which suggested that compound uptake, nitrogen assimilation, alternative nitrogensource
utilization, vacuolar protein degradation and autophagy, and
inhibition of nitrogenous macromolecule biosynthesis.
Th e regulation of central metabolism and lipid metabolism at
the transcriptional level was also investigated ( Fig. 1 ; Supplementary
Table S8 ). FAS in the MM-N sample was upregulated by 4.7-
and 1.8-fold for FAS1 and FAS2 , respectively, but there were no signifi
cant diff erences in the expression of genes that were involved
in the late stage of TAG biosynthesis. Isoprenoids are a variety of
compounds (for example, steroids, carotenoids and terpenes) that
are derived from the common precursor dimethylallyl diphosphate
and its isomer 3-isopentenyl diphosphate. Four genes that
are involved in isoprenoid backbone synthesis were upregulated in
the MM-N sample ( Fig. 1 ). Indeed, the pink colour development of
the culture was an indication of carotenoid biosynthesis. As lipids
are highly reduced compounds, the supplement of a reducing power,
mainly NADPH, is equally important to that of the precursor acetylCoA
6 . Activities of glucose-6-phosphate dehydrogenase ( ZWF1 ),
6 - phosphogluconate dehydrogenase ( GND1 ), NADP + -dependent
isocitrate dehydrogenase ( IDP1 ) and ME ( ME1 ) can generate
NADPH. Although ZWF1 and IDP1 were upregulated by 1.9- and 4.8-
fold, respectively, the expression of GND1 and ME1 were downregulated
by 6.8- and 4.5-fold, respectively. Th e reduced transcriptional
level of ME1 was consistent with early observations that indicated the
expression of ME was suppressed during nitrogen exhaustion 32,33 .
Interestingly, the expression of some genes that were involved in lipid
degradation (that is, lipolysis, the β -oxidation cycle, and glyoxylate
shunt) were also upregulated ( Fig. 1 ), which might be caused by free
fatty acids being released by an elevated autophagy process 34 .
We also compared the highly expressed genes of cells that were
cultured in yeast-extract peptone dextrose (YPD), MM or MM-N
media ( Fig. 4 ; Supplementary Table S10 ). It was found that the numbers
of highly expressed genes were similar, and approximately half of
those genes were shared by the three samples ( Fig. 4b , group G). Th e
shared genes included those coding ribosomal proteins, actin, ACP
( RHTO_01048 ), TAL1 of the phosphopentose pathway, MDH1 and
IDH2 of the tricarboxylic acid (TCA) cycle and GAPDH , ENO1 and
FBA1 of glycolysis. Forty-two genes were highly expressed exclusively
in the MM-N sample (group C) and included those encoding FAS1 & 2 ,
PYC1 , GDH1 and acyl-CoA-binding protein ( RHTO_03853 ). Genes
coding ACL1 and pyruvate dehydrogenase components ( LAT1
and LPD1 ) were highly expressed in the MM and MM-N samples
(group E), where lipid contents were greater than 20 % .
