Patch analysis distributions: rank

Patch analysis distributions: rank ordering of observed interface patches relative to
High ASA other patches on the surface of the protein. For each protein, the interface patch is ranked, relative to all other surface patches, as being in the top 10%, 10-20% etc. (see Fig. 7). The observations (one for each homodimer) are combined for each parameter separately. The distributionsshown are rms deviation of atoms from the least-squares plane through the atoms (0-
10% are the most planar interfaces) (a), interface residue propensities (b), protrusion index (c),hydrophobicity [based on the scale of Janin et al.(9)] (d), and ASA (e). A mean ASA for residues 90' 100 in each patch was calculated and used in the rank ordering.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โปรแกรมแก้ไขการกระจายการวิเคราะห์: ลำดับยศของสังเกตปรับปรุงอินเตอร์เฟซสัมพันธ์ASA สูงซอฟต์แวร์อื่น ๆ บนพื้นผิวของโปรตีน สำหรับแต่ละโปรตีน อินเตอร์เฟซโปรแกรมเป็นอันดับ สัมพันธ์กับซอฟต์แวร์อื่น ๆ ทุกพื้นผิว ความสูงสุด 10%, 10-20% เป็นต้น (ดูรูป 7) ข้อสังเกต (หนึ่งสำหรับแต่ละ homodimer) จะรวมแยกต่างหากสำหรับแต่ละพารามิเตอร์ Distributionsshown จะเบี่ยงเบน rms ของอะตอมจากระนาบสี่เหลี่ยมอย่างน้อยผ่านอะตอม (0-10% คือ อินเทอร์เฟซสุดระนาบ) (a) อินเตอร์เฟซ propensities สารตกค้าง (b) ดัชนีเกิน (c) hydrophobicity [ตามสเกลของ Janin et al.(9)] (d) และ ASA (e) คำนวณ และใช้ในการสั่งซื้ออันดับหมาย ASA สำหรับตก 90' 100 ในแต่ละโปรแกรมปรับปรุง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การกระจายการวิเคราะห์แพทช์: การจัดอันดับการสั่งซื้อของแพทช์อินเตอร์เฟซที่สังเกตเทียบกับ
สูง ASA แพทช์อื่น ๆ บนพื้นผิวของโปรตีน สำหรับแต่ละโปรตีนแพทช์อินเตอร์เฟซที่มีการจัดอันดับเมื่อเทียบกับทุกผิวแบบอื่น ๆ เช่นการอยู่ใน Top 10%, 10-20% ฯลฯ (ดูรูปที่. 7) สังเกต (สำหรับแต่ละ homodimer) จะทำงานร่วมกันเพื่อแยกแต่ละพารามิเตอร์ distributionsshown มี RMS เบี่ยงเบนของอะตอมจากเครื่องบินอย่างน้อยสี่เหลี่ยมผ่านอะตอม (0-
10% เป็นอินเตอร์เฟซระนาบมากที่สุด) (ก) อินเตอร์เฟซที่ทำความตกค้าง (ข) ดัชนีติ่ง (c), ไฮโดร [ขึ้นอยู่กับขนาด ของ Janin et al. (9)] (D) และเอเอสเอ (E) ค่าเฉลี่ย ASA สำหรับตกค้าง 90 '100 ในแต่ละแพทช์ที่คำนวณได้และนำมาใช้ในการจัดอันดับการสั่งซื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การจัดอันดับการวิเคราะห์แพทช์ : การสั่งซื้อและติดต่อสัมพันธ์กับแพทช์อาสาสูงแพทช์อื่น ๆบนพื้นผิวของโปรตีน สำหรับโปรตีนแต่ละอินเตอร์เฟซ Patch เป็นอันดับ , เมื่อเทียบกับทุกพื้นผิวอื่น ๆซอฟต์แวร์เป็นในด้านบน 10 % ประมาณ 10-20 % เป็นต้น ( ดูรูปที่ 7 ) การสังเกต ( หนึ่งสำหรับแต่ละโฮโมไดเมอร์ ) จะรวมกัน แยกแต่ละพารามิเตอร์ การ distributionsshown เป็นค่าเบี่ยงเบนของอะตอมจากวิธีผ่านอะตอม ( 0 - เครื่องบิน10 % เป็นที่สุด interfaces ระนาบ ) ( ) , อินเตอร์เฟซที่ตกค้าง propensities ( B ) , ดัชนีการงอก ( C ) , ไม่ชอบ [ ขึ้นอยู่กับขนาดของเจอนิน et al . ( 9 ) ] ( d ) และอาสา ( E ) หมายถึง ASA สำหรับตกค้าง 90 100 ในแต่ละแพทช์ที่คำนวณได้และใช้ในตำแหน่งการสั่งซื้อ