ISSR markers have many advantages o

ISSR markers have many advantages over other marker systems. ISSR technique is simple, quick and less costly like the RAPD technique. ISSR markers have high reproducibility than RAPD primers due to the longer primer length. The studies on reproducibility showed that about 92 − 95% of the scored fragments could be repeated across DNA samples of the same cultivars and across separate PCR runs. Development of ISSR markers does not need prior knowledge of the genome to be analyzed; hence, it can be used universally for plant genome analysis. ISSR markers
provide more polymorphism (Fang et al., 1997; Wolfe et al., 1998) as compared to isozymes, because of the lack of mutational constraints in the inter simple sequence repeat as they are largely part of the noncoding regions of the genome, while isozymes are from the coding regions of the genome (Wolfe et al., 1998). Similarly, mitochondrial and chloroplast DNA markers are haploid, maternally inherited, lack recombination and show gametic disequilibrium. Further, the rate of evolution of ISSR, mitochondrial and chloroplast markers was reported to be quite different as the ISSR markers evolve faster than the other two, despite the fact that mitochondrial genome shows extensive rearrangement of its structural organization. It has also been observed that genomic regions containing microsatellites are evolving and mutating more rapidly than other areas due to slip-strand mispairing during replication, with the slippage rate dependent upon the length of the repeat (Burgess et al., 2001). The slow rate of evolution exhibited by the mitochondrial gene made it
less useful in genome analysis at family and subfamily levels but has proved to be very useful in inferring ancient phylogenetic relationships, and time and mode of diversifications.Owing to the above mentioned advantages, ISSR markers have extensively been used for characterization of germplasm (Wolff et al., 1995; Charters and Wilkinson,2000), to estimate the extent of genetic diversity at interand intra-specific level in a wide range of crop species (Salimath et al., 1995; Nagaoka and Ogihara, 1997; Prevost et al., 1998; Joshi et al., 2000; Ajibade et al., 2000),
to identify DNA markers closely linked to important agronomic traits (Ratnaparkhe et al., 1998; Hussain et al., 2000; Levin et al., 2000), to determine the distribution of
microsatellites in the genome (Gupta et al., 1994; Nagaoka and Ogihara, 1997; Blair et al., 1999; Pasakinskiene et al., 2000), to test the hypothesis of speciation
(Wolfe et al., 1998) and to study the history of colonization of plant communities, to distinguish closely related cultivars and varieties (Prevost et al., 1999) and also to
