4.2.2 Biology-Oriented Synthesis of

4.2.2 Biology-Oriented Synthesis of Natural Product-Inspired libraries
Waldmann has developed a new concept for the design of combinatorial libraries based on natural products that he calls BIOS.(154-156) This concept is based on the recognition of fundamental and complementary properties of natural products and their protein targets. Nature, through evolution of natural products, has explored only a tiny fraction of the available small-molecule chemical space. The same holds true for the biological targets of natural products, which are mainly proteins. The number of three-dimensional protein folds have been shown to be even more conserved during evolution than the underlying sequences, since topologically similar shapes can be formed by different sequences. Estimates of the number of proteins in humans range between 100 000 and 450 000; the number of topologically different protein folds is actually much lower, with estimates of 600−8 000.(169) Since both the natural product space and the protein structure space explored by Nature are limited in size and highly conserved, these structure spaces have to be highly complementary. Thus, a natural product that is an inhibitor of a specific protein fold represents a biologically validated starting point for the development of closely related structures that may inhibit proteins with similar folds and even allow for the discovery of specificity. These concepts are fundamentally similar to the privileged structure concept,(129) but BIOS has the added dimension of using protein folding patterns as the basis for subsequent screens.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

4.2.2 Biology-Oriented สังเคราะห์ของธรรมชาติผลิตภัณฑ์แรงบันดาลใจจากไลบรารีWaldmann ได้พัฒนาแนวคิดใหม่สำหรับการออกแบบของไลบรารีปัญหาตามธรรมชาติที่เขาเรียกว่า BIOS(154-156) แนวคิดนี้ขึ้นอยู่กับการรู้พื้นฐาน และเพิ่มเติมคุณสมบัติของผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติและโปรตีนเป้าหมายของพวกเขา ธรรมชาติ ผ่านวิวัฒนาการของผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ ได้ไปเพียงเศษเสี้ยวเล็ก ๆ ของพื้นที่การเคมีโมเลกุลขนาดเล็กที่มี เดียวกันถือจริงสำหรับเป้าหมายทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ ซึ่งส่วนใหญ่เป็นโปรตีน จำนวนพับโปรตีนสามมิติได้รับการแสดงเพื่อจะยิ่งอยู่ในระหว่างวิวัฒนาการกว่าลำดับต้นแบบ เนื่องจากสามารถจัดรูปร่างคล้าย topologically ตามลำดับแตกต่างกัน ประเมินจำนวนโปรตีนในมนุษย์ช่วงระหว่าง 100 000 และ 450 000 มีจำนวนโปรตีนที่แตกต่างกัน topologically พับล่างจริงมาก มีการประเมิน 600−8 000(169) เนื่องจากพื้นที่ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและพื้นที่โครงสร้างโปรตีนที่อุดม ด้วยธรรมชาติจะจำกัดขนาด และสูงอยู่ ช่องว่างของโครงสร้างเหล่านี้มีจะสูงเสริม ดังนั้น ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่เป็นผลของพับโปรตีนเฉพาะแสดงถึงการพัฒนาโครงสร้างที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่อาจยับยั้งโปรตีนกับพับคล้ายกัน และยังช่วยให้การค้นพบของ specificity จุดเริ่มต้นการตรวจชิ้น แนวคิดเหล่านี้มีความคล้ายคลึงกับ concept,(129) โครงสร้างอภิสิทธิ์ แต่ BIOS ได้เพิ่มมิติของการใช้โปรตีนในการพับรูปแบบเป็นพื้นฐานสำหรับหน้าจอต่อมา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

