The melting temperature of probe-ta

The melting temperature of probe-target nucleic acid hybrids plays an important role in sensor performance. This study employed surface plasmon resonance (SPR) techniques to investigate the hybridization of both DNA and RNA targets to their complementary surface-bound DNA oligonucleotide and the corresponding melting temperatures. The target molecule was a 26 nucleotide strand of RNA selected because of its utility in detecting the tobacco mosaic virus, a common plant pathogen with an RNA genome. The melting temperatures of duplexes with immobilized probes were determined by hybridization of the DNA and RNA targets with the bound DNA probe at different temperatures using a custom-built thermostated dual-channel SPR cell. Hybridization conditions and binding efficiencies were compared for both DNA and RNA binding to the gold-coated surface-bound DNA probe. The melting temperature for the DNA–DNA duplex was approximately 15 °C higher than the DNA–RNA in the solid state. The melting temperature in solution was also measured for comparison to the surface values. For both RNA and DNA, the melting transitions were substantially lower (∼20 °C) for solid state binding relative to solution. Particularly for surface immobilized DNA–RNA hybrids, the melting temperature was reduced to room temperature or below. Since most biosensor platforms operate at room temperature, they may consequently exhibit poor sensor performance due to weakened probe-target interactions. This result emphasizes that for optimal sensor performance, the hybrid melting temperature should be considered. The ability to study and optimize the binding of complementary strands of genomic materials to bound DNA probes could facilitate the rapid detection and identification of plant viruses having genomic RNA using various biosensor rapid analytical techniques.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อุณหภูมิการละลายของโพรบเป้าหมายลูกผสมกรดนิวคลีอิกมีบทบาทสำคัญในประสิทธิภาพการทำงานของเซ็นเซอร์ การศึกษานี้จ้าง plasmon ผิวการสั่นพ้อง (คอฟฟี่ช็อป/) เทคนิคการ hybridization ของดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอเป้าหมายการเสริมขอบผิว DNA oligonucleotide และอุณหภูมิละลายเกี่ยวข้องตรวจสอบ เดอะ 26 นิวคลีโอไทด์ของอาร์เอ็นเอที่เลือกเนื่องจากของโปรแกรมอรรถประโยชน์ในการตรวจจับไวรัสยาสูบ mosaic การศึกษาพืชทั่วไปกับกลุ่มอาร์เอ็นเอเป็นโมเลกุลเป้าหมายได้ อุณหภูมิการละลายของ duplexes กับคลิปปากตะเข้เอนไซม์ถูกกำหนด โดย hybridization ของดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอเป้าหมาย ด้วยโพรบดีเอ็นเอถูกผูกไว้ที่อุณหภูมิแตกต่างกันโดยใช้เซลล์ในคอฟฟี่ช็อป/ของช่องคู่ thermostated มา เงื่อนไขการ hybridization และประสิทธิภาพรวมได้เปรียบเทียบสำหรับการรวมดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอเพื่อการเคลือบทองผูกผิวดีเอ็นเอโพรบ อุณหภูมิการละลายสำหรับเพล็กซ์ดีเอ็นเอดีเอ็นเอได้ประมาณ 15 ° C สูงกว่าการดีเอ็นเออาร์เอ็นเอในสถานะของแข็ง อุณหภูมิละลายในโซลูชันได้วัดเปรียบเทียบกับค่าผิว อาร์เอ็นเอและดีเอ็นเอ ช่วงละลายถูกมากต่ำกว่า (∼20 ° C) ในของแข็งผูกสัมพันธ์กับโซลูชัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับพื้นผิวหาอาร์เอ็นเอดีเอ็นเอลูกผสม อุณหภูมิละลายถูกลดอุณหภูมิห้อง หรือต่ำกว่า เนื่องจากแพลตฟอร์ม biosensor ส่วนใหญ่ทำงานที่อุณหภูมิห้อง พวกเขาจึงอาจแสดงประสิทธิภาพดีเซ็นเซอร์เนื่องจากโต้โพรบเป้าหมายอย่างไร ผลลัพธ์นี้เน้นที่ประสิทธิภาพของเซนเซอร์ที่ดีที่สุด ผสมละลายอุณหภูมิควร ความสามารถในการศึกษา และเพิ่มประสิทธิภาพรวมของเสริม strands ของ genomic วัสดุจะผูกคลิปปากตะเข้ DNA สามารถช่วยตรวจสอบอย่างรวดเร็วและรหัสของไวรัสพืชมีอาร์เอ็นเอ genomic ใช้ biosensor ต่าง ๆ เทคนิควิเคราะห์อย่างรวดเร็ว