detect somaclonal variations in plants (Albani and Wilkinson, 1998). ISSR markers have also been used for screening for duplicate accessions in germplasm collections
(Virk et al., 2000). Thus, ISSR markers have many applications in plant genome analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เครื่องหมาย ISSR มีข้อดีมากมายผ่านระบบเครื่องหมายอื่น ๆ เทคนิค ISSR เป็นง่าย รวดเร็ว และลดค่าใช้จ่ายเช่นเทคนิคอาร์เอพีดี เครื่องหมาย ISSR มี reproducibility สูงกว่าไพรเมอร์อาร์เอพีดีเนื่องจากความยาวพื้นอีกต่อไป การศึกษา reproducibility แสดงให้เห็นว่า สามารถซ้ำ− 92 ประมาณ 95% ของชิ้นส่วน scored ตัวอย่างดีเอ็นเอของพันธุ์เดียวกัน และ ข้ามแยกทำ PCR การพัฒนาเครื่องหมาย ISSR ต้องความรู้เดิมของจีโนมจะวิเคราะห์ ดังนั้น มันสามารถใช้ได้แบบสำหรับการวิเคราะห์จีโนมของพืช เครื่องหมาย ISSRให้เพิ่มเติมโพลีมอร์ฟิซึม (ฝางและ al., 1997 Wolfe et al., 1998) เมื่อเทียบกับ isozymes เนื่องจากไม่มีข้อจำกัด mutational ในอินเตอร์ลำดับซ้ำพวกเขาเป็นส่วนใหญ่ส่วนหนึ่งของแคว้นจีโนม noncoding ขณะ isozymes จากภูมิภาครหัสของจีโนม (Wolfe et al., 1998) ในทำนองเดียวกัน mitochondrial และเครื่องหมายดีเอ็นเอของคลอโรพลาสต์เป็น haploid สืบ ทอด maternally ขาด recombination และแสดง gametic disequilibrium เพิ่มเติม รายงานอัตราวิวัฒนาการ ISSR, mitochondrial และเครื่องหมายคลอโรพลาสต์จะค่อนข้างแตกต่างกับเครื่องหมาย ISSR พัฒนาได้เร็วกว่าอื่น 2 ทั้ง ๆ ที่กลุ่ม mitochondrial แสดง rearrangement ครอบคลุมองค์กรของโครงสร้าง มันมียังถูกตรวจสอบว่า ภูมิภาค genomic microsatellites มีวิวัฒนาการ และ mutating เร็วกว่าพื้นที่อื่น ๆ จาก mispairing ในระหว่างการจำลองแบบ มีภาวะสาระจัดอันดับขึ้นจำนวนซ้ำ (แอ et al., 2001) วิวัฒนาการที่จัดแสดง โดยยีน mitochondrial อัตราช้าทำให้มันมีประโยชน์น้อยในการวิเคราะห์จีโนมที่ครอบครัวและ subfamily ระดับ แต่ได้พิสูจน์ให้เป็นประโยชน์อย่างมากในเวลา สัมพันธ์โบราณ phylogenetic inferring และโหมดของ diversifications เพราะข้อดีดังกล่าวข้างต้น เครื่องหมาย ISSR อย่างกว้างขวางใช้สำหรับคุณสมบัติของ germplasm (Wolff และ al., 1995 บริการและ Wilkinson, 2000), การประเมินขอบเขตของความหลากหลายทางพันธุกรรมในระดับเฉพาะภายใน interand ในความหลากหลายของชนิดพืช (Salimath และ al., 1995 นากาโอกะและ Ogihara, 1997 Prevost et al., 1998 Joshi et al., 2000 Ajibade และ al., 2000),ระบุเครื่องหมายดีเอ็นเออย่างใกล้ชิดกับลักษณะลักษณะทางสำคัญ (Ratnaparkhe et al., 1998 ชาร์และ al., 2000 Levin และ al., 2000), การตรวจสอบการกระจายของmicrosatellites ในจีโนม (กุปตา et al., 1994 นากาโอกะและ Ogihara, 1997 แบลร์ et al., 1999 Pasakinskiene และ al., 2000), การทดสอบสมมติฐานของการเกิดสปีชีส์ใหม่(Wolfe et al., 1998) และศึกษาประวัติของสนาม ของโรงงาน ชุมชน การแยกพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดและพันธุ์ (Prevost et al., 1999) และการตรวจสอบรูปแบบ somaclonal ในพืช (อัลบานีและ Wilkinson, 1998) นอกจากนี้การใช้เครื่องหมาย ISSR สำหรับคัดสำหรับ accessions ซ้ำในชุด germplasm(Virk