(i)(ii)(iii) (iv)(v)DATAisageneexpr

(i)
(ii)
(iii) (iv)
(v)
DATAisageneexpressiondatamatrixwithsamples in columns. The first row contains the information of the experimental condition of each sample. The remaining rows contain gene expression.
GSisabinarymatrixcoded0or1withgenesinrows. Each column represents a predefined gene set, with row equal to 1 indicating that the gene is in the gene set, and 0 otherwise.
Alphaisthesignificancelevel.
nbPerm specifies the number of permutations, and at
least 5,000 is recommended.
MCP specifies one of three multiple comparison methods, Dunnett = 1, Tukey = 2, and sequential pairwise comparison = 3. MCP can be ignored when the number of experimental conditions is 2.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

(i)(ii)(iii) (iv)(v)DATAisageneexpressiondatamatrixwithsamples ในคอลัมน์ แถวแรกประกอบด้วยรายละเอียดของเงื่อนไขการทดลองของแต่ละอย่าง แถวที่เหลือประกอบด้วยยีนGSisabinarymatrixcoded0or1withgenesinrows แต่ละคอลัมน์แสดงถึงชุดยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้า แถวเท่ากับ 1 แสดงที่ยีนอยู่ในชุดยีน และอื่น ๆ 0AlphaisthesignificancelevelnbPerm ระบุหมายเลขสับ และที่ขอแนะนำให้อย่างน้อย 5000MCP ระบุหนึ่งในสามวิธีเปรียบเทียบหลาย Dunnett = 1, Tukey = 2 และตามลำดับเปรียบเทียบแพร์ไวส์ = 3 MCP สามารถละเว้นได้เมื่อจำนวนเงื่อนไขทดลอง 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

(i)
(ii)
(iii) (iv)
(V)
DATAisageneexpressiondatamatrixwithsamples ในคอลัมน์ แถวแรกมีข้อมูลของสภาพการทดลองของกลุ่มตัวอย่างแต่ละ แถวที่เหลือมีการแสดงออกของยีน.
GSisabinarymatrixcoded0or1withgenesinrows คอลัมน์แต่ละชุดของยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้ากับแถวเท่ากับ 1 แสดงให้เห็นว่ายีนที่อยู่ในชุดของยีนและ 0 เป็นอย่างอื่น.
Alphaisthesignificancelevel.
nbPerm
ระบุจำนวนของพีชคณิตและในน้อย5,000 ขอแนะนำ.
MCP ระบุหนึ่งในสามของการเปรียบเทียบหลาย วิธี Dunnett = 1 Tukey = 2 และลำดับการเปรียบเทียบจากจำนวน = 3 MCP สามารถปฏิเสธเมื่อจำนวนของเงื่อนไขการทดลองคือ 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

( ผม )

( 2 ) ( 3 ) ( 4 ) ( 5 )

dataisageneexpressiondatamatrixwithsamples ในคอลัมน์ แถวแรกมีรายละเอียดของเงื่อนไขการทดลองของแต่ละตัวอย่าง แถวที่เหลือมีการแสดงออกของยีน gsisabinarymatrixcoded0or1withgenesinrows
. แต่ละคอลัมน์เป็นยีนที่กำหนดไว้ล่วงหน้าชุด กับแถวเท่ากับ 1 แสดงว่ายีนเป็นยีนที่กำหนดไว้และ 0
มิฉะนั้น .alphaisthesignificancelevel .
nbperm ระบุหมายเลขลำดับ และอย่างน้อย 5 , 000 แนะนำ
.
MCP ระบุหนึ่งจากสามวิธีเปรียบเทียบหลาย Dunnett = 1 คู่ = 2 , และลำดับขั้นตอนการเปรียบเทียบ = 3 MCP สามารถถูกละเว้น เมื่อตัวเลขของเงื่อนไขการทดลองเป็น 2