4.2.2 การสังเคราะห์สารชีววิทยาเชิงของห้องสมุด Natural Product แรงบันดาลใจ
Waldmann ได้มีการพัฒนาแนวคิดใหม่สำหรับการออกแบบของห้องสมุด combinatorial ขึ้นอยู่กับผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่เขาเรียกว่า BIOS. (154-156) แนวคิดนี้จะขึ้นอยู่กับการรับรู้ของพื้นฐานและเสริม คุณสมบัติของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและโปรตีนเป้าหมายของพวกเขา ธรรมชาติผ่านการวิวัฒนาการของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ, มีการสำรวจเพียงส่วนเล็ก ๆ ของพื้นที่เคมีโมเลกุลขนาดเล็กที่มีอยู่ เดียวกันถือเป็นจริงสำหรับเป้าหมายทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติซึ่งส่วนใหญ่จะเป็นโปรตีน จำนวนเท่าโปรตีนสามมิติได้รับการแสดงที่จะได้อนุรักษ์มากขึ้นในช่วงวิวัฒนาการกว่าพื้นฐานลำดับเนื่องจากทอพอโลยีรูปทรงที่คล้ายกันสามารถเกิดขึ้นโดยลำดับที่แตกต่างกัน การประเมินจำนวนของโปรตีนในช่วงระหว่างมนุษย์ 100 000 และ 450 000; จำนวนเท่าโปรตีนที่แตกต่างกันทอพอโลยีที่เป็นจริงต่ำกว่ามากกับประมาณการของ 600-8 000 (169) เนื่องจากทั้งสองพื้นที่ผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติและพื้นที่โครงสร้างโปรตีนสำรวจโดยธรรมชาติจะถูก จำกัด ในขนาดและอนุรักษ์สูงช่องว่างโครงสร้างเหล่านี้จะ เป็นความสมบูรณ์สูง ดังนั้นผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติที่เป็นสารยับยั้งของคอกโปรตีนที่เฉพาะเจาะจงเป็นจุดเริ่มต้นการตรวจสอบทางชีวภาพเพื่อการพัฒนาของโครงสร้างที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่อาจยับยั้งโปรตีนที่มีเท่าที่คล้ายกันและยังช่วยให้สำหรับการค้นพบความจำเพาะ แนวคิดเหล่านี้เป็นพื้นฐานคล้ายกับแนวคิดโครงสร้างสิทธิพิเศษ (129) แต่ BIOS มีเพิ่มมิติของการใช้รูปแบบการพับโปรตีนเป็นพื้นฐานสำหรับหน้าจอที่ตามมา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

4.2.2 ชีววิทยาเชิงสังเคราะห์ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติแรงบันดาลใจจากห้องสมุด
วอล์ดเมินน์ได้พัฒนาแนวคิดใหม่สำหรับการออกแบบเชิงการจัดห้องสมุดโดยใช้ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่เขาเรียกไบออส ( 154-156 ) แนวคิดนี้จะขึ้นอยู่กับการรับรู้ของพื้นฐานและการเสริมคุณสมบัติของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและเป้าหมายของโปรตีน ธรรมชาติ ผ่านวิวัฒนาการของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติมีการสํารวจเพียงส่วนเล็ก ๆของสารเคมีที่มีโมเลกุลเล็ก พื้นที่ เดียวกันถือเป็นจริงสำหรับเป้าหมายทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติซึ่งส่วนใหญ่เป็นโปรตีน จำนวนโปรตีนทบสามมิติได้รับการแสดงให้มากขึ้นในลำดับวิวัฒนาการกว่าอนุรักษ์ เป็นต้น เนื่องจาก topologically รูปทรงคล้ายสามารถเกิดขึ้นโดยลำดับต่าง ๆการประเมินจำนวนของโปรตีนในมนุษย์ ในช่วงระหว่าง 100   000 และ 450   000 ; จํานวนเท่าโปรตีนที่แตกต่างกัน topologically เป็นจริงต่ำมาก มีประมาณ 600 − 8   000 ( 169 ) เนื่องจากทั้งผลิตภัณฑ์ธรรมชาติพื้นที่และโครงสร้างโปรตีนพื้นที่สำรวจธรรมชาติและอนุรักษ์จำกัดในขนาดสูง , เป็นโครงสร้างเหล่านี้เป็นอย่างสูงที่สมบูรณ์แบบ ดังนั้นผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติที่เป็นสารโปรตีนที่เฉพาะเจาะจงของพับได้ตรวจสอบเป็นจุดเริ่มต้นสำหรับการพัฒนาอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างที่อาจยับยั้งโปรตีนพับที่คล้ายกันและยังช่วยให้สำหรับการค้นพบของ specificity แนวคิดเหล่านี้ เป็นพื้นฐานคล้ายคลึงกับแนวคิดโครงสร้างสิทธิพิเศษ( 129 ) แต่ไบออสได้เพิ่มมิติของการใช้รูปแบบการพับโปรตีนเป็นพื้นฐานสำหรับหน้าจอ
ตามมา