sequences of the target organisms. Further, their specificity
was thoroughly tested by both simplex PCR and multiplex
PCR, demonstrating their suitability for detecting
these five major pathogens.
For a multiplex PCR assay to be successful, the relative
concentrations of primers, PCR buffer concentration, the
balance between magnesium and DNA, cycling temperatures,
amounts of template DNA and Taq DNA polymerase
are very important (Markoulatos et al. 2002). In this
study, to develop an efficient multiplex PCR, reaction
conditions (Mg2+ concentration, concentration of primers
and annealing temperature) were optimized. The multiplex
PCR developed in this study yielded five bands
showing the specificity for each pathogen, thus confirming
the specificity of the five sets of primers.
A potential advantage of PCR is that it has a high level of
sensitivity. In this study, the sensitivity evaluation between
simplex PCR and multiplex PCR assay was performed. The
detection limit of simplex PCR was relatively lower than
that of multiplex PCR. However, the experiments still supported
the facts that the DNA extraction method could
successfully isolate DNA from PCR inhibitory components,
and the multiplex PCR assay developed in this study was
effective for the detection of target pathogens. Hereby, our
results demonstrated that amplification of the five sets of
primers was efficient with five clear bands.
During the naturally contaminated meat sample assays,
some of the multiplex PCR bands gave weak signals. We
applied simplex PCR to re-amplify the samples and
reconfirm the result. Results observed with multiplex PCR
and traditional cultures were highly consistent with the
exception of two samples. Beef sample number four gave
a positive result for L. monocytogenes by the traditional
culture method but was negative in the PCR method.
Analysis of the result may be that other Listeria species
like L. innocua, which is a nonpathogen and lacks the
hlyA gene, can also grow on the PALCAM agar as
L. monocytogenes. The suspicious colonies of Listeria further
detected by using PCR did not contain the hlyA
gene. Hence, the positive result by traditional culture
method should be combined with PCR methods to further
identify L. monocytogenes. Chicken sample number
two gave a positive result for Sh. flexneri by the PCR
method, but a negative result by the culture method. A
230-kb virulence-associated invasion plasmid, required for
entry into host cells, involving a cluster of genes, appears
in Shigella and enteroinvasive E. coli (EIEC) strains (Lan
et al. 2003; Vu et al. 2004; Hien et al. 2008). Consequently,
further investigation should be carried out with
respect to the potential virulence factors co-existing in
several species.
Taken together, this study reported a rapid multiplex
PCR assay using five primers sets for detection of multiple
ลำดับของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย เพิ่มเติมที่เฉพาะเจาะจงของพวกเขา
ถูกทดสอบอย่างละเอียดโดยทั้งสอง pcr เริมและ multiplex PCR
แสดงให้เห็นถึงความเหมาะสมของพวกเขาสำหรับการตรวจสอบเหล่านี้ห้า
เชื้อโรคที่สำคัญ.
การทดสอบ pcr multiplex จะประสบความสำเร็จญาติ
ความเข้มข้นของไพรเมอร์ความเข้มข้นของบัฟเฟอร์ pcr ที่
ความสมดุลระหว่างแมกนีเซียมและ dna อุณหภูมิขี่จักรยาน
จำนวนเงินของแม่และ dna taq dna โพลิเมอร์
มีความสำคัญมาก (markoulatos et al,. 2002) ในการศึกษานี้
เพื่อพัฒนา multiplex PCR ที่มีประสิทธิภาพปฏิกิริยา
เงื่อนไข (ความเข้มข้นของ Mg2 ขณะเข้มข้นของไพรเมอร์
และอุณหภูมิการหลอม) มีการเพิ่มประสิทธิภาพ multiplex PCR
การพัฒนาในการศึกษาครั้งนี้ให้ผลห้าวง
แสดงความเฉพาะเจาะจงสำหรับแต่ละเชื้อโรคจึงยืนยัน
จำเพาะของห้าชุดของไพรเมอร์.
ประโยชน์ที่มีศักยภาพของ pcr ว่ามีระดับสูงของความไว
ในการศึกษาครั้งนี้การประเมินผลความไวระหว่าง
pcr เริมและทดสอบ pcr multiplex ได้ดำเนินการ
ขีด จำกัด ของการตรวจสอบของเริม pcr ค่อนข้างต่ำกว่า
ที่ multiplex PCR แต่การทดลองยังคงได้รับการสนับสนุน
ข้อเท็จจริงว่าวิธีการสกัดดีเอ็นเอได้
ประสบความสำเร็จในการแยกดีเอ็นเอจากองค์ประกอบยับยั้ง PCR,
และทดสอบ pcr multiplex การพัฒนาในการศึกษาครั้งนี้เป็น
ที่มีประสิทธิภาพสำหรับการตรวจสอบของเชื้อโรคเป้าหมาย ขอเรา
ผลแสดงให้เห็นว่าการขยายของห้าชุด
ไพรเมอร์มีประสิทธิภาพกับห้าวงชัดเจน.
ระหว่างการปนเปื้อนตามธรรมชาติการตรวจตัวอย่างเนื้อ
บางส่วนของวง multiplex PCR ให้สัญญาณอ่อนแอ เรา
pcr เริมประยุกต์ใหม่ขยายตัวอย่างและ
ยืนยันผล ผลพบกับ multiplex PCR
และวัฒนธรรมแบบดั้งเดิมได้อย่างสอดคล้องกับ
ยกเว้นสองตัวอย่าง ตัวอย่างเนื้อวัวเลขที่สี่ให้
ผลบวกต่อลิตร monocytogenes โดยวิธีการแบบดั้งเดิม
วัฒนธรรม แต่เป็นลบในวิธี PCR.
การวิเคราะห์ผลที่อาจเป็นไปได้ว่าสายพันธุ์อื่น ๆ Listeria
เช่นลิตรinnocua ซึ่งเป็น nonpathogen และขาด
hlya ยีนนอกจากนี้ยังสามารถเติบโตบนวุ้นอาหาร PALCAM เป็น l
monocytogenes อาณานิคมที่น่าสงสัยของ Listeria ต่อไป
ตรวจพบโดยใช้วิธี PCR ไม่ได้มี hlya
ยีน ดังนั้นผลบวกจากวัฒนธรรม
วิธีการแบบดั้งเดิมควรจะรวมกับวิธี PCR เพื่อ
ระบุลิตร monocytogenes จำนวนตัวอย่างไก่
สองให้ผลบวกสำหรับดวลจุดโทษflexneri โดยวิธี PCR
แต่ผลลบโดยวิธีการเพาะเลี้ยง
230 กิโลไบต์ความรุนแรงที่เกี่ยวข้องการบุกรุกพลาสมิด, ที่จำเป็นสำหรับการ
เข้าสู่เซลล์โฮสต์ที่เกี่ยวข้องกับกลุ่มของยีนที่ปรากฏใน
Shigella และ Enteroinvasive อี coli (eiec) สายพันธุ์ (lan
et al, 2003;.. วู et al, 2004;. Hien et al, 2008) ดังนั้น
ตรวจสอบต่อไปควรจะดำเนินการด้วย
ส่วนที่เกี่ยวกับความรุนแรงที่อาจเกิดขึ้นปัจจัยร่วมที่มีอยู่ในหลายชนิด
.
นำมารวมกันการศึกษานี้รายงาน multiplex PCR
ทดสอบอย่างรวดเร็วโดยใช้ห้าชุดไพรเมอร์สำหรับการตรวจสอบของหลาย
การแปล กรุณารอสักครู่..
