัตว์ 20, 2, 0.2 และ 0.02 นาโนกรัมของยีนถูกนำมาใช้เป็นแม่แบบต่อปฏิกิริยาPCR
การแปล กรุณารอสักครู่..

2.3 แนวทางการออกแบบและการวิเคราะห์ความไวและความจำเพาะเชื้อ
ในการศึกษาด้วยเทคนิค PCR แบบเรียลไทม์ และใช้ซอฟต์แวร์ Express ถูกออกแบบมาโดยใช้ไพรเมอร์
V2.0 ( ประยุกต์
Biosystems , USA ) และไพรเมอร์ที่ออกแบบผู้ช่วย ( สุขภาพแห่งชาติ
สถาบันวิจัยไต้หวัน ) ตามลำดับสำหรับยีน TNI
( หมู : nm_213912 , ไก่ : nm_205417 และแพะ : ay033589
MRP ( เนื้อ : )nm_001045926 ) และ tropomodulin ( นกกระจอกเทศ :
ab254879 ) ( เฉินหลิน โช ดูเถิด & hsiung , 2003 ) ที่ดึงมาจาก
ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ( ncbi )
ขนาด . ไพรเมอร์ และ จะแสดงในลำดับและเสริมตารางที่ 2 และ 3
.
สำหรับการทดสอบความไวของชุดไพรเมอร์ , รองพื้น )
( 1 , 0 , 0.25 , 0.1 และ 0.05 LM ) โดยทำการศึกษาในปฏิกิริยา PCR ที่มี
100 ของดีเอ็นเอแม่แบบ สำหรับดีเอ็นเอแม่แบบไว
ทดสอบสิบเท่าซีเรียลเจือจาง ( 100 , 10 , 1 , 0.1 และ 0.01 กรัม ) เตรียม
สำหรับแม่แบบที่สร้างขึ้นจากสายพันธุ์แต่ละชนิด
การประเมินเนื้อ , 20 , 2 , 0.2 และ 0.02 ng ของดีเอ็นเอถูกใช้เป็นแม่แบบ
ต่อปฏิกิริยา PCR
การแปล กรุณารอสักครู่..
