3.1. Size and global shape of PV2Th

3.1. Size and global shape of PV2
The size and global shape of the quaternary structure of native PV2
were studied by means of SAXS experiments. The data obtained were
normalized for protein concentration and depicted in Fig. 1A. A gyration
radius of 44±1 Å was obtained from the Guinier plot (inset in Fig. 1A).
The Kratky plot has the typical bell-shaped form expected for globular
proteins (Fig. 1B). Fig. 1C shows the pair distance distribution P(r)
obtained using the regularized Fourier Transformmethod implemented
in the program GNOM 4.5 [25]. The P(r) obtained for native PV2 shows
a maximum at 44 Å with a well defined Dmax=130 Å compatible
with an anisometric particle. A low-resolution model for native PV2
was obtained using Simulated Annealing Algorithms implemented
in the program DAMMIN [22]. The final model, obtained by averaging
16 independently calculated models using the algorithms implemented
in the program package DAMAVER [24], is depicted in Fig. 2.
This ab initio dummy atom model fitted satisfactorily with the experimental
scattering intensity data (Fig. 1C). Image analysis of
TEM data helped to obtain the size distribution curve of these
particles. The particle size distributions for the protein are shown as a
histogram where a maximum around 137 Å can be observed (Fig. 1D
and Fig. 2S).
Fig.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.1 การรูปขนาด และสากล PV2
ขนาดและรูปร่างทั้งหมดของโครงสร้างของภาษา PV2 quaternary
ถูกศึกษา โดยทดลอง SAXS การ ข้อมูลที่ได้ถูก
ตามปกติสำหรับโปรตีนเข้มข้น และแสดงใน Fig. 1A Gyration เป็น
รัศมี 44±1 Åได้รับจากแผน Guinier (แทรกใน Fig. 1A) .
Kratky พล็อตได้ปกติทรงระฆังคว่ำแบบที่คาดไว้สำหรับ globular
โปรตีน (ฟิก 1B) . Fig. 1C แสดงคู่กระจายห่างจาก P (r)
ได้ใช้ Transformmethod ของฟูรีเย regularized ที่ใช้
ในโปรแกรม GNOM 4.5 [25] P(r) ได้รับสำหรับแสดงพื้นเมือง PV2
a สูงสุดที่ 44 Åด้วยดีกำหนด Dmax = 130 Åเข้า
กับอนุภาค anisometric แบบสนับสนุนสำหรับเจ้า PV2
กล่าวใช้จำลองการอบเหนียวอัลกอริทึมใช้
ในโปรแกรม DAMMIN [22] รุ่นสุดท้าย ได้รับ โดยหาค่าเฉลี่ย
16 คำนวณแบบจำลองที่ใช้อัลกอริทึมที่นำมาใช้อย่างอิสระ
ในแพคเกจโปรแกรม DAMAVER [24], เป็นแสดงใน Fig. 2.
อะตอม ab initio กันขโมยรุ่นนี้ติดตั้งผ่านการทดลอง
โปรยข้อมูลความเข้ม (Fig. 1C) ภาพวิเคราะห์
ยการข้อมูลช่วยเพื่อให้ได้เส้นโค้งการกระจายขนาดนี้
อนุภาค การกระจายขนาดอนุภาคสำหรับโปรตีนจะถูกแสดงเป็นการ
