that belong to the nine genera, nam

that belong to the nine genera, namely, Cladosporium, Alternaria,
Trichoderma, Fusarium, Sarocladium, Dendryphiella, Bipolaris,
Phoma, and Penicillium, possessed antibacterial or antifungal
activity against Thanatephorus cucumeris or Xanthomonas oryzae
(Table 4). Although in vitro results do not necessarily reflect the
activities in plants (Rocha et al. 2011), studies could be particularly
useful for identifying candidates for biocontrol, novel metabolites
for exploitation in agriculture or medicine (Hazalin
et al. 2009), and for making predictions on the mechanisms
by which they reduce pathogen damage (Mej
ıa et al. 2008).
Therefore, further investigations in plants are necessary to
confirm the usefulness of endophytic fungi for the biological
control of the two major phytopathogens of O. sativa L.
The endophytic fungi potential for synthesising bioactive
natural products was further proved by detecting PKS genes
(Table 3). PKS produce a vast array of biomedically important
secondary metabolites, such as antibiotic erythromycin, tetracycline,
rifamycin, the immunosuppressant FK506, and antiparasitic
avermectin derivatives (Piel et al. 2004a, 2004b). PKS
have three types, namely, type I, type II, and type III. Type I
PKS, also known as modular PKS, is a multifunctional protein
complex that consists of a series of modules; almost all characterised
fungal PKS belong to type I (Nicholson et al. 2001; Piel
et al. 2004a, 2004b; Amnuaykanjanasin et al. 2005). In this
study, nine PKS fragments were detected, and all belong to
type I. The endophytic fungi of O. rufipogon G. had a wide array
of PKS, indicating their potential in the biosynthesis of different
PKS compounds, such as the strains DX-FOL1 and DXFOL6,
which both have a lovastatin diketide synthase. PKS
genes were detected in the fungal strains with antimicrobial
activity (Table 4). For examples, the strains DX-FOF2, DXFOF4,
DX-FOL1, DX-FOR3, DX-FOS5, and DX-FOS3 had antimicrobial
activity and PKS genes. The strains DX-FOF5, DX-FOF7,
DX-FOF6, DX-FOS4, DX-FOR5, and DX-FOS2 had no PKS genes,
but showed antimicrobial activity, which could result to the
production of other antimicrobial secondary metabolites.
Meanwhile, some strains, such as DX-FOF1, DX-FOL7, and
DX-FOL6, with detected PKS genes, exhibited no antimicrobial
activity, which could produce other compounds with potential
bioactivity. BLAST analysis showed that the KS sequences
of the isolates had low sequence similarity to the closest relative
in the database (Table 3). This result may be attributed to
the fact that the present molecular database is not sufficiently
large to contain all fungal PKS gene sequence information.
Moreover, endophytic fungi could likely produce abundant
novel compounds.
A putative instance of horizontal gene transfer involves
adjacent, discrete KS, acy1 carrier protein, and NRPS domains
of the epothilone. Schmitt & Lumbsch (2009) found
an ancient horizontal transfer of PKS gene from an actinobacterial
source into ascomycete fungi. Zhou et al. (2011)
also found a transfer between 18S rDNA and KS domain sequences,
and a lateral gene transfer event was indicated.
The KS domain sequences in this study were analysed
with BLASTX. The definition of ITS rDNA does not coincide
with the analysis of KS domain sequences in the NCBI database.