et al., 2000) ดังนั้น เครื่องหมาย ISSR มีโปรแกรมประยุกต์จำนวนมากในโรงงานการวิเคราะห์จีโนม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เครื่องหมาย ISSR มีข้อดีกว่าระบบอื่น ๆ เครื่องหมาย เทคนิค ISSR ง่ายรวดเร็วและเสียค่าใช้จ่ายน้อยเช่นเทคนิค RAPD เครื่องหมาย ISSR มีการทำสำเนาสูงกว่าไพรเมอร์อาร์เอพีเนื่องจากความยาวไพรเมอร์อีกต่อไป การศึกษาเกี่ยวกับการทำซ้ำพบว่าประมาณ 92-95% ของชิ้นส่วนคะแนนอาจจะซ้ำข้ามตัวอย่างดีเอ็นเอของสายพันธุ์เดียวกันและข้ามแยก PCR วิ่ง การพัฒนาเครื่องหมาย ISSR ไม่จำเป็นต้องรู้ก่อนของจีโนมที่จะวิเคราะห์; จึงจะสามารถนำมาใช้อย่างกว้างขวางสำหรับการวิเคราะห์จีโนมของพืช เครื่องหมาย ISSR
ให้ความแตกต่างมากขึ้น (ฝาง, et al, 1997;. วูล์ฟ, et al, 1998.) เมื่อเทียบกับไอโซไซม์เนื่องจากการขาดของข้อ จำกัด ใน mutational ซ้ำลำดับที่เรียบง่ายระหว่างที่พวกเขาเป็นส่วนใหญ่ส่วนหนึ่งของภูมิภาค noncoding ของจีโนม ในขณะที่ไอโซไซม์จากภูมิภาคของจีโนมการเข้ารหัส (วูล์ฟ et al., 1998) ในทำนองเดียวกันเครื่องหมายยลดีเอ็นเอและมีคลอโรพลาเดี่ยวสืบทอดมารดา, ขาดการรวมตัวกันและแสดงให้สมดุล gametic นอกจากนี้อัตราการวิวัฒนาการของ ISSR, ยลและเครื่องหมาย chloroplast ก็จะค่อนข้างแตกต่างกันเป็นเครื่องหมาย ISSR วิวัฒนาการเร็วกว่าอีกสองแม้จะมีความจริงที่ว่าจีโนมยลแสดงให้เห็นถึงการปรับปรุงใหม่ที่กว้างขวางขององค์กรโครงสร้าง นอกจากนี้ยังได้รับการตั้งข้อสังเกตว่าภูมิภาคที่มีจีโนมไมโครและมีการพัฒนากรรมวิธีขึ้นอย่างรวดเร็วกว่าพื้นที่อื่น ๆ เนื่องจาก mispairing ลื่นสาระในระหว่างการจำลองมีอัตราการลื่นไถลขึ้นอยู่กับความยาวของการทำซ้ำ (ประชากร et al., 2001) อัตราที่ช้าของวิวัฒนาการแสดงโดยยีนยลทำให้มัน
มีประโยชน์น้อยในการวิเคราะห์จีโนมในระดับครอบครัวและอนุวงศ์ แต่ได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์อย่างมากในการอนุมานความสัมพันธ์ phylogenetic โบราณและเวลาและรูปแบบของการ diversifications.Owing ข้อได้เปรียบดังกล่าวข้างต้น ISSR เครื่องหมายที่ได้รับอย่างกว้างขวางใช้สำหรับลักษณะของเชื้อพันธุกรรม (วูล์ฟ, et al, 1995;. เทอร์และวิลกินสัน, 2000) เพื่อประเมินขอบเขตของความหลากหลายทางพันธุกรรมที่ interand ระดับภายในที่ระบุในความหลากหลายของสายพันธุ์พืช (Salimath, et ​​al. 1995; Nagaoka และ Ogihara, 1997; Prevost, et al, 1998;. Joshi et al, 2000;.. Ajibade, et al, 2000),
การระบุเครื่องหมายดีเอ็นเอที่เชื่อมโยงอย่างใกล้ชิดกับลักษณะทางการเกษตรที่สำคัญ (Ratnaparkhe et al, 1998;. ฮุสเซนและ อัล, 2000.. เลวิน, et al, 2000) เพื่อตรวจสอบการกระจายของ
ไมโครในจีโนม (Gupta et al, 1994;. Nagaoka และ Ogihara, 1997; แบลร์, et al, 1999;.. Pasakinskiene, et al, 2000) เพื่อทดสอบสมมติฐานของการ speciation
(วูล์ฟ et al., 1998) และในการศึกษาประวัติศาสตร์ของการล่าอาณานิคมของสังคมพืชที่จะแยกแยะความแตกต่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดและพันธุ์ (Prevost et al., 1999) และยัง
ตรวจสอบรูปแบบเซลล์ร่างกายในพืช ( อัลบาและวิลกินสัน, 1998) เครื่องหมาย ISSR ยังได้รับการใช้ในการคัดกรองสายที่ซ้ำกันในคอลเลกชันเชื้อพันธุกรรม