ซึ่งแนะนำว่า สารดูดซึม ไนโตรเจนผสม nitrogensource อื่นการใช้ประโยชน์ ย่อยสลายโปรตีน vacuolar และ autophagy และการยับยั้งการสังเคราะห์แหล่งสมควร ระเบียบ e Th เซ็นทรัลเผาผลาญอาหารและเผาผลาญไขมันที่ระดับ transcriptional ก็ตรวจสอบ (รูปที่ 1 ส่งเสริมการขายS8 ตาราง) FAS ในตัวอย่าง MM N ถูก upregulated โดย 4.7-และ 1.8-fold สำหรับ FAS1 และ FAS2 ตามลำดับ แต่มีมีความไม่ลาดเท diff erences ในการแสดงออกของยีนที่มีส่วนเกี่ยวข้องในระยะปลายของการสังเคราะห์แท็ก Isoprenoids มีความหลากหลายของสารประกอบ (เช่น เตียรอยด์ carotenoids และ terpenes) ที่มาจาก dimethylallyl diphosphate ทั่วไปของสารตั้งต้นและของ diphosphate 3 isopentenyl ไอโซเมอร์ 4 ยีนที่มีส่วนร่วมในการสังเคราะห์กระดูกสันหลัง isoprenoid upregulated ในตัวอย่าง MM N (รูปที่ 1) การพัฒนาสีชมพูของจริงวัฒนธรรมเป็นตัวชี้วัดการสังเคราะห์แค เป็นไขมันมีสารลดสูง อาหารเสริมของพลังงานลดลงNADPH ส่วนใหญ่ มีความสำคัญเท่าเทียมกันกับ acetylCoA สารตั้งต้น6 กิจกรรมของกลูโคส-6-ฟอสเฟต dehydrogenase (ZWF1),6 - phosphogluconate dehydrogenase (GND1), NADP + - ขึ้นอยู่กับisocitrate dehydrogenase (IDP1) และ ME (ME1) สามารถสร้างNADPH แม้ว่าจะ ZWF1 และ IDP1 upregulated 1.9 - และ 4.8-พับ ตามลำดับ การแสดงออกของ GND1 และ downregulated ถูก ME1โดย 6.8 - และ 4.5-fold ตามลำดับ Th e ลด transcriptionalระดับของ ME1 ถูกสอดคล้องกับข้อสังเกตช่วงที่ระบุนี้นิพจน์ของฉันถูกระงับไว้ระหว่างไนโตรเจนอ่อน 32,33น่าสนใจ การแสดงออกของยีนบางอย่างที่มีส่วนเกี่ยวข้องในไขมันย่อยสลาย (คือ เซลลูไลท์ การβ-ออกซิเดชันรอบ และ glyoxylateshunt) ได้ upregulated (1 รูป), ซึ่งอาจเกิดจากฟรีกรดไขมันออกมาตามกระบวนการ autophagy สูง 34 นอกจากนี้เรายังเปรียบเทียบยีนของเซลล์ที่แสดงสูงอ่างในสารสกัดจากยีสต์เป็น peptone (YPD), มม.หรือ MM Nสื่อ (4 รูป S10 ตารางเสริม) พบว่าตัวเลขของยีนที่แสดงออกสูงก็ และประมาณครึ่งหนึ่งยีนที่ถูกใช้ร่วมกัน โดยตัวอย่างที่สาม (รูป 4b กลุ่ม G) นคยีนที่ใช้ร่วมกันรวมผู้เขียนโค้ด ribosomal โปรตีน แอกติน ACP(RHTO_01048), TAL1 ของทางเดิน phosphopentose, MDH1 และIDH2 วงจร tricarboxylic กรด (TCA) และ GAPDH, ENO1 และFBA1 ของ glycolysis สี่สิบสองยีนได้สูงแสดงเฉพาะใน MM-N ตัวอย่าง (กลุ่ม C) และรวมผู้เข้ารหัส FAS1 และ 2PYC1, GDH1 และโปรตีน acyl CoA ผูก (RHTO_03853) ยีนรหัส ACL1 และ pyruvate dehydrogenase ประกอบ (LAT1และ LPD1) ได้แสดงตัวอย่างและ MM N MM สูง(กลุ่ม E), ที่อยู่ที่มากกว่า 20% ของเนื้อหาไขมัน
การแปล กรุณารอสักครู่..
