To examine the effect of topologica

To examine the effect of topological differences, we considered two different
model trees (trees [A] and [B] of fig. 6), both of which consist of eight OTUs. Model
tree (A) has two neighboring pairs ([ 1, 21 and [7, S]), whereas model tree (B) has four
([l, 21, [3,41, 15,619 and [7, 81). To make the effect of branch lengths comparable for
the two model trees, we assumed that the interior branch length (a) is the same for
both trees. We also tried to make the average @) of all pairwise distances (0;s) nearly
the same for the two trees. Hence, we set c = b + 3a or c = b + 3a, where a, b, and
c are the expected branch lengths (expected numbers of nucleotide substitutions per
site) given in figure 6. In a computer simulation conducted with the same topology
as that of model tree (A), Tateno et al. (1982) set a = b. In the present study, we set
a Q b in model tree (A) so that the differences between different Du’s were relatively
smaller. This makes it more difficult to reconstruct the correct tree than in the case
of Tateno et al.‘s simulation.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตรวจสอบผลของความแตกต่างที่ topological เราถือสองแตกต่างกันรูปต้นไม้ (ต้นไม้ [A] และ [B] fig. 6), ซึ่งทั้งสองประกอบด้วย OTUs แปด แบบจำลองต้นไม้ (A) มี 2 คู่ที่ใกล้เคียง ([1, 21 และ [7, S]), ในขณะที่แบบจำลองแผนภูมิ (ข) มี 4([l, 21, [3,41, 15,619 และ [7, 81) เพื่อให้ผลของความยาวสาขาเทียบเคียงสำหรับต้นไม้จำลองสอง เราสันนิษฐานว่า สาขาภายในความยาว (a) ไม่เหมือนกันต้นไม้ทั้งสองนี้ เรายังพยายามที่จะทำให้ค่าเฉลี่ยแอ) ของระยะทางทั้งหมดแพร์ไวส์ (0; s) เกือบเดียวกันสำหรับต้นไม้ทั้งสองนี้ ดังนั้น เรากำหนด c = 3a + b หรือ c = b + 3a, a, b และc คือ ความยาวสาขาคาด (คาดว่าตัวเลขของนิวคลีโอไทด์ต่อเว็บไซต์) ในรูปที่ 6 ในการจำลองคอมพิวเตอร์ที่ดำเนินการกับโทโพโลยีเดียวเป็นรูปแบบต้นไม้ (A) Tateno et al. (1982) ชุดการ = b ในการศึกษาปัจจุบัน เราตั้งb Q ในรูปแบบต้นไม้ (A) เพื่อให้ความแตกต่างระหว่างความแตกต่างของดูได้ค่อนข้างขนาดเล็ก นี้ทำให้ยากต่อการสร้างแผนภูมิที่ถูกต้องมากกว่าในกรณีของการจำลอง Tateno et al.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อตรวจสอบผลกระทบของความแตกต่างของทอพอโลยีที่เราพิจารณาที่แตกต่างกันสองต้นไม้รูปแบบ (ต้นไม้ [A] และ [B] ของมะเดื่อ. 6) ซึ่งทั้งสองประกอบด้วยแปด Otus
รุ่นต้นไม้ (A) มีสองคู่ที่ใกล้เคียง ([1, 21 และ [7, S]) ในขณะที่ต้นไม้รูปแบบ (B) มีสี่ ([ลิตร, 21, [3,41, 15619 และ [7, 81) เพื่อให้ผลกระทบของความยาวสาขาเทียบเคียงสำหรับต้นไม้ทั้งสองรุ่นเราสันนิษฐานว่าระยะเวลาในการตกแต่งภายในสาขา (ก) จะเหมือนกันสำหรับต้นไม้ทั้งสอง นอกจากนี้เรายังพยายามที่จะทำให้ค่าเฉลี่ย @) ของระยะทางจากจำนวนทั้งหมด (0; s) เกือบเหมือนกันสำหรับต้นไม้สองต้น ดังนั้นเราตั้งค = b + 3a หรือ c = B + 3a ที่ A, B และC มีความยาวสาขาที่คาดหวัง (ตัวเลขที่คาดหวังของการแทนเบื่อหน่ายต่อสถานที่เดียวกัน) รับในรูป 6. ในการจำลองด้วยคอมพิวเตอร์ที่จัดทำด้วยเหมือนกัน โครงสร้างเป็นที่ของต้นไม้รูปแบบ(A), Tateno et al, (1982) ตั้ง = b ในการศึกษาปัจจุบันเราตั้งเป็นข Q ในรูปแบบต้นไม้ (A) เพื่อให้ความแตกต่างระหว่างที่แตกต่างกันของ Du ค่อนข้างมีขนาดเล็ก นี้จะทำให้มันยากมากที่จะสร้างต้นไม้ที่ถูกต้องกว่าในกรณีของ Tateno et al, จำลอง. ของ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อศึกษาผลของความแตกต่างของรูปแบบ เราถือว่าต้นไม้สองรุ่นแตกต่างกัน
( ต้นไม้ [ ] และ [ b ] จากภาพที่ 6 ) ซึ่งประกอบด้วยแปดใน . แบบจำลอง
ต้นไม้ ( เพื่อนบ้าน ) มี 2 คู่ ( [ 1 , 21 และ [ 7 s , ] ) ส่วนโมเดลต้นไม้ ( B ) มี 4
( [ l , 21 , [ 3,41 โยง , และ [ 7 , 81 ) ทำให้ผลของความยาวเทียบเท่าสาขาสำหรับ
สองโมเดลต้นไม้เราสันนิษฐานว่าความยาวสาขาตกแต่งภายใน ( ) เป็นเหมือนกัน
ทั้งต้นไม้ นอกจากนี้เรายังพยายามที่จะทำให้ค่าเฉลี่ยของระยะทางทั้งหมด ( คู่ ) @ 0
; S ) เกือบเหมือนกันกับต้นไม้ 2 ต้น ดังนั้น เราตั้งค่า C = B หรือ C = B 3A 3A ที่ A , B , C และ
คาดว่าสาขานี้ ( คาดว่าตัวเลขของลำดับเบสแทนต่อ
เว็บไซต์ ) ให้อยู่ในรูปที่ 6ในคอมพิวเตอร์จำลองกับกลุ่มเดียวกันของ
เป็นโมเดลต้นไม้ ( ) , ทาทิโน และคณะ ( 1982 ) ตั้ง = B ในการศึกษา เราตั้งค่า
Q B ในรูปแบบต้นไม้ ( ) เพื่อให้ความแตกต่างระหว่างที่แตกต่างกันดูก็ค่อนข้าง
ขนาดเล็ก นี้จะทำให้มันมากขึ้นยากที่จะสร้างต้นไม้ที่ถูกต้องกว่าในกรณี
ของทาทิโน et al . ของจำลอง