(Virk et al., 2000) ดังนั้นเครื่องหมาย ISSR มีการใช้งานมากในการวิเคราะห์จีโนมของพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

issr เครื่องหมายมีข้อดีกว่าระบบเครื่องหมายอื่น ๆ เทคนิค issr เป็นเรื่องง่าย รวดเร็วและเสียค่าใช้จ่ายน้อยกว่า เช่น เทคนิค RAPD . issr เครื่องหมาย RAPD primers มีคาร์บอนสูงมากกว่าเนื่องจากรองพื้นยาวยาว การศึกษาเกี่ยวกับยา พบว่า ประมาณ 92 − 95% ของคะแนนเศษอาจจะซ้ำในดีเอ็นเอของสายพันธุ์เดียวกันและข้าม วิ่งจากแยกการพัฒนาเครื่องหมาย issr ไม่ได้ต้องการความรู้เดิมของพันธุกรรม มาวิเคราะห์ ดังนั้น สามารถใช้อย่างกว้างขวางสำหรับการวิเคราะห์จีโนมพืช issr เครื่องหมาย
ให้ความหลากหลายมากขึ้น ( ฟาง et al . , 1997 ; Wolfe et al . , 1998 ) เมื่อเทียบกับเอนไซม์เพราะขาดฤทธิ์ข้อจำกัดในอินเตอร์ง่ายลำดับซ้ำเป็นพวกเขาเป็นส่วนใหญ่ส่วนหนึ่งของ noncoding ภูมิภาคของโครโมโซมในขณะที่ไอโซไซม์จากรหัสภูมิภาคของโครโมโซม ( วูล์ฟ et al . , 1998 ) ในทำนองเดียวกัน ไมโตคอนเดรียดีเอ็นเอและโครโมโซมมีคลอโรพลาสต์ , การขาดความเป็นแม่สืบทอด และแสดง gametic การเก็บน้ำ . เพิ่มเติมอัตราของวิวัฒนาการของ issr ไมโตคอนเดรียคลอโรพลาสต์ , และเครื่องหมายถูกรายงานจะแตกต่างกันค่อนข้างเป็น issr เครื่องหมายวิวัฒนาการเร็วกว่าสองอื่น ๆแม้จะมีความจริงที่ว่ายลจีโนมแสดงใหม่ที่กว้างขวางขององค์กรของโครงสร้างก็ยังได้รับพบว่าบริเวณจีโนมที่มีไมโครแซเทลไลต์มีการพัฒนาและกรรมวิธีอย่างรวดเร็วมากขึ้นกว่าพื้นที่อื่น เนื่องจากใบเกลียว mispairing ช่วงซ้ำกับเสียงเท่ากันขึ้นอยู่กับความยาวของขอ เบอร์เกส et al . , 2001 ) ลดอัตราของวิวัฒนาการแสดงโดยยีนไมโตคอนเดรียทำ
น้อยกว่าที่เป็นประโยชน์ในการวิเคราะห์จีโนมในระดับครอบครัว และ subfamily แต่ได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์อย่างมากในการยืนยันความสัมพันธ์โบราณ และเวลาและโหมดของ diversifications เนื่องจากข้อได้เปรียบดังกล่าวข้างต้น , เครื่องหมาย issr แพร่หลายเพื่อใช้ลักษณะของพันธุกรรม ( วูลฟ์ et al . , 1995 ; การเช่า และ วิลกินสัน , 2000 )เพื่อประเมินขอบเขตของความหลากหลายทางพันธุกรรมที่ interand ภายในระดับที่เฉพาะเจาะจงในหลากหลายของชนิดพืช ( salimath et al . , 1995 ; นากาโอกะ และ โองิฮาระน่ะ , 1997 ; เพรโวสต์ et al . , 1998 ; โจชิ et al . , 2000 ; ajibade et al . , 2000 ) ,
เพื่อระบุดีเอ็นเอถูกเชื่อมโยงอย่างใกล้ชิดกับลักษณะ ลักษณะทางการเกษตรที่สำคัญ ( ratnaparkhe et al . , 1998 ; Hussain et al . , 2000 ; Levin et al . , 2000 ) , การกระจายของ
ไมโครแซเทลไลต์ในจีโนม ( Gupta et al . , 1994 ; นากาโอกะ และ โองิฮาระน่ะ , 1997 ; แบลร์ et al . , 1999 ; pasakinskiene et al . , 2000 ) เพื่อทดสอบสมมติฐานของสปีชีย์
( วูล์ฟ et al . , 1998 ) และเพื่อศึกษาประวัติความเป็นมาของการล่าอาณานิคมของสังคมพืช แยกแยะความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดพันธุ์ และพันธุ์ ( เพรโวสต์ et al . , 1999 ) และยังพบในพืช (
รูปแบบกลไกลบานี และ วิลคินสัน1998 ) issr เครื่องหมายยังถูกใช้สำหรับการตรวจซ้ำสายพันธุ์ในพันธุ์คอลเลกชัน
( virk et al . , 2000 ) ดังนั้น issr เครื่องหมายมีการใช้งานมากในการวิเคราะห์จีโนมพืช