ซึ่งชี้ให้เห็นว่าสารประกอบธาตุอาหารไนโตรเจนสูง nitrogensource ทางเลือก ,การใช้โปรตีนและการย่อยสลาย vacuolar อ ต้ฟาจี และการยับยั้งของไนโตรเจนในโมเลกุล .th e ระเบียบการเผาผลาญการเผาผลาญไขมันที่เซ็นทรัลระดับ particle มีลักษณะ ( รูปที่ 1 ; เพิ่มเติมตาราง s8 ) ใน mm-n ) จำนวน upregulated 4.7 - โดย1.8-fold สำหรับและและ fas1 fas2 ตามลำดับ แต่ไม่มี signifiไม่ต่าง erences ในการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องในช่วงปลายของแท็กใน . มีความหลากหลายของไอโซพรีน ด์สารประกอบ ( ตัวอย่างเช่น สเตียรอยด์ และคาโรทีนอยด์ เทอร์ปีนส์ ) ที่ได้มาจากที่พบสารตั้งต้น dimethylallyl ไดฟอสเฟตและของไอโซเมอร์ 3-isopentenyl พุ่งหลาว . สี่ยีนที่ที่เกี่ยวข้องในการสังเคราะห์ upregulated ในกระดูกสันหลังซปรีนอยด์คือการ mm-n ตัวอย่าง ( รูปที่ 1 ) แท้ สีชมพู พัฒนาวัฒนธรรมเป็นข้อบ่งชี้ของแคโรทีนอยด์ใน . เป็นไขมันเป็นสารประกอบสูงลดลง เสริมของการลดพลังงานส่วนใหญ่ nadph เป็นสำคัญเท่าเทียมกันที่สารตั้งต้นเซทิลโคเอ6 . กิจกรรมของ glucose-6-phosphate dehydrogenase ( zwf1 )6 - phosphogluconate dehydrogenase ( gnd1 ) nadp + - ขึ้นอยู่กับไอโซซิเตรต dehydrogenase ( idp1 ) และฉัน ( me1 ) สามารถสร้างnadph . และแม้ว่า zwf1 idp1 เป็น upregulated 1.9 - 4.8 - โดยเท่า ตามลำดับ และมีการแสดงออกของ gnd1 me1 downregulatedโดย 6.8 - 4.5-fold ตามลำดับ th e ลองลดลงระดับของ me1 สอดคล้องกับข้อสังเกตแรกที่ระบุว่าการแสดงออกของฉันถูกปราบปรามในไนโตรเจนจาก 32,33 .น่าสนใจ การแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องในไขมันการย่อยสลาย ( คือ lipolysis , บีตา - ออกซิเดชันรอบและทฤษฎีบทเวียนบังเกิดยัง upregulated shunt ) ( รูปที่ 1 ) ซึ่งอาจจะเกิดจากฟรีเป็นกรดไขมันที่ได้รับการปล่อยตัว โดยการยกระดับกระบวนการอ ต้ฟาจี 34 .เราเปรียบเทียบสูงแสดงออกยีนของเซลล์ที่ในการเพาะเลี้ยงยีสต์สกัด ( extract dextrose ypd มิลลิเมตร หรือ mm-n )สื่อ ( ภาพที่ 4 ; ตาราง S10 เสริม ) พบว่า ตัวเลขสูงแสดงออกยีนที่คล้ายคลึงกัน และประมาณครึ่งหนึ่งของยีนที่ถูกใช้ร่วมกันโดยทั้งสามตัวอย่าง ( รูปที่ 4B , กลุ่ม G ) th eแบ่งปันการเข้ารหัสยีนอยู่ที่โปรตีน Protein actin ACP ,( rhto_01048 ) tal1 ของ phosphopentose ทางเดิน , mdh1 และidh2 ของกรด tricarboxylic ( TCA ) และวงจร gapdh eno1 , และfba1 ของไกลโคไลซิส สี่สิบสองยีนสูง แสดงเฉพาะใน mm-n ตัวอย่าง ( กลุ่ม C ) และรวมเหล่านั้น fas1 & 2 การเข้ารหัสpyc1 gdh1 , COA , และโปรตีน ( rhto_03853 ) ยีนacl1 และส่วนประกอบการเข้ารหัส ( lat1 เนสไพรูเวทlpd1 ) และมีการแสดงออกในมิลลิเมตร และ mm-n ตัวอย่าง( กลุ่มอี ) ซึ่งไขมันเนื้อหามากกว่า 20 %
การแปล กรุณารอสักครู่..