ฮิสโตแกรมสูงสุดประมาณ 137 Åสามารถจะสังเกต (Fig. 1D
และ Fig. 2S) .
ฟิก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.1 ขนาดและรูปร่างของโลก PV2
ขนาดและรูปร่างของโลกของโครงสร้างสี่ของพื้นเมือง PV2
การศึกษาโดยวิธีการทดลอง SAXS ข้อมูลที่ได้ถูก
ปกติความเข้มข้นของโปรตีนและภาพในรูปที่ 1A การหมุน
รัศมี 44 ± 1 Åได้รับมาจากพล็อต Guinier (สิ่งที่ใส่เข้าไปในรูปที่ 1A.)
พล็อต Kratky มีรูปแบบรูประฆังทั่วไปที่คาดว่าจะเป็นรูปทรงกลม
โปรตีน (รูปที่ 1B) มะเดื่อ 1C แสดงให้เห็นถึงการกระจาย P ระยะทางคู่ (R)
ได้รับการใช้ regularized ฟูริเยร์ Transformmethod ดำเนินการ
ในโปรแกรม Gnom 4.5 [25] P (R) ที่ได้รับการแสดงพื้นเมือง PV2
สูงสุดที่ 44 ที่มีกำหนดไว้อย่างดีแม็ = 130 Åเข้ากันได้
กับอนุภาค anisometric รูปแบบความละเอียดต่ำเพื่อพื้นเมือง PV2
ได้จากการใช้ขั้นตอนวิธีการหลอมจำลองดำเนินการ
ในโปรแกรม DAMMIN [22] รุ่นสุดท้ายที่ได้รับโดยเฉลี่ย
16 รุ่นที่มีการคำนวณโดยใช้กลไกที่เป็นอิสระดำเนินการ
ในแพคเกจโปรแกรม DAMAVER [24] เป็นภาพในรูปที่ 2
นี้ขเริ่มแรกรุ่นอะตอมหุ่นติดตั้งที่น่าพอใจกับการทดลอง
การกระเจิงข้อมูลความเข้ม (รูปที่ 1C) การวิเคราะห์ภาพของ
ข้อมูล TEM ช่วยเพื่อให้ได้เส้นโค้งการกระจายขนาดของเหล่า
อนุภาค การกระจายขนาดของอนุภาคโปรตีนจะแสดงเป็น
กราฟที่สูงสุดประมาณ 137 Åสามารถสังเกตได้ (รูปที่ 1D
และรูปที่. 2S)
รูปที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.1 . ขนาดและรูปร่างของโลก pv2
ขนาดและรูปร่างของโครงสร้าง quaternary ) พื้นเมือง pv2
ศึกษาโดยวิธีการทดลอง saxs . ข้อมูลที่เป็นมาตรฐานสำหรับความเข้มข้นของโปรตีนและ
ปรากฎในรูปที่ 1A มีรัศมีการโคจร
44 ± 1 กริพเพนได้จาก guinier พล็อต ( ใส่รูปที่ 1A ) .
พล็อต kratky ได้โดยทั่วไปรูปแบบรูปทรงระฆังคาดว่าโปรตีนรูปทรงกลม
( ฟิค1B ) รูปที่ 1C แสดงคู่ระยะทางการกระจาย P ( R )
ได้รับการ regularized ฟูเรียร์ transformmethod ใช้
ในโปรแกรม gnom 4.5 [ 25 ] P ( R ) ที่ได้รับ pv2 แสดงพื้นเมือง
สูงสุดที่ 44 กริพเพนกับที่กำหนดไว้เป็นอย่างดี ดีแมคซ์ = 130 •เข้ากันได้
ที่มีอนุภาค anisometric . โมเดลความละเอียดต่ำพื้นเมือง pv2
ได้รับการใช้ขั้นตอนวิธีการจำลองการอบเหนียวใช้
ใน dammin โปรแกรม [ 22 ] รุ่นสุดท้ายที่ได้รับโดยเฉลี่ย
16 คำนวณอิสระรูปแบบการใช้อัลกอริทึมที่ใช้
ในแพคเกจโปรแกรม damaver [ 24 ] จะแสดงในรูปที่ 2 .
นี้ Ab initio หุ่นอะตอมแบบเข็มขัด ควรมีการกระจายข้อมูลความเข้ม 2
( รูปที่ 1C ) การวิเคราะห์ภาพของข้อมูลเต็มๆ ช่วย
เพื่อให้ได้การกระจายขนาดของอนุภาคเหล่านี้เส้นโค้ง

ขนาดอนุภาคกระจายในโปรตีนจะแสดงเป็นกราฟที่
สุดรอบ 137 •สามารถสังเกตได้ ( ภาพที่ 1 ดี

รูป และรูปที่ 20 )