For example, the strain DX-FOL1 is defined as a Penicillium
member by ITS rDNA, but one KS domain sequence of
the strain Gaeumannomyces amomi has been detected in the
strain DX-FOL1. Thus, the proposed mechanism of horizontal
gene transfer in the evolution of biosyn

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป็นสมาชิกของสกุลเก้า ได้แก่ Cladosporium, AlternariaTrichoderma, Fusarium, Sarocladium, Dendryphiella, BipolarisPhoma และ Penicillium ยาปฏิชีวนะมอบหรือต้านเชื้อรากิจกรรม Thanatephorus cucumeris หรืออ้อยแห้งระดับต่าง ๆ(ตาราง 4) แม้ว่าผลการเพาะเลี้ยงไม่จำเป็นต้องสะท้อนให้เห็นถึงการกิจกรรมพืช (Rocha et al. 2011), การศึกษาเป็นอย่างยิ่งมีประโยชน์สำหรับการระบุสำหรับ biocontrol นวนิยาย metabolitesการแสวงหาประโยชน์ในการเกษตรหรือการแพทย์ (Hazalinร้อยเอ็ด al. 2009), และการคาดคะเนในกลไกซึ่งจะลดความเสียหายของการศึกษา (Mej ıa et al. 2008)ดังนั้น เพิ่มเติมตรวจสอบในพืชจำเป็นในการยืนยันประโยชน์ของเชื้อรา endophytic สำหรับทางชีวภาพควบคุม phytopathogens หลักสองของโอซา L.เชื้อรา endophytic อาจ synthesising กรรมการกผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติเพิ่มเติมถูกพิสูจน์ โดยการตรวจหายีน PKS(ตาราง 3) PKS ผลิตมากมาย biomedically สำคัญmetabolites รอง เช่นยาปฏิชีวนะ erythromycin เตตราไซคลีนrifamycin, immunosuppressant FK506 และ antiparasiticavermectin อนุพันธ์ (Piel et al. 2004a, 2004b) PKSมีสามชนิด ได้แก่ พิมพ์ พิมพ์ II และชนิด III พิมพ์ฉันPKS หรือที่เรียกว่า modular PKS เป็นโปรตีนโดยความซับซ้อนที่ประกอบด้วยชุดของโมดูล เกือบทุกโรคPKS เชื้อราอยู่ในพิมพ์ฉัน (Nicholson et al. 2001 Pielร้อยเอ็ด al. 2004a, 2004b Amnuaykanjanasin et al. 2005) ในที่นี้การศึกษา ตรวจพบชิ้นส่วน PKS เก้า และทั้งหมดเป็นของพิมพ์ฉัน เชื้อรา endophytic ของโอ rufipogon กรัมมีความหลากหลายของ PKS บ่งชี้ศักยภาพของพวกเขาในการชีวสังเคราะห์ของแตกต่างกันPKS สารประกอบ เช่นสายพันธุ์ DX FOL1 และ DXFOL6ซึ่งทั้งสองมีการ lovastatin diketide synthase PKSยีนพบในสายพันธุ์เชื้อราด้วยจุลินทรีย์กิจกรรม (ตาราง 4) ตัวอย่าง สายพันธุ์ DX-FOF2, DXFOF4DX FOL1, DX FOR3, DX FOS5 และ DX FOS3 มีจุลินทรีย์กิจกรรมและยีน PKS สายพันธุ์ DX FOF5, DX-FOF7DX FOF6, DX FOS4, DX FOR5 และ DX FOS2 มียีนไม่ PKSแสดงแต่จุลินทรีย์กิจกรรม ซึ่งอาจทำให้การผลิตของ metabolites รองจุลินทรีย์อื่น ๆในขณะเดียวกัน บางสายพันธุ์ เช่น DX-FOF1, DX-FOL7 และDX-FOL6 มีการตรวจพบยีน PKS จัดแสดงไม่มีจุลินทรีย์กิจกรรม ซึ่งสามารถผลิตสารอื่น ๆ ที่ มีศักยภาพทางชีวภาพ วิเคราะห์ระเบิดพบว่า ลำดับที่ KSของการแยกมีลำดับต่ำคล้ายกับญาติใกล้ชิดในฐานข้อมูล (ตาราง 3) ผลนี้อาจเกิดจากความจริงที่ว่าต่อโมเลกุลที่อยู่ไม่เพียงพอขนาดใหญ่ประกอบด้วยทั้งหมดเชื้อรา PKS ยีนลำดับข้อมูลนอกจากนี้ endophytic เชื้อราอาจมีแนวโน้มผลิตอุดมสมบูรณ์นวนิยายสารเกี่ยวข้องกับอินสแตนซ์ putative ถ่ายโอนยีนแนวนอนKS ติดกัน แยกกัน โปรตีนขนส่ง acy1 และโดเมน NRPSของ epothilone Schmitt & Lumbsch (2009) พบการโบราณแนวโอน PKS ยีนจากการ actinobacterialแหล่งที่มาเป็นเชื้อรา ascomycete Al. ร้อยเอ็ดโจว (2011)นอกจากนี้ยัง พบการโอนย้ายระหว่าง 18S rDNA และ KS โดเมนลำดับและมีระบุเหตุการณ์การถ่ายโอนยีนด้านข้างลำดับโดเอสในการศึกษานี้ได้ analysedกับ BLASTX คำจำกัดความของ rDNA ไม่ทับกันด้วยการวิเคราะห์ของเอสโดเมนลำดับในฐานข้อมูล NCBIตัวอย่าง กำหนดพันธุ์ DX FOL1 เป็น Penicilliumสมาชิก โดย rDNA ของ แต่หนึ่งเอสโดเมนลำดับสายพันธุ์ Gaeumannomyces amomi พบในการสายพันธุ์ DX FOL1 ดังนั้น เสนอกลไกของแนวนอนการถ่ายโอนยีนในวิวัฒนาการของ biosyn

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่อยู่ในเก้าจำพวกคือ Cladosporium, Alternaria,
เชื้อรา Trichoderma, Fusarium, Sarocladium, Dendryphiella, Bipolaris,
Phoma และ Penicillium
ครอบครองต้านเชื้อแบคทีเรียเชื้อราหรือกิจกรรมกับThanatephorus cucumeris หรือ Xanthomonas oryzae
(ตารางที่ 4) แม้ว่าในผลการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อไม่จำเป็นต้องสะท้อนให้เห็นถึงกิจกรรมในพืช (Rocha et al. 2011) การศึกษาอาจจะเป็นโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่มีประโยชน์สำหรับการระบุผู้สมัครสำหรับการควบคุมทางชีวภาพ, สารนวนิยายสำหรับการใช้ประโยชน์ในการเกษตรหรือยา (Hazalin et al. 2009) และสำหรับการทำ การคาดการณ์เกี่ยวกับกลไกโดยที่พวกเขาลดความเสียหายเชื้อโรค(Mej? IA et al. 2008). ดังนั้นการสืบสวนต่อไปในพืชมีความจำเป็นเพื่อยืนยันประโยชน์ของเชื้อราเอนโดไฟท์สำหรับทางชีวภาพการควบคุมของทั้งสองphytopathogens สำคัญของ sativa L. ทุมที่มีศักยภาพสำหรับเชื้อราเอนโดไฟท์ synthesising ออกฤทธิ์ทางชีวภาพผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่ได้รับการพิสูจน์ต่อไปได้โดยการตรวจสอบยีนPKS (ตารางที่ 3) PKS ผลิตมากมายของสำคัญ biomedically สารทุติยภูมิเช่น erythromycin ยาปฏิชีวนะ tetracycline, rifamycin ที่ immunosuppressant FK506 และ antiparasitic อนุพันธ์ avermectin (Piel et al. 2004a, 2004b) PKS มีสามประเภทคือประเภท I, ชนิดที่สองและประเภทที่สาม พิมพ์ฉันPKS ยังเป็นที่รู้จัก PKS แบบแยกส่วนเป็นโปรตีนมัลติฟังก์ชั่ที่ซับซ้อนที่ประกอบด้วยชุดของโมดูล; เกือบทุกลักษณะPKS เชื้อราเป็นของฉันพิมพ์ (นิโคลสัน et al, 2001;. Piel et al, 2004a, 2004b.. Amnuaykanjanasin et al, 2005) ในการนี้การศึกษาเก้าเศษ PKS ถูกตรวจพบและสิ่งที่อยู่ในการพิมพ์ครั้งที่หนึ่งเชื้อราเอนโดไฟท์ของO. rufipogon กรัมมีความหลากหลายของPKS แสดงให้เห็นศักยภาพของพวกเขาในการสังเคราะห์ที่แตกต่างกันของสารPKS เช่นสายพันธุ์ DX- FOL1 และ DXFOL6, ซึ่งทั้งสองมีเทส diketide lovastatin PKS ยีนถูกตรวจพบในสายพันธุ์ของเชื้อราที่มียาต้านจุลชีพกิจกรรม (ตารางที่ 4) สำหรับตัวอย่างสายพันธุ์ DX-FOF2, DXFOF4, DX-FOL1 DX-FOR3 DX-FOS5 และ DX-FOS3 มียาต้านจุลชีพกิจกรรมและยีนPKS สายพันธุ์ DX-FOF5 DX-FOF7, DX-FOF6 DX-FOS4 DX-FOR5 และ DX-FOS2 ไม่มียีน PKS, แต่มีฤทธิ์ต้านจุลชีพซึ่งอาจส่งผลกับการผลิตสารทุติยภูมิต้านจุลชีพอื่น ๆ . ในขณะเดียวกัน บางสายพันธุ์เช่น DX-FOF1 DX-FOL7 และDX-FOL6 มีการตรวจพบยีน PKS, แสดงไม่มียาต้านจุลชีพกิจกรรมซึ่งสามารถผลิตสารอื่นๆ ที่มีศักยภาพทางชีวภาพ การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าระเบิดลำดับ KS ของเชื้อมีความคล้ายคลึงกันลำดับต่ำถึงญาติสนิทในฐานข้อมูล (ตารางที่ 3) ผลที่ได้นี้อาจนำมาประกอบกับความจริงที่ว่าฐานข้อมูลของโมเลกุลในปัจจุบันไม่เพียงพอขนาดใหญ่ที่จะมีข้อมูลลำดับยีนPKS เชื้อราทั้งหมด. นอกจากนี้เชื้อราเอนโดไฟท์มีแนวโน้มที่อาจจะก่อให้อุดมสมบูรณ์สารประกอบนวนิยาย. อินสแตนซ์สมมุติของการถ่ายโอนยีนแนวนอนที่เกี่ยวข้องกับที่อยู่ติดกันโดยสิ้นเชิง KS, เพชรรัตน์ acy1 และโดเมน NRPS ของ epothilone มิตและ Lumbsch (2009) พบโอนแนวโบราณของยีนPKS จาก actinobacterial แหล่งเชื้อราเข้า ascomycete โจวเอตอัล (2011) นอกจากนี้ยังพบการถ่ายโอนระหว่าง 18S rDNA และ KS ลำดับโดเมนและเหตุการณ์การถ่ายโอนยีนข้างถูกระบุ. ลำดับโดเมน KS ในการศึกษานี้ถูกนำมาวิเคราะห์กับBLASTX ความหมายของ ITS rDNA ไม่ตรงกับการวิเคราะห์ของKS ลำดับโดเมนในฐานข้อมูล NCBI ได้. ตัวอย่างเช่นความเครียด DX-FOL1 จะถูกกำหนดให้เป็น Penicillium สมาชิกโดย ITS rDNA แต่ KS ลำดับโดเมนของสายพันธุ์Gaeumannomyces amomi ที่ได้รับ ตรวจพบในสายพันธุ์DX-FOL1 ดังนั้นกลไกการเสนอแนวการถ่ายโอนยีนในการวิวัฒนาการของ BioSyn

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่เป็นของ 9 สกุล ได้แก่ พฤติกรรม =
, เชื้อรา , Fusarium , sarocladium dendryphiella bipolaris
, , , โฟมาและ Penicillium มีแบคทีเรียหรือเชื้อรา
กิจกรรมกับ thanatephorus ในลุ่มแม่น้ำท่าจีนหรือ Xanthomonas oryzae
( ตารางที่ 4 ) แม้ว่าในหลอดทดลองผลลัพธ์ไม่จําเป็นต้องสะท้อน
กิจกรรมในพืช ( Rocha et al . 2554 , การศึกษาอาจจะโดยเฉพาะอย่างยิ่ง
ที่มีประโยชน์สำหรับการระบุผู้สมัครสำหรับไบโอคอนโทรล
สารใหม่ , ประโยชน์ในการเกษตรหรือยา ( hazalin
et al . 2009 ) , และทำให้การคาดการณ์เกี่ยวกับกลไก
ที่พวกเขาลดเชื้อโรคความเสียหาย ( mej
ıเป็น et al . 2008 ) .
ดังนั้นการสอบสวนเพิ่มเติมในพืชเป็น
ยืนยันประโยชน์ของราเอนโดไฟต์ที่แยกสำหรับชีวภาพ
การควบคุมสอง phytopathogens หลักของ O . sativa L .
ราเอนโดไฟต์ที่มีศักยภาพสำหรับสังเคราะห์ทางชีวภาพ
ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติเพิ่มเติมพิสูจน์โดยการตรวจหายีน pks
( ตารางที่ 3 ) pks ผลิตอาร์เรย์ของ biomedically สำคัญ
สารทุติยภูมิ เช่น ยาปฏิชีวนะ erythromycin , tetracycline
ไรฟาไมซิน , fk506 immunosuppressant และ antiparasitic
avermectin อนุพันธ์ ( พิล et al .2004a 2004b , ) pks
มี 3 ประเภท ได้แก่ ประเภท ประเภท ประเภท ประเภท II และ III ผม
pks เรียกว่าโมดูล pks เป็นผลิตภัณฑ์โปรตีน
ซับซ้อนที่ประกอบด้วยชุดของโมดูล ; เกือบทุกลักษณะ
รา pks เป็นของประเภท ( นิโคลสัน et al . 2001 ; พิล
et al . 2004a 2004b ; amnuaykanjanasin , et al . 2005 ) ในการศึกษา
9 pks ชิ้นส่วนถูกตรวจพบและทั้งหมดเป็นของ
ประเภท .เชื้อราเอนโดไฟท์ของ O rufipogon กรัมมี
หลากหลาย pks แสดงศักยภาพของตนในการสังเคราะห์สารประกอบ
pks แตกต่างกัน เช่น สายพันธุ์ และ dxfol6
dx-fol1 , ซึ่งทั้งสองมีโลวาสแททิน diketide เทส . pks
ยีนที่ตรวจพบในสายพันธุ์ของเชื้อราที่มีฤทธิ์ต้านจุลชีพ
( ตารางที่ 4 ) สำหรับตัวอย่าง , สายพันธุ์ dx-fof2 dxfof4
, , dx-fol1 dx-for3 dx-fos5 , , ,และมีฤทธิ์ต้านจุลชีพ และ dx-fos3
pks ยีน สายพันธุ์ dx-fof5 dx-fof7 dx-fof6 dx-fos4
, , , , dx-for5 และ dx-fos2 ไม่มี pks ยีน ,
แต่แสดงฤทธิ์ต้านจุลชีพ ซึ่งอาจส่งผลต่อการผลิตสาร secondary metabolites ของยาต้านจุลชีพอื่น ๆ
.
ในขณะที่บางสายพันธุ์ เช่น dx-fof1 dx-fol7 , ,
dx-fol6 กับตรวจพบยีนต้าน
pks มีไม่ กิจกรรมที่สามารถผลิตสารอื่น ๆที่มีศักยภาพ
ฤทธิ์ . การวิเคราะห์ระเบิดพบว่าลำดับของสายพันธุ์ KS
มีความคล้ายคลึงกับลำดับต่ำใกล้ญาติ
ในฐานข้อมูล ( ตารางที่ 3 ) ผลที่ได้นี้อาจจะเกิดจากการที่ฐานข้อมูลโมเลกุล

ปัจจุบันไม่เพียงพอขนาดใหญ่ประกอบด้วยเชื้อรา pks ยีน ลำดับข้อมูล .
นอกจากนี้ราเอนโดไฟต์ที่สามารถส่งผลผลิตมากมาย

เป็นนวนิยายสารประกอบ เช่นการแสดงออกของการถ่ายทอดยีนในแนวราบกับ
ติดกัน KS ไม่ต่อเนื่อง acy1 พาหะโปรตีน และ nrps โดเมน
ของ epothilone . ชมิตต์& lumbsch ( 2009 ) พบ
โบราณแนวนอนโอน pks ยีนจากแหล่ง actinobacterial
เป็น ascomycete เชื้อรา โจว et al . ( 2011 )
นอกจากนี้ยังพบการถ่ายโอนระหว่าง 18S rDNA และ KS โดเมนลำดับ
และเหตุการณ์การถ่ายโอนยีนด้านข้างถูกระบุ .
KS โดเมนลำดับในการศึกษาวิเคราะห์
กับ blastx . นิยามของ rDNA ไม่ตรงกัน
กับการวิเคราะห์ของ KS โดเมนลำดับใน ncbi ฐานข้อมูล .
ตัวอย่างเช่น เมื่อย dx-fol1 หมายถึง Penicillium
สมาชิกโดย rDNA แต่ KS โดเมนลำดับ
สายพันธุ์ gaeumannomyces amomi ได้รับการตรวจพบในสายพันธุ์ dx-fol1
. ดังนั้น จึงได้เสนอกลไกการถ่ายทอดยีนในแนวราบ
ในวิวัฒนาการของ biosyn