3.2 PCR amplification, DGGE and phy

3.2 PCR amplification, DGGE and phylogenetic profile of actinomycetes based on nifH genes
The PCR products of nifH gene from soil and rice plants roots with the size of fragment DNA ∼360 bp (Fig. 4) were separated using polyacrylamide gel containing 40–65% denaturant. Based on DGGE result, it showed that community structure of nitrogen fixing bacteria in soil samples were more varied than that of the root samples (Fig. 5A). Cluster analysis of community showed that the community of nitrogen fixing bacteria in soil samples were different with roots sample (Fig. 5B). Sequence analysis result showed that bands 1, 2, 3 had 99% similarity with uncultured bacterium clone J50 based on maximum identity from GenBank database. Band 4 was closely related with uncultured bacterium clone clod-38 with 98% of maximum identity, and band 5 was closely related with uncultured bacterium clone BG2.37 with 92% of maximum identity

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.2 ขยาย PCR, DGGE และรายละเอียดของสายวิวัฒนาการของ actinomycetes ขึ้นอยู่กับยีน nifH
ผลิตภัณฑ์ PCR ของยีน nifH จากดินและข้าวรากพืชที่มีขนาดของดีเอ็นเอส่วน ~360 bp (รูปที่. 4) ถูกแยกออกโดยใช้เจลอะคริเลตที่มี 40-65% denaturant ขึ้นอยู่กับผล DGGE มันแสดงให้เห็นว่าโครงสร้างของชุมชนไนโตรเจนแก้ไขแบคทีเรียในตัวอย่างดินที่แตกต่างกันได้มากขึ้นกว่าที่ของตัวอย่างราก (รูป. 5A) การวิเคราะห์กลุ่มของชุมชนพบว่าชุมชนที่ตรึงไนโตรเจนแบคทีเรียในตัวอย่างดินที่แตกต่างกันด้วยตัวอย่างราก (รูป. 5B) ผลการวิเคราะห์ลำดับแสดงให้เห็นว่าวงดนตรีที่ 1, 2, 3 ได้ 99% คล้ายคลึงกันกับแบคทีเรียโคลนไม่มีมารยาท J50 ขึ้นอยู่กับตัวตนสูงสุดจากฐานข้อมูล GenBank วงที่ 4 มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับแบคทีเรียโคลนไม่มีมารยาทปั้น-38 กับ 98% ของตัวสูงสุดและความถี่ 5 มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับแบคทีเรียโคลนไม่มีมารยาท BG2.37 กับ 92% ของตัวสูงสุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.2 เพื่อขยายการทดลองและรายละเอียดต่างๆด้วยกัน ตาม nifh ยีน
ผลิตภัณฑ์ PCR ของยีน nifh จากดินและรากพืช ข้าว กับ ขนาดของชิ้นส่วนดีเอ็นเอ∼ 360 รึเปล่า BP ( รูปรึเปล่า 4 ) แยกจากกันโดยใช้ polyacrylamide gel ที่มี 40 – 65% ทำให้ผิดธรรมชาติ . ผลการทดลองตาม ,พบว่า โครงสร้างชุมชนแบคทีเรียตรึงไนโตรเจนในดินมากกว่าหลากหลายกว่าของราก ( รูปตัวอย่างไหม 5A ) การวิเคราะห์การเกาะกลุ่มของชุมชน พบว่า ชุมชนแบคทีเรียตรึงไนโตรเจนในดินที่แตกต่างกันกับราก ( รูปตัวอย่างไหม 5B ) ผลที่ได้จากการวิเคราะห์ลำดับ พบว่า กลุ่มที่ 1 , 2 ,3 มีความเหมือนกับ 99% ไม่มีวัฒนธรรมในโคลน j50 ขึ้นอยู่กับตัวตนสูงสุดจากฐานข้อมูลขนาด . วงดนตรี 4 มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับไร้การศึกษา ซึ่งโคลน clod-38 กับ 98% ของตัวตนสูงสุดและวง 5 มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับไร้การศึกษา ซึ่งโคลน bg2.37 กับ 92% ของตนสูงสุด