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อุณหภูมิหลอมละลายของการสอบสวนเป้าหมายลูกผสมกรดนิวคลีมีบทบาทสำคัญในการทำงานของเซ็นเซอร์ การศึกษาครั้งนี้เสียงสะท้อนพื้นผิว plasmon ลูกจ้าง (SPR) เทคนิคในการตรวจสอบการผสมพันธุ์ของทั้งสองดีเอ็นเออาร์เอ็นเอและเป้าหมายที่จะ oligonucleotide ดีเอ็นเอพื้นผิวที่ถูกผูกไว้ที่สมบูรณ์ของพวกเขาและอุณหภูมิละลายที่สอดคล้องกัน โมเลกุลเป้าหมายที่ได้รับสาระเบื่อหน่าย 26 อาร์เอ็นเอที่เลือกเพราะยูทิลิตี้ในการตรวจสอบไวรัสโมเสคยาสูบเชื้อโรคพืชที่พบกับจีโนมอาร์เอ็นเอ อุณหภูมิหลอมละลายของแฝดกับยานสำรวจตรึงถูกกำหนดโดยการผสมข้ามพันธุ์ของดีเอ็นเออาร์เอ็นเอและเป้าหมายที่มีการสอบสวนดีเอ็นเอที่ถูกผูกไว้ที่อุณหภูมิที่แตกต่างกันโดยใช้ thermostated ที่สร้างขึ้นเอง dual-channel เซลล์ SPR เงื่อนไขการผสมพันธุ์และมีประสิทธิภาพมีผลผูกพันเปรียบเทียบดีเอ็นเออาร์เอ็นเอและมีผลผูกพันกับการสอบสวนดีเอ็นเอพื้นผิวที่ถูกผูกไว้เคลือบทอง อุณหภูมิหลอมละลายสำหรับเพล็กซ์ดีเอ็นเอดีเอ็นเออยู่ที่ประมาณ 15 องศาเซลเซียสสูงกว่าดีเอ็นเออาร์เอ็นเอในสถานะของแข็ง อุณหภูมิหลอมละลายในการแก้ปัญหานอกจากนี้ยังได้รับการวัดเปรียบเทียบกับพื้นผิวค่า ทั้ง RNA และ DNA เปลี่ยนละลายต่ำอย่างมีนัยสำคัญ (~20 ° C) ของรัฐที่มีผลผูกพันที่แข็งแกร่งเมื่อเทียบกับวิธีการแก้ปัญหา โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับผิวตรึงเจียวดีเอ็นเออาร์เอ็นเออุ​​ณหภูมิหลอมละลายลดลงไปที่อุณหภูมิห้องหรือต่ำกว่า เนื่องจากส่วนใหญ่แพลตฟอร์มไบโอเซนเซอร์ทำงานที่อุณหภูมิห้องพวกเขาจึงอาจแสดงประสิทธิภาพการทำงานของเซ็นเซอร์ที่ไม่ดีเนื่องจากการอ่อนค่าลงปฏิสัมพันธ์สอบสวนเป้าหมาย ผลที่ได้นี้เน้นว่าสำหรับผลการดำเนินงานที่ดีที่สุดเซ็นเซอร์อุณหภูมิหลอมละลายไฮบริดที่ควรพิจารณา ความสามารถในการศึกษาและเพิ่มประสิทธิภาพการผูกพันของเส้นที่สมบูรณ์ของว​​ัสดุจีโนมที่จะดีเอ็นเอโพรบที่ถูกผูกไว้จะอำนวยความสะดวกในการตรวจสอบอย่างรวดเร็วและบัตรประจำตัวของไวรัสพืชที่มีจีโนมอาร์เอ็นเอโดยใช้เทคนิคการวิเคราะห์ไบโอเซนเซอร์ต่างๆอย่างรวดเร็ว

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ละลายอุณหภูมิของเครื่องเป้าหมายกรดนิวคลีอิกลูกผสม มีบทบาทสำคัญในประสิทธิภาพของเซ็นเซอร์ ในการศึกษานี้ได้ใช้เทคนิคการสะท้อน PLASMON พื้นผิว ( SPR ) เพื่อศึกษาชนิดของ DNA และ RNA DNA ของผิวซึ่งหมายไว้ ซึ่งอุณหภูมิหลอมเหลวและสอดคล้องกันโมเลกุลเป้าหมาย 26 เส้นอาร์เอ็นเอนิวคลีโอไทด์เลือกเพราะประโยชน์ในการตรวจหายาสูบทำด้วยโมเสคไวรัสเชื้อโรคพืชทั่วไปกับอาร์เอ็นเอยีโนมของ ละลายอุณหภูมิของแฝดกับตรึง probes ซึ่งเบสของ DNA และ RNA DNA probe เป้าหมายไว้ที่อุณหภูมิต่างกัน โดยใช้ตัวเอง thermostated Dual SPR ช่องเซลล์เงื่อนไขและการเปรียบเทียบประสิทธิภาพสารทั้ง DNA และ RNA ผูกกับพื้นผิวที่เคลือบทองไว้ตรวจดีเอ็นเอ ละลาย อุณหภูมิ สำหรับดีเอ็นเอดีเอ็นเอ–เพล็กซ์คือประมาณ 15 °องศาเซลเซียสสูงกว่า DNA และ RNA ในสถานะของแข็ง ละลายอุณหภูมิในสารละลายยังวัดเพื่อเปรียบเทียบกับผิวค่า ทั้ง RNA และ DNAละลายเปลี่ยนเป็นอย่างต่ำ ( ∼ 20 ° C ) สำหรับของแข็งรัฐผูกสัมพันธ์กับโซลูชั่น โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับผิวหน้าตรึง ดีเอ็นเออาร์เอ็นเอและลูกผสม , ละลายอุณหภูมิลดลงถึงอุณหภูมิห้อง หรือด้านล่าง เนื่องจากแพลตฟอร์มไบโอเซนเซอร์มากที่สุดการใช้งานที่อุณหภูมิห้อง พวกเขาอาจทำให้มีคนจนเซ็นเซอร์ประสิทธิภาพเนื่องจากการลดลงตรวจสอบเป้าหมาย การมีปฏิสัมพันธ์ผลที่ได้นี้ เน้นที่ประสิทธิภาพเซ็นเซอร์อุณหภูมิหลอมเหลวไฮบริดที่ดีที่สุด ควรพิจารณา สามารถศึกษาและปรับใช้ประกอบเป็นวัสดุพันธุกรรม DNA probes ที่จะผูกสามารถอำนวยความสะดวกในการตรวจสอบอย่างรวดเร็วและการสร้าง RNA ไวรัสพืชที่มีการใช้ไบโอเซนเซอร์ต่าง ๆอย่างรวดเร็ว วิเคราะห์